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用于从Hi-C矩阵识别染色质结构特征的方法、存储用于从Hi-C矩阵中识别染色质结构特征的程序的非瞬态计算机可读介质: 本发明涉及一种用于从Hi‑C矩阵中识别染色质结构特征的方法，一种存储用于从Hi‑C矩阵中识别染色质结构特征的程序的非瞬态计算机可读介质，以及用于诊断和治疗医学病症或疾病的方法。用于从Hi‑C矩阵中识别染色质结构特征的方法...; 王静瑶薛玥何玥颖高毅勤

一种原位高通量染色质结构定向捕获的方法: 本发明属于生物技术领域，具体公开了一种高通量染色质结构定向捕获并分析的方法。这是一种在组织切片上获取具有原位空间信息和表型定义的高通量染色体构象捕获(Hi‑C)方法。通过对组织切片预先进行固定、破膜、多步酶反应等关键步骤...; 刘一心唐颖李鑫辉丹尼尔·恰科夫郭妍程酩邵志峰

SPRI磁珠技术的优化应用以及基于优化Hi-C对染色体融合酵母的染色质结构特征的研究: 真核生物的基因组是以线性序列储存遗传信息,但基因的表达、调控及调控元件之间的互作都会受到基因组三维空间结构的影响。三维基因组学的技术如Hi-C,及其相关优化或衍生技术等,可以更精确的揭示染色质三维空间构象在细胞功能和基因...; 刘丹丽; 关键词：空间结构

染色质结构蛋白变异与人类疾病被引量：1: 2023年; 层级复杂的三维染色质结构对于细胞命运决定和功能维持所需的多种DNA相关生物学过程的时空调控至关重要,如DNA复制、转录、重组和损伤修复等.三维染色质结构失调导致基因表达异常,被认为是肿瘤或神经发育障碍等多种疾病的主要诱因.本文重点阐述组蛋白及其变体、甲基CpG结合蛋白2在三维染色质高级结构及动态性调节中的作用,总结疾病相关突变对基因功能的影响,探讨肿瘤或神经发育障碍发生发展过程中染色质层面的病理学机制.; 曹红吴迪魏瑜林海燕李国红; 关键词：人类疾病

用于从Hi-C矩阵识别染色质结构特征的方法、存储用于从Hi-C矩阵中识别染色质结构特征的程序的非瞬态计算机可读介质: 本发明涉及一种用于从Hi‑C矩阵中识别染色质结构特征的方法，一种存储用于从Hi‑C矩阵中识别染色质结构特征的程序的非瞬态计算机可读介质，以及用于诊断和治疗医学病症或疾病的方法。用于从Hi‑C矩阵中识别染色质结构特征的方法...; 王静瑶薛玥何玥颖高毅勤

多尺度染色质结构重构方法研究: 生物染色质结构与基因的表达、转录、调控功能密切相关。利用显微镜技术观察染色质空间结构,分辨率较低,无法精准定位染色质空间结构与基因功能之间的关系。而高通量染色体构象捕获(Hi-C)技术的快速发展,为研究多尺度染色质结构提...; 龚海燕; 关键词：非线性降维

乙型肝炎病毒稳定转染后宿主细胞高级染色质结构改变分析: 2023年; 目的研究乙型肝炎病毒(HBV)对肝细胞三维基因组学空间组织结构的影响。方法使用桥接高通量染色质构象捕获(BL‐Hi‐C)技术,获取HBV稳定转染细胞HepG2.CW与对照细胞HepG2的基因组三维空间互作信息,并联合转录组测序分析差异表达基因。通过CCK‐8实验及Kaplan‐Meier生存分析方法分别检测细胞增殖活力,分析差异表达基因功能。结果BL‐Hi‐C实验获取了2株细胞的基因组三维互作信息,在50 kb分辨率下,HBV稳定转染细胞HepG2.CW与HepG2相比,16号染色体与22号染色体发生了染色体易位以及易位点染色体拓扑相关结构域(TAD)的融合变异。结合转录组数据发现,染色体易位点及TAD变异关联区域的22号染色体开放阅读框34(C22ORF34)与肌醇加氧酶(MIOX)出现明显变化。细胞生长曲线表明,HepG2.CW具有更高的细胞增殖活力。生存分析发现C22ORF34及MIOX基因与患者的生存预期密切相关。结论HBV稳定转染可引起HepG2细胞发生染色体易位及三维基因组结构改变,并导致相关区域内C22ORF34和MIOX基因的表达改变。; 江修宇郝晓娟周喆王学军杨骞; 关键词：乙型肝炎病毒 HEPG2细胞

染色质结构与转录因子调控机制及其在疾病中的作用研究: 研究背景染色质结构是指由DNA缠绕组蛋白并在细胞核内盘曲折叠形成的空间三维结构,包含了染色质开放性、空间构象等。转录因子是一类能够结合DNA并影响基因表达的蛋白,部分转录因子在发挥调控功能的过程中牵引染色质形成空间结构,...; 许翔; 关键词：染色质结构转录因子结直肠癌

KAP1调控异染色质结构的研究进展: 2023年; KAP1是一种定位于异染色质的脚手架蛋白,调控染色质结构凝集或者松弛。作为异染色质相关蛋白,已发现KAP1与DNA损伤修复、转录,甚至液-液相分离(Liquid-liquid phase separation, LLPS)的形成有密切关系。除此之外,KAP1还参与细胞自噬,促进肿瘤细胞增殖。然而,在这些生理过程中KAP1对异染色质结构的调控及具体机制并不清楚。该文以KAP1蛋白结构及其功能为出发点,总结KAP1在细胞代谢中对异染色质结构的调控作用,为相关研究提供参考。; 郑晓凤韩明姝; 关键词：DNA损伤修复自噬逆转录病毒

染色质结构稳定蛋白4的下调诱导肿瘤细胞进入滞育样状态:乳酸化及胞质分裂的协同调控: 2023年; 胚胎滞育是许多哺乳动物面对恶劣环境时采取的一种生存策略.这种策略通过暂时停止胚胎的发育来提高在恶劣条件下的生存能力.在这种情况下,胚胎的增殖被抑制,着床过程被延迟.Dhimole等人[1]最近的一项研究表明,肿瘤细胞在受到细胞毒性药物治疗时,会转变成类似于滞育状态,从而减少药物引起的细胞死亡.; 孙雪丹何立芳吴缅刘连新; 关键词：染色质结构细胞死亡胞质分裂

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