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基于深度学习的蛋白质线粒体定位研究
由于线粒体蛋白在不同的区域内具有不同的生理活性,故线粒体蛋白的非正常定位将触发人类线粒体病理的发病机制。显然,一旦可以准确的鉴定蛋白质线粒体的定位,那我们将能够为疾病发病机制和药物设计带来发展性的帮助。线粒体中包括四种...
朱婷
关键词:数据驱动
基于序列编码的蛋白质线粒体定位预测方法研究
线粒体是生物细胞中重要的双膜细胞器,参与着细胞生命活动。线粒体包含四种结构,每种结构中的蛋白质都发挥着各自的生物功能。确定蛋白质的线粒体定位,有助于深入研究线粒体中蛋白质的功能,为药物设计和癌症研究提供信息。得益于计算...
边浩东
基于机器学习和序列信息的蛋白质线粒体定位预测算法研究
蛋白质细胞定位预测是蛋白质组学研究中的一个热门主题。随着研究的深入,越来越多的细胞器都被证明存在结构,蛋白质的功能可能与它们在-细胞结构水平上的定位有关。在-细胞定位问题上,线粒体一直是研究者关注的热点。确定...
金银萍
基于机器学习的蛋白质线粒体定位预测研究
在大数据时代,蛋白质数据库中序列数据的指数增长蕴含着非常重要的生物学信息。如何使用机器学习精准预测蛋白质线粒体的位置已成为生物信息学以及蛋白质组学研究中一项具有挑战性的任务。而且,线粒体位置的研究对了解蛋白质的结构和...
邱文莹
关键词:蛋白质数据库信息融合支持向量机
文献传递
蛋白质线粒体定位预测及其算法
2018年
蛋白质线粒体定位预测是生命科学领域中蛋白质组学研究的重要内容,也是当前研究的热点,获得蛋白质的线粒体定位位置信息对进一步了解线粒体蛋白质的功能是非常必要的,急需更优秀的预测方法结合其他机器学习方法的基础上,提出更加合理的蛋白质线粒体定位理论预测算法。
关键词:蛋白质组学亚线粒体线粒体蛋白质机器学习方法生命科学位置信息
使用蛋白质和mRNA序列信息预测蛋白质线粒体定位
线粒体是很重要的半自主性细胞器,主要为细胞提供能量,还承担了许多其他生理功能,而线粒体的某些功能只有在特定线粒体位置中才能实现。研究线粒体定位能帮助我们充分了解蛋白质的功能。本文建立了包含mRNA序列信息的线粒体蛋...
刘娟娟
关键词:亚线粒体支持向量机
文献传递
使用蛋白质和mRNA序列信息预测蛋白质线粒体定位
2017年
线粒体是很重要的半自主性细胞器,主要为细胞提供能量,还承担了许多其他生理功能,而线粒体的某些功能只有在特定线粒体位置中才能实现.对线粒体定位的研究有助于进一步了解蛋白质的功能.文章计算了蛋白质的进化信息、同源序列的go信息、氨基酸指数信息、氨基酸粘性、氨基酸组分、平均化学位移,并结合mRNA序列的三联体频数,利用支持向量机算法和离散增量算法对蛋白质线粒体定位进行预测,在jackknife检验下准确率达到97.64%,同时用独立检验也取得较好的结果.
刘娟娟李前忠闫振河薛济先
基于Blast-GO的蛋白质线粒体定位预测
2015年
本文建立了一个最新的蛋白质线粒体定位数据集,包含4个线粒体定位的1 293条序列,结合基因本体(GO)信息和同源信息对线粒体蛋白质进行特征提取,利用支持向量机算法建立分类器,经Jackknife检验,对于4个线粒体位置的总体预测准确率为93.27%,其中3个线粒体位置的总体预测准确率为94.73%.
曩毅梅含雪赵燕侯宝妍赵志远樊国梁
关键词:基因本体支持向量机
蛋白质叶绿体和线粒体定位预测研究进展
2014年
蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能,因此蛋白质的功能与其细胞定位有着密切的联系,通过确定蛋白质在细胞中的位置可以获取蛋白质功能和结构的信息。在近二十年中,蛋白质细胞定位预测算法研究已经取得很大的成绩,在此基础上,蛋白质在细胞器内结构的定位预测研究,如对蛋白质线粒体叶绿体定位的研究成为更深层次的问题,本文简要介绍国内外在蛋白质叶绿体和线粒体定位预测方面的研究进展。
王星支李凤敏王晓茜
关键词:亚线粒体
基于多类特征融合的蛋白质线粒体定位预测研究
随着人类基因组计划的顺利进行,数据库中出现了大量的未知功能的蛋白质序列,分析这些未知功能的蛋白质成为当今的首要任务。目前,细胞定位作为分析蛋白质功能的手段达到了一定水平,人们开始关注细胞器定位研究,由于实验分析耗时、...
樊国梁
关键词:化学位移支持向量机蛋白质相互作用
文献传递

相关作者

左永春
作品数:47被引量:24H指数:2
供职机构:内蒙古大学
研究主题:结构特征 启动子 DNA 哺乳动物 神经毒素
樊国梁
作品数:43被引量:90H指数:6
供职机构:内蒙古大学物理科学与技术学院
研究主题:调制不稳定性 双折射 支持向量机 教学改革 阶跃光纤
朱杰
作品数:77被引量:578H指数:13
供职机构:西北农林科技大学
研究主题:原子力显微镜 超微结构 大学物理 生物类专业 生物力学
张过江
作品数:11被引量:13H指数:2
供职机构:中国科学院生物物理研究所
研究主题:溶酶体 ESR研究 PP ESR 膜电位
刘晓宏
作品数:69被引量:372H指数:10
供职机构:第三军医大学
研究主题:烧伤 糖皮质激素受体 放烧复合伤 基因表达 小鼠