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蒙古牛生长、肉品质性状和血清生化指标基因组扫描及其拷贝数变异图谱构建
蒙古牛原产于蒙古高原地区,是当地牧民不可缺少的乳、肉之源,且役用能力大、持久力强,能吃苦耐劳的优良品种。锡林郭勒草原属温带大陆性气候,风大、干旱和寒冷是其主要气候特点。锡林郭勒盟年均气温3.4℃,寒冷期长达7个月,1月份...
张剑
关键词:蒙古牛基因芯片拷贝数变异
基因组扫描定位一个先天性白内障家系的致病基因被引量:2
2020年
目的定位一个先天性白内障家系的致病基因。方法收集一个先天性白内障家系中10个成员的外周血样本,提取基因组DNA。应用ABI-MD10试剂盒中的常染色体382个微卫星位点,对此家系进行基因组扫描。MLINK软件进行两点连锁分析。结果发现在D13S263位点处提示存在连锁(最大LOD=1.20,重率θ=0),进一步检测该位点附近若干其它的微卫星标记,经连锁分析其致病基因被定位到D13S175和D13S156之间的大约53.9厘摩(cM)区域上。结论该家系致病基因位点被定位到13号染色体的13q12.11-q22.1之间的大约53.9cM区域上。此研究为探讨遗传性白内障的发病机制提供了有价值的信息,并为该家系今后开展产前诊断奠定了基础。
赫红丹王丽齐艳华
关键词:全基因组扫描
1株三型丁香假单胞菌猕猴桃致病变种细菌基因组扫描图测序及分析被引量:2
2020年
丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,简称Psa)是引起猕猴桃细菌性溃疡病的病原菌。对从感染溃疡病的东红猕猴桃枝条中分离得到的1株Psa野生株(命名为GX05)进行基因组测序,获得基因组草图,分析其中毒力基因、耐药基因和致病基因的情况。研究发现,多位点序列分型结果显示GX05为biovar 3,与毒力因子数据库比对,GX05携带99种毒力因子及692个相关毒力基因,同源性和匹配度最高的毒力因子是PvdL和Irp1;与综合抗生素抗性基因数据库比对,GX05携带336种耐药基因,与29种抗生素有关;与病原宿主互作数据库比对,不表达导致病原菌致病力减弱的基因数量最多,其中同源性和匹配度最高的是PvdL,此外与增强致病力相关的同源性和匹配度最高的基因是hrcC。通过基因组测序信息初步分析了1株三型Psa菌株中存在的毒力、耐药及致病基因情况,对深入研究其致病机制和合理用药有重要意义。
邓博涵刘丹蕾陈秋菊倪培恩张子蕾王大鹏纠松涛王磊马超张才喜王世平沈叶鑫鲍金平许文平
关键词:猕猴桃细菌性溃疡病全基因组测序毒力基因耐药基因致病基因
木本高山花卉马缨杜鹃的基因组扫描分析被引量:10
2018年
本研究采用高通量测序技术(Illumina Hiseq ^(TM)2000)首次对世界名贵园林花卉马缨杜鹃(Rhododendron delavayi)进行了基因组大小的测定,并评估了马缨杜鹃的GC含量、杂合率和序列重复度等信息参数,为马缨杜鹃基因组测序策略的选择提供了有据参考。基因组扫描结果如下:马缨杜鹃的基因组大小约为698 Mb,杂合率较高约为1.25%,GC含量约为39%,且具有一定的基因组序列重复度。研究表明:马缨杜鹃的基因组测序分析不宜采用基因组鸟枪法(WGS),可尝试WGS与fosmid或BAC-to-BAC相结合的测序策略,亦或采用杂合装软件进行序列拼装,以提高基因组序列的拼装质量。
张露李世峰李世峰解玮佳宋杰李树发解玮佳
关键词:马缨杜鹃基因组大小GC含量
七个巴基斯坦本地山羊品种的基因组扫描及藏山羊的高海拔适应性候选基因分析
山羊在不同气候条件下地区均有分布,从热带、亚热带到高山地区国家。在这些干旱、潮湿、寒冷地区,山羊经过选择仍然具有肉用、奶用、产绒和羊皮等经济价值。因此,这些山羊品种在形态特征和生产性能上的广泛多样性具有极大的选择和遗传改...
