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一种基于全卷积注意力机制神经网络的硒肽从头测序方法: 本发明提供了一种基于全卷积注意力机制神经网络的硒肽从头测序方法，属于含硒天然多肽鉴定检测领域，以所有硒肽中每个特征片段对应的具体硒代氨基酸为起始氨基酸，之后依次预测N/C端方向下一个的符号，以最高概率的符号为对应位置的符...; 贾玮张荣武希璇

人恶性胸膜间皮瘤DNA从头测序及基因突变分析: 2024年; 通过DNA从头测序分析人胸膜间皮瘤发生的高关联度突变基因。提取恶性胸膜间皮瘤(MPM)组织和正常胸膜组织DNA,构建基因文库,用Illumina HiSeqX Ten PE 150平台测序,将测序结果与人类基因组数据库的参考序列进行比对、注释,并对测序结果进行过滤、错误率分布检查、GC含量分布检查分析。MPM组织DNA平均过滤37829946 bp,错误率小于0.12%,GC含量占41.17%,而正常胸膜组织DNA平均过滤39089681 bp,错误率小于0.1%,GC含量占41.7%,两者测序质量均在Q 30(≥80%)以上,MPM为87.43%,正常胸膜为88.36%。以上高质量测序数据通过BWA比对到参考基因组(GRCh 37/hg 19),得到最初比对序列,利用重复标记后的比对序列进行覆盖度、深度等统计,覆盖深度达到10 X以上该突变位点可信。结果显示,实验病例XL14覆盖深度达到10 X的占98.59%,覆盖率达到99.83%;对照病例Z5占98.50%,覆盖率达到99.79%。对该序列进行基因注释分析,发现一系列单核苷酸多态性、基因插入缺失、基因结构变异、基因拷贝数变异,筛选出总变异位点数29277个,可能致病的变异位点数22个,致病性的变异位点数5个,不确定变异有害性的位点数为3353个,其余变异位点均为良性。进一步对突变基因进行富集、关联性分析,预测出突变基因TXNDC2与人胸膜间皮瘤的发生高度相关,相关系数达到0.8以上;突变基因PIEN、ABCC1、UGT1A7、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A9、ALDH3B1、UGT1A5等与人胸膜间皮瘤有一定关联性,关联度在0~0.2之间。基因TXNDC2、PIEN、ABCC1、UGT1A7、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A9、ALDH3B1、UGT1A5的变异可能与人胸膜间皮瘤的发生发展有关。本实验为人胸膜间皮瘤分子诊断提供了参考。; 邱璐王播勇田梦丽高顺玉熊海波熊伟; 关键词：从头测序单核苷酸多态性

一种单克隆抗体从头测序的方法及其应用: 本发明提供了一种单克隆抗体从头测序的方法及其应用，所述方法包括：(1)将单克隆抗体样本依次经过变性还原和烷基化得到烷基化反应溶液，将所述烷基化反应溶液平均分成5份，分别加入胰蛋白酶、糜蛋白酶、胃蛋白酶、弹性蛋白酶和Glu...; 林骏纪元刘尧李玉萍何先萍胡告邓伏雨杨娟梁永羿冼嘉华吴洪波张玄妮王振宇朱小林古慧贤

一种可用于蛋白质从头测序的肽段两末端等重同位素标记方法: 本发明公开了一种可用于蛋白质从头测序的肽段两末端等重同位素标记方法，可用于肽段、蛋白质的从头测序。在方法中，将待测序肽段分为两部分，一部分首先进行肽段C端的<Sup>18</Sup>O置换，随后这部分肽段使用轻标的N端乙...; 秦伟捷陈永乐

通过位置选择性二甲基化进行蛋白质N-末端从头测序: 本发明总体上涉及测定蛋白质的氨基酸序列的方法。具体地，本发明涉及使用位置选择性二甲基化和液相色谱‑质谱来增强N‑末端肽的信号并使N‑末端肽和相应的b离子的信号发生偏移，从而促进N‑末端肽序列的测定。; 冯煜王顺海

一种多肽质谱数据从头测序结果假阳性率评估方法及系统: 本发明涉及生物信息分析技术领域，具体涉及一种多肽质谱数据从头测序结果假阳性率评估方法及系统。本发明针对多肽质谱数据在无蛋白或多肽序列库参考的情况下进行从头测序的数据解析无法进行假阳性率评估与控制的问题，提出了一种多肽质谱...; 孙泽宇宋健张敏敏

一种基于子离子类型可辨识且子离子全覆盖的直读型蛋白质和蛋白质组精准从头测序方法: 本发明提出了一项基于成对镜像酶消化肽段氨基酸编码技术的子离子类型可辨子离子全覆盖原理的蛋白质和蛋白质组氨基酸序列直接读取型精准从头测序技术。公开了一种基于赖氨酸(K)和精氨酸(R)质量亏损氨基酸编码(NeuCode)双标...; 徐平康荔李衍常戴嘉兴张瑶姜松昊常蕾

基于图网络的肽段从头测序方法研究: 使用串联质谱分析蛋白质样品数据是蛋白质组学的主要技术。蛋白质、肽段序列鉴定方法主要有:数据库搜索、从头测序、谱库搜索等。从头测序方法不同于其他两类方法,不需要蛋白质数据库和谱图库信息,可以直接从串联质谱中推断出肽段序列,...; 吴瑞涛

一种基于从头测序和同源标签图论的抗体序列鉴定方法: 本发明涉及一种基于从头测序和同源标签图论的抗体序列鉴定方法，属于生物分析技术领域。所述方法首先对待鉴定抗体进行切割，得到的肽段溶液进行液相‑质谱分析；然后通过检索确定轻链、重链恒定区肽段序列，并通过从头测序确定可变区候选...; 张永谦王旭李诺敏

黑芥、白芥与野芥基因组从头测序、组装及系统基因组学研究: 白芥属（Sinapis）,隶属于十字花科（Brassicaceae）芸薹族（Brassiceae）,与芸薹属（Brassica）具有十分近缘的进化关系,其中白芥（S.alba,2n=24）和野芥（S.arvensis,2...; 杨太桦; 关键词：白芥黑芥

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