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一种短命植物新疆小拟南芥组织培养方法: 本发明属于植物组织培养方法领域，具体的说，涉及一种短命植物新疆小拟南芥组织培养方法。所述新疆小拟南芥组织培养方法，包括如下步骤：1)新疆小拟南芥种子的消毒，2)消毒后的种子在培养基上点播、培养；3)在步骤2)培养得到的小...; 黄先忠金玉环张亭亭刘丹青

新疆小拟南芥MAPK和MKK基因家族的鉴定及表达特征分析: 促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)级联是真核生物中普遍存在的信号转导模块，在植物的生长发育、激素反应和多种生物及非生物胁迫响应过程中发挥重要作用。十字花科的...; 李晓翠; 关键词：小拟南芥生长发育促分裂原活化蛋白激酶; 文献传递

小拟南芥MKK基因家族全基因组鉴定及进化和表达分析被引量：12: 2020年; 丝裂原活化蛋白激酶激酶(mitogen-activated protein kinase kinase,MAPKK或MKK)是丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activatedproteinkinase,MAPK)级联的重要组成部分,在植物的生长发育和胁迫应答过程中发挥重要作用。目前,已在多种植物中鉴定了MKK基因家族,但在十字花科植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)中MKK基因家族的系统鉴定与分析尚未见报道。为了探索小拟南芥MKK基因家族的进化和功能,本研究通过全基因组分析鉴定了小拟南芥中16个MKK基因,散布于小拟南芥的10条染色体上。基于系统发育分析和多重序列比对,将这些基因分为5个亚族:A亚族(5个)、B亚族(2个)、C亚族(4个)、D亚族(3个)和E亚族(2个)。分子进化和共线性分析表明小拟南芥中存在7对复制基因,分别是ApMKK1-1/1-2、ApMKK2-1/2-2、ApMKK3-1/3-2、ApMKK4-1/4-2、ApMKK5-1/5-2、ApMKK9-1/9-2和ApMKK10-1/10-2,其中ApMKK1-1/1-2在复制事件之后发生了加速进化。结合ApMKKs启动子区的顺式元件分布和ApMKKs在成熟叶片、茎、花和果实以及盐胁迫下的表达模式,结果发现复制基因的表达具有组织特异性和功能多样性。部分复制基因在组织中的表达模式存在差异,但在盐胁迫下的表达模式却基本相同。本研究结果为解析MKK介导的小拟南芥发育过程和非生物胁迫信号转导通路的复杂机制奠定了基础。; 李晓翠康凯程黄先忠黄先忠宋苗苗黄韵杰丁佳佳; 关键词：小拟南芥基因家族盐胁迫

一种短命植物新疆小拟南芥的遗传转化方法: 本发明公开了一种短命植物新疆小拟南芥的遗传转化方法。所述遗传转化方法包括如下步骤：1)采用含有目的基因表达载体的农杆菌侵染液侵染小拟南芥叶柄，将侵染后的小拟南芥叶柄在共生培养基中进行培养，得到共生培养后的叶柄；2)将所述...; 黄先忠金玉环刘丹青郭力

一种短命植物新疆小拟南芥组织培养方法: 本发明属于植物组织培养方法领域，具体的说，涉及一种短命植物新疆小拟南芥组织培养方法。所述新疆小拟南芥组织培养方法，包括如下步骤：1)新疆小拟南芥种子的消毒，2)消毒后的种子在培养基上点播、培养；3)在步骤2)培养得到的小...; 黄先忠金玉环张亭亭刘丹青; 文献传递