Kumar Chandar
关键词:SNPS
文献传递
基因组扫描筛选鉴别同卵双生子的DNA甲基化遗传标记
目的:同卵双生个体(monozygotic twin,MZT)的鉴别在法医DNA分型领域仍是一个未解难题,当一些案件确定MZT为犯罪嫌疑人或被控父时,尚无科学可行的DNA检验手段将其有效甄别,不能为案件的侦破提供有价值的...
杜情情
关键词:同卵双生子DNA甲基化全基因组扫描
文献传递
基因组扫描筛选德保矮马矮小性状相关候选基因
<正>引言德保矮马是世界矮马品种中较为古老的矮马资源,是我国西南地区狭窄的山路上托运货物而选育出来的矮马品种之一。它的矮小体型是长期驯化过程中人工选择和自然环境的结果。对德保矮马而言,矮小体型是优势性状,因此对德保矮马的...
阿地力江卡德尔董坤哲刘雪雪何晓红蒋琳马月辉
基因组扫描筛选德保矮马矮小性状相关候选基因研究
德保矮马分布于我国南方广西山区的体型显著矮小的马品种,是世界矮马品种里比较古老的矮马资源之一。它的矮小体型是长期驯化过程中人类的定向培育和适应自然环境的结果。对德保矮马来说,矮小体型是适应山路托运的优势性状,因此对德保...
阿地力江·卡德尔
文献传递
山东省孤独症基因组扫描研究被引量:1
2014年
目的通过基因组扫描和关联分析,查找与孤独症相关联的遗传位点。方法选择美国应用生物系统公司(ABI)的Linkage Mapping Set 2.5套装试剂盒,用DNA混合池的方法对孤独症核心家系(患儿与患儿父母)和正常对照者(正常对照)进行基因组扫描;使用CLUMP软件和SPSS 12.0软件对等位基因频率进行比较。结果患儿与正常对照或患儿父母在染色体1、4、7上的1p36.31、4q13.3、4q35.1、7p21.3区域的等位基因频率差异有统计学意义(P<0.01)。结论山东省人群孤独症患者在1p36.31(D1S214)、4q13.3(D4S392)、4q35.1(D4S1535)、7p21.3(D7S513)区域存在关联位点。
杨树林杨帆翟静刘金同张燕陈刚
关键词:孤独症基因组
基因组扫描2型糖尿病KK/Ta小鼠白蛋白尿易感基因定位
2012年
目的利用基因组扫描方法进行2型糖尿病KK/Ta小鼠白蛋白尿易感基因定位。方法以近交纯品系雌性BALB/c小鼠与雄性KK/Ta小鼠交配建立第一代杂交小鼠(F1),以雄性(KK/Ta×BALB/c)F1小鼠与雌性KK/Ta小鼠回交。提取208只雄性回交小鼠基因组DNA。根据扩增的101个微卫星DNA分离片段大小决定回交小鼠基因型,同时测定体质量、血糖、尿白蛋白及尿肌酐等表现型。采用基因定位专用软件(MAPMAKER/QTL,Map manager)进行数量性状位点(QTL)分析。结果 KK/Ta小鼠的体质量、空腹血糖水平、经腹腔葡萄糖耐量试验空腹与注射葡萄糖后2 h血糖之和显著高于BALB/c和F1小鼠(P<0.01)。20,28周龄的KK/Ta小鼠平均尿白蛋白水平显著高于BALB/c和F1小鼠(P<0.01)。20周龄与28周龄的白蛋白尿水平与第2条染色体83.0 cM D2Mit311微卫星DNA标记附近区域显著连锁,最大对数优势积分值(LOD)为3.5,我们将这一易感基因座位命名为尿白蛋白1(UA-1)。KK/KK回交小鼠20周龄和28周龄的尿白蛋白水平显著高于KK/BALB回交小鼠。结论与2型糖尿病KK/Ta小鼠尿白蛋白水平紧密连锁的易感基因座位位于第2条染色体83.0 cM处D2Mit311微卫星DNA标记附近区域(UA-1)。UA-1区域附近的生长激素释放激素基因GHrH、生长抑素受体4基因Smstr4、血栓调节蛋白(TM)基因Thbd等为糖尿病肾病的可能易感基因
范秋灵阎雪晶李艳秋姚丽李子龙张玉侠冯江敏马健飞姜奕富野康日己王力宁
关键词:糖尿病肾病全基因组扫描易感基因定位白蛋白尿

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作品数:109被引量:736H指数:15
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研究主题:医学教育 强直性脊柱炎 教学改革 遗传病 问卷调查
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研究主题:法医学 多态性 DNA STR 法医鉴定