搜索到840篇“ 底物特异性“的相关文章
- 多萜醇磷酸β-葡萄糖基转移酶的活性和底物特异性分析
- 2024年
- 内质网(endoplasmic reticulum,ER)是蛋白质折叠和质量控制的主要场所,其内部驻留的分子伴侣能够帮助新生多肽链形成正确的三级结构。部分分子伴侣通过特异性识别葡萄糖基化的N-寡糖结构与糖肽结合,进而促进相应蛋白的折叠。作为ER腔内葡萄糖基化反应的糖基供体,体外获取多萜醇磷酸葡萄糖(dolichol phosphate glucose,Dol-P-Glc)或其类似物对解析N-寡糖生物合成途径及糖蛋白质量控制体系具有重要意义,一直受到科学家们的关注。本研究以化学合成的一系列多萜醇(dolichol)类似物作为底物,对大肠杆菌表达的阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)来源的多萜醇磷酸β-葡萄糖基转移酶E(dolichyl-phosphateβ-glucosyltransferase E,Alg5E)进行了研究。结果表明该重组蛋白在体外具有较强的催化活性,可以识别不同链长的脂肪醇,底物中脂肪醇碳链越长其酶促反应进程越快,且对脂肪醇中异戊二烯的支链甲基表现出偏好性。研究还确认了重要的天冬氨酸-任意氨基酸-天冬氨酸(aspartate-anyresidue-aspartate,DXD)基序与二价金属离子的结合是该酶发挥催化功能的关键。上述工作为多萜醇寡糖(dolichol-linked oligosaccharide,DLO)合成途径中葡萄糖基转移酶Alg6、Alg8和Alg10的研究打下了基础。
- 栗瑞杰胡芸尚尔菲高晓冬王宁
- 关键词:葡萄糖基转移酶N-糖基化底物特异性
- 铜绿假单胞菌4-3角蛋白酶的高效制备及底物特异性改造研究
- 角蛋白是一类难以降解的天然聚合物,富含多种必需氨基酸,具有广阔的资源化利用价值。然而,由于角蛋白结构致密、性质稳定,难以被普通蛋白酶降解,因此常被肆意丢弃,造成极大的环境污染和蛋白资源的浪费。角蛋白酶是可降解包含角蛋白、...
- 裴晓东
- 关键词:角蛋白角蛋白酶底物特异性蛋白质工程
- 基于自监督深度学习的酶底物特异性预测方法和系统
- 本发明提供一种基于自监督深度学习的酶底物特异性预测方法和系统,其中方法包括:获取蛋白质序列数据,利用序列相似性网络从蛋白质序列数据中获取酶底物特异性简化标签;基于蛋白质序列数据,以及酶底物特异性简化标签,训练基于BERT...
- 邢柯吴海洋王睿薛美艳王子洋霍晓宁杨腾昆
- 源于类芽胞杆菌的低聚糖脱支酶底物特异性及其应用研究
- 2024年
- 脱支酶是淀粉深加工产业的常用酶制剂,然而传统脱支酶难以完全满足淀粉糖绿色生产及副产物综合利用的需求,因此有必要挖掘适合的新型脱支酶。本研究筛选并构建来源于类芽胞杆菌STB16的低聚糖脱支酶基因(oga)的枯草芽孢杆菌表达系统,实现低聚糖脱支酶的异源表达,并探究重组酶的酶学性质和底物特异性。结果表明,枯草芽孢杆菌发酵上清液的酶活力可达162.33 U/mL,重组酶的最适反应温度50℃、最适反应pH值6.0,且专一地作用于底物中聚合度为1的分支的α-1,6-糖苷键。相比于其它类型的脱支酶(底物转化率低于检出限),重组低聚糖脱支酶对异麦芽糖、异麦芽三糖、潘糖等异麦芽低聚糖具有更彻底的水解能力,底物转化率达97.4%~100%,且产物为葡萄糖,因此更适合用于处理葡萄糖母液,可使一次母液、二次母液和色谱分离尾液中葡萄糖含量分别提升3.6%,12.7%和34.4%。相关研究结果可为新型脱支酶的开发和利用奠定理论基础,也为淀粉糖加工副产物的综合利用提供重要参考。
- 孔昊存张笑李才明李才明顾正彪班宵逢
- 关键词:底物特异性淀粉糖葡萄糖母液
- 线粒体RNA m^(3)C修饰酶METTL8的修饰机制和底物特异性
- 2024年
- tRNA是遗传信息传递的关键生物大分子之一.在核糖体中,tRNA的反密码子通过与mRNA的三联体密码子互补配对,从而将其携带的氨基酸掺入到新合成的肽链中,对遗传信息的精准传递具有重要作用^([1]).tRNA上存在着大量的转录后核苷酸修饰^([2]).目前已有120多种tRNA修饰被鉴定出来,它们存在于12%~20%的tRNA核苷酸碱基上^([3,4]).tRNA上存在的这些修饰参与并调控一系列生命过程^([5]).众多的修饰能够维持tRNA结构、提高tRNA稳定性、促进反密码子与密码子的精确配对等,在多种生命活动中发挥作用^([6,7]).
- 黄梦涵周小龙
- 关键词:反密码子生物大分子修饰酶TRNA底物特异性
- 来源于Saccharolobus solfataricus STB09的糊精脱支酶热激活特性及底物特异性的分子机制研究
- 淀粉脱支酶(Starch debranching enzyme,SDBE)是一类重要的淀粉加工用酶,其能够特异性水解淀粉及其相关多糖中的α-1,6糖苷键,去除底物中的分支结构。在淀粉糖的生产中,SDBE能够与糖化酶协同作...
- 田一雄
- 关键词:底物特异性分子机制