小拟南芥激素相关基因及GH3.6的克隆与表达被引量：6: 2019年; 植物激素是植物体内产生的一些微量的、能调节自身生理过程的有机化合物,生长素是一种重要的植物激素,在植物生长发育的过程中起着重要作用。为了探索激素相关基因在短命植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)逆境适应过程中的作用,本研究基于小拟南芥响应高盐胁迫叶片转录组数据库,首先筛选出2156个激素相关基因,包括生长素、脱落酸、乙烯、水杨酸、茉莉酸、油菜素内酯、细胞分裂素及赤霉素相关的基因,其中生长素和脱落酸相关基因所占比例最多并且多为上调表达。进一步通过分层聚类(H-Cluster),K均值聚类(K-means Cluster)和密度聚类(SOM Cluster)分析持续上调的基因,发现一个编码吲哚乙酸酰胺合成酶的基因GRETCHEN HAGEN 3.6(GH3.6)在高盐胁迫过程中明显上调表达。采用RT-PCR克隆小拟南芥Ap GH3.6基因,其开放阅读框长为1839 bp,编码612个氨基酸。系统进化分析表明,Ap GH3.6与山"菜(Eutrema salsugineum)GH3.6进化关系最近,属于同一进化分支。转录组数据分析表明在250 m M Na Cl下,Ap GH3.6持续上调表达;实时荧光定量PCR分析表明Ap GH3.6在小拟南芥各个组织中均有表达,但在花中表达量最高;高盐胁迫表达分析表明,随着胁迫时间增加,Ap GH3.6表达量不断升高。为了进一步研究该基因的功能,构建了植物过量表达载体35S∶Ap GH3.6并转化农杆菌GV3101。本研究为深入分析激素相关基因在小拟南芥响应盐胁迫中的功能机制奠定了基础。; 黄薇孙琦刘芳金玉环罗先梅黄先忠; 关键词：小拟南芥生长素基因表达

小拟南芥转运蛋白基因及NHX2基因的克隆与表达被引量：3: 2019年; 转运蛋白(transport protein)是膜蛋白的一大类,介导生物膜内外的化学物质及信号的交换。植物体内存在多个与Na +转运相关的蛋白,其中液泡膜Na +/H +逆向转运蛋白(Vacuolar Na^+/H^+ antiporter,NHX)在离子稳态和提高植物耐盐性方面发挥着重要作用。为了深入了解转运蛋白基因在短命植物小拟南芥( Arabidopsis pumila)耐盐方面的作用,本研究首先基于小拟南芥响应高盐胁迫叶片转录组数据筛选出1157个转运蛋白基因,按功能分为Na^+转运蛋白,K^+转运蛋白,Ca^2+转运蛋白,ABC转运蛋白以及糖转运蛋白等,其中功能注释为Na +转运蛋白的基因有24个。K均值(K-means)聚类分析结果显示,1157个转运蛋白基因分布于20个K subcluster,其中在K6、K9、K15子聚类中的基因数量分布较多,分别为172、193、190个。在分布于K6子聚类的Na^+转运蛋白基因中,有一个编码NHX2蛋白的基因经盐胁迫处理后明显上调表达。采用RT-PCR克隆了ApNHX 2基因, ApNHX2开放阅读框1626 bp,编码541个氨基酸。ApNHX2蛋白是一个典型的跨膜转运蛋白,具有12个跨膜结构区。系统进化分析表明ApNHX2与拟南芥AtNHX2亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析显示,ApNHX 2基因在小拟南芥各组织中均有表达,但在花中表达量最高。为进一步研究该基因的功能,构建了过量表达载体35S∶ApNHX2并转化农杆菌GV3101。本研究为进一步阐述转运蛋白基因在小拟南芥响应盐胁迫中的功能机制奠定了基础。; 孙琦黄薇刘芳金玉环肖建旺黄先忠; 关键词：小拟南芥 NA^+/H^+逆向转运蛋白基因克隆

