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- 基于血清蛋白质组学技术的高原脑水肿筛查装置
- 本实用新型公开了一种基于血清蛋白质组学技术的高原脑水肿筛查装置,包括操作台,所述操作台上设置有离心结构、蛋白质检测仪和筛查电脑,所述离心结构包括外壳,外壳内的底部安装有电机,外壳内侧壁上安装有隔板,隔板的中央转动安装有第...
- 高岱佺张运周
- 血清蛋白质组高丰度蛋白去除方法比较研究
- 2024年
- 基于健康人群(HC)和肝癌人群(HCC)的血清样本,本研究比较了高选择Top14高丰度蛋白去除试剂盒(Top14)、DMB低丰度蛋白富集试剂盒(DMB)2种血清蛋白质组前处理方案的优劣势。对于HC样本,DMB处理组鉴定的蛋白质数量是Top14处理组的2.6倍,是未处理血清原液(Blank)样本的3.9倍;对于HCC样本,DMB处理组鉴定的蛋白质数量是Top14处理组的3.7倍,Blank组的6.2倍。通过分析蛋白组的丰度排序散点图,发现Top14预处理对高丰度蛋白质的去除效果显著;但相较于DMB预处理,低丰度蛋白质的鉴定覆盖率较低。在蛋白质组鉴定频率方面,DMB处理样本中可定量蛋白质数量明显多于Top14处理组和Blank组。Top14处理组和Blank组中鉴定的蛋白质超过50%可在DMB处理组中被鉴定到,且其鉴定蛋白质的KEGG分析结果基本可在DMB方案中被覆盖。在DMB预处理的肝癌血清中鉴定到47个差异蛋白质,而在Top14处理组和Blank组中分别只鉴定到15、17个差异蛋白质。通过对各组差异蛋白质编码基因的KEGG分析,DMB、Top14预处理组和Blank样本的差异蛋白质分别富集到21、5、1条通路,表明DMB预处理更适用于血清样本蛋白质组的分析。基于DMB预处理方法,本研究发现HSP90AB1、SPP1、ACTR3、SNCA、PECAM1和SRC在肝癌血清样本中显著上调,可作为肝癌筛查候选生物标志物。
- 赵佳威陆澳赵洋孟波叶子弘
- 关键词:血清蛋白质组
- 基于MALDI-TOF-MS和ELISA法对多囊卵巢综合征患者胰岛素抵抗的血清蛋白质组学和细胞因子分析
- 2024年
- 目的比较多囊卵巢综合征(PCOS)患者发生或不发生胰岛素抵抗(IR)的血清蛋白表达水平差异,确定多囊卵巢综合征发生胰岛素抵抗的潜在血清生物标志物。方法纳入2022年1—12月期间在东莞市中医院诊治的193例PCOS患者,根据胰岛素抵抗稳态模型评估分为胰岛素抵抗组(PCOS-IR,n=95)和非胰岛素抵抗组(PCOS-NIR,n=98),选择同期非PCOS者为健康对照组(n=34)。使用ELISA法测试8个炎症指标:KLF、INF-γ、IL-2、IL-4、IL-6、IL-10、IL-22、TNF-α。基于基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术鉴定PCOS-IR组和PCOS-NIR组之间蛋白表达水平的差异。结果KLF、IL-4、IL-6和TNF-α4个指标,在PCOS-IR组中含量最高,在健康对照组中含量最低,而INF-γ、IL-2、IL-10和IL-22在PCOS-IR组中含量最低,在健康对照组中含量最高。蛋白多肽质谱学分析显示83个离子峰的相对峰强度在组间具有显著性差异(P<0.05),并且PCA及PLS-DA分析能够明显区分开健康对照组和PCOS-IR组,PCOS组与其他两组虽有分离趋势,但会存在重叠。结论该研究发现PCOS患者、PCOS-IR患者、与非PCOS者之间的血清蛋白和多肽成分存在差异,在PCOS-IR诊断或筛查方面具有较好潜力。
- 陈见辉冯奕习李汉秋彭伟如黄雪梅薛新娜
- 关键词:多囊卵巢综合征胰岛素抵抗
- 基于TMT技术的牦牛妊娠期血清蛋白质组学分析
- 2024年
- 为了探究妊娠期内牦牛血清的蛋白质组特征,筛选并分析差异表达蛋白质(DEPs)在牦牛妊娠维持中的作用。本研究选择9头4岁半至6岁龄健康状况良好且当年未产犊的自然发情母牦牛进行人工授精(AI)。在AI后第30、60及90天采集其血清样品,并对授配母牦牛进行妊娠诊断。依据诊断结果将采集的样品进行回顾性分组,即妊娠第1、2、3月组及未妊娠组(未妊娠组样品来自AI后90天经妊娠诊断确诊为未孕的牦牛个体),每组样品3个生物学重复。利用串联质谱标签(TMT)技术对牦牛血清样品的蛋白表达情况进行定量分析,筛选差异表达蛋白,并对其进行GO功能富集和KEGG通路等生物信息学分析,进一步筛选与牦牛妊娠维持相关的潜在蛋白。结果显示,在4组牦牛血清蛋白样品中共获得497个蛋白,以差异倍数≥1.2或≤0.83,且P<0.05为条件筛选,共筛选到68个差异蛋白。GO功能富集和KEGG通路分析显示,这些DEPs在代谢、免疫系统、粘附、生物调节等生物学过程以及补体与凝血级联、金黄色葡萄球菌感染等与炎症和免疫途径相关的通路有明显富集。值得注意的是,妊娠期各组间差异蛋白富集通路中均包含有PI3K-Akt、Rap1、MAPK等与生殖相关的信号通路。DEPs中IGFBP2、FGG、B2M、PDIA4、AZGP1的表达具有随妊娠时间的延长而连续上调的趋势,且这些蛋白在妊娠第3月表达量显著高于未妊娠状态。研究结果表明,牦牛妊娠早期存在明显的血清蛋白组的变化。这些DEPs分别在促进细胞粘附与增殖、母胎血管生成、维持母体代谢与免疫平衡等过程中起到重要作用。尤其是IGFBP2、FGG、B2M、PDIA4、AZGP1可能通过参与调节胎盘生长发育、免疫应答和脂质代谢等过程,在牦牛妊娠维持中发挥着重要作用。研究结果为进一步探明牦牛维持妊娠过程的调控机制提供了基础资料。
- 姚颖周应聪杜培岩李一娟钱文洁李柳杨余志鹏