- D-半乳糖底物特异性木糖还原酶的挖掘及其在D-塔格糖合成中的应用
- 2023年
- D-塔格糖是一种稀有的具有特殊保健功能的天然食品甜味剂。目前,以D-半乳糖为底物,基于异构化途径的D-塔格糖生物合成受到基本的热力学平衡限制,底物转化率较低;而基于氧化还原途径,可通过热力学耦合辅因子避免不必要的逆反应,具有更高的理论转化率;但现有氧化还原途径中关键酶醛糖还原酶底物谱广,对D-半乳糖底物特异性低,是制约此合成工艺发展的瓶颈。该研究以Scheffersomyces stipitis CBS 6054来源木糖还原酶(xylose reductase,XR)SsXR为模板,基于氨基酸同源性分析,从美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)中筛选出11个同源序列,并分别对其进行同源建模和分子对接,以D-半乳糖与蛋白分子的结合自由能、作用位点处氨基酸距离为主,结合底物在蛋白口袋中的深度及契合程度等要素筛选到对D-半乳糖特异性最佳的Spathaspora gorwiae来源SgXR。将SsXR和SgXR分别引入大肠杆菌中异源表达并进行酶学性质研究。结果显示,二者均为烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氢(nicotinamide adenine dinucleotide phosphate hydrogen,NADPH)偏好,SgXR对D-半乳糖的底物亲和力是SsXR的4倍,其K m值与k cat分别为SsXR的1/4与1.11倍;进一步引入来源Rhizobium legumenosarum的半乳糖醇脱氢酶RlGDH,以10 g/L D-半乳糖为底物,发酵48 h,含有SgXR的重组菌D-塔格糖产量达到5.47 g/L,是SsXR的1.23倍,且对D-半乳糖转化率为54.7%,高于大多数基于异构化途径的报道。该研究为基于氧化还原途径的D-塔格糖高效生物合成工艺开发奠定了基础。
- 张芝琳陈耀朱丽英刘伟江凌
- 关键词:D-塔格糖木糖还原酶同源建模酶学性质
- 嗜热玫瑰红球菌来源嗜热脂肪酶的重组表达、结构解析及底物特异性改造
- 脂肪酶作为一种绿色的生物催化剂,因其优异的催化特征而被广泛的应用于食品、医药、皮革、化工与环境等工业领域。高温、有机溶剂、极端pH等特殊环境因素则限制了脂肪酶在这些领域的进一步应用。筛选鉴定能够极端环境,特别是热稳定性的...
- 方亚坤
- 关键词:热稳定性结合能
- 两种微生物源谷氨酰胺转氨酶与底物特异性识别的全原子动力学模拟研究
- 2023年
- 微生物源谷氨酰胺转氨酶(Transglutaminase,TGase)能够催化蛋白间氨酰基转移促进蛋白交联,已经广泛应用于食品、轻工等多种领域.然而目前微生物源TGase与底物间基于长程作用力的分子特异性识别机制仍不清楚,理性改造困难.本研究以源自高茂源链霉菌(MTG)和源自枯草芽孢杆菌(BTG)的两种TGase为研究对象,使用分子对接技术构建酶与底物的结合复合体并使用分子动力学模拟解析两种TGase与底物识别的分子机制.结果显示两种TGase在底物识别过程高度类似,均由催化腔外周loop区域氨基酸残基通过范德华及静电作用固定底物整体,而后由位于催化腔底部催化三联体内Asp(MTG)或Glu(BTG)通过羧基侧链稳定反应发生局部空间构象并拉近底物Gln内γ-酰胺基与核心催化残基Cys间距,以便后续反应过程中TGase-底物中间体的生成.上述结果阐明了TGase与底物活性基团的分子识别模式,提出了两种TGase内作用于底物识别的氨基酸残基,为以后TGase的理性改造研究提供了理论基础.
- 吴楠张永峰季宝成
- 关键词:分子对接分子动力学模拟
- 发酵乳杆菌来源的D-乳酸脱氢酶的分子改造及底物特异性研究
- α-羟基酸是各种精细化学品的重要合成子,参与各种药物和体内可降解生物材料的合成,也是α-氨基酸的天然结构类似物,参与生物体内重要的生理活动,还是护肤化妆品中有效的活性添加剂。D-乳酸脱氢酶能够立体选择性催化D-α-羟基酸...
- 樊昕雨
- 关键词:Α-羟基酸底物特异性
相关作者
- 伊日布斯

- 作品数:81被引量:86H指数:5
- 供职机构:昆明理工大学
- 研究主题:基因 原核表达载体 酶活 核苷酸序列 底物特异性
- 严金平

- 作品数:73被引量:150H指数:7
- 供职机构:昆明理工大学
- 研究主题:原核表达载体 基因 酶活 核苷酸序列 底物特异性
- 姚斌

- 作品数:583被引量:1,637H指数:23
- 供职机构:中国农业科学院生物技术研究所
- 研究主题:基因 编码基因 突变体 木聚糖酶 植酸酶
- 罗会颖

- 作品数:361被引量:231H指数:10
- 供职机构:中国农业科学院饲料研究所
- 研究主题:基因 编码基因 突变体 木聚糖酶 工程领域
- 毛相朝

- 作品数:465被引量:267H指数:9
- 供职机构:中国海洋大学
- 研究主题:壳寡糖 壳聚糖酶 OU 脂肪酶 二糖