短命植物小拟南芥光周期调控基因CONSTANS的克隆与表达特征分析被引量：6: 2019年; 目的光周期是影响植物生长发育的重要因素之一,CONSTANS(CO)是植物光周期开花途径中关键的基因。方法本研究基于短命植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)转录组数据库,获得1条与拟南芥CO基因AtCOL1基因序列高度相似的unigene,通过RT-PCR方法从小拟南芥中克隆了该CO同源基因,命名为ApCOL1;进行了基因的生物信息学分析及节律表达、组织表达和响应非生物胁迫的表达特征分析。结果研究结果表明ApCOL1具有两个B-box和一个CCT结构域,氨基酸序列上与AtCOL1相似性高达86.8%。系统进化分析表明ApCOL1与AtCOL1和琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)的AlCOL1亲缘关系较近,且属于第I亚组成员。qRT-PCR实验表明在长日照和短日照条件下ApCOL1具有相似的昼夜节律表达特征;ApCOL1在小拟南芥各组织中均有表达,但在果荚中表达量最高。250mmol/LNaCl胁迫和20%PEG-6000模拟干旱胁迫12h明显抑制ApCOL1基因的表达,并且随着胁迫时间的延长ApCOL1表达水平没有显著差异。在高温(40℃)胁迫下,ApCOL1基因的表达在24h内先下降后上升并达到最高,48h又下降到对照水平。低温(4℃)胁迫24h之前,ApCOL1基因的表达没有明显变化,但处理48h表达水平显著下降。结论本研究表明ApCOL1基因能够响应盐、干旱、高温和低温等非生物胁迫,暗示该基因在小拟南芥抵抗逆境胁迫中起着重要作用。; 刘芳肖衡金玉环孙琦黄薇康凯程黄先忠; 关键词：小拟南芥生物节律非生物胁迫

短命植物新疆小拟南芥高盐胁迫处理下内参基因的筛选被引量：2: 2018年; 新疆小拟南芥(Arabidopsis pumila)是早春短命植物,广泛分布于新疆极端环境,是研究生物和环境适应机制较好的模式材料.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是一种常用的可以快速获取基因表达的分析方法,而选择合适的内参基因是实时荧光定量PCR的前提.本研究从小拟南芥全长转录组数据库中选取了14个候选内参基因,利用qRT-PCR分析内参基因在250 mmol/L NaCl胁迫处理0、3、6、12、24和48 h共6个不同时间点样品中的基因表达,利用geNorm、Norm Finder和Bestkeeper三种软件进行数据分析.结果显示:在250 mmol/L NaCl胁迫处理下,较为稳定表达的内参基因是GAPDH和ACT1.本研究筛选出高盐胁迫处理下的稳定表达的GAPDH和ACT1基因作为内参基因,对后续验证基因的表达和揭示小拟南芥耐逆机制具有重要意义.; 金玉环刘芳黄薇孙琦黄先忠; 关键词：小拟南芥 NACL胁迫内参基因

新疆小拟南芥烯醛双键还原酶基因对转基因烟草耐盐性的影响: 2018年; 为了研究前期从新疆小拟南芥中克隆的编码烯醛双键还原酶(alkenal reductase)Ap AER基因的功能,本研究构建了带有花椰菜花叶病毒(Ca MV)的35S启动子的植物过表达载体35S:Ap AER,并转化至农杆菌GV3101中,采用叶盘法转化烟草获得了转35S:Ap AER基因的烟草。用250 mmol/L的Na Cl溶液分别胁迫转基因和野生型烟草2和4 d,并测定了脯氨酸(Proline)和丙二醛(MDA)含量、过氧化氢酶(CAT)及过量化物酶(POD)酶活力等生理指标。结果表明:高盐胁迫下14 d,转基因烟草的长势明显优于野生型烟草,转基因烟草普遍植株较高、叶片大、叶色深;转基因烟草的Proline含量、CAT及POD酶活力均高于对照,而反映质膜受损情况的MDA含量显著低于对照。表明过表达Ap AER基因,能提高转基因植株清除醛自由基的能力、提高脯氨酸等渗透调节物质的含量及相关还原酶活性,从而显著提高转基因烟草的耐盐性。; 周童杨立飞夏新宇肖衡黄先忠; 关键词：AP AER 烟草耐盐性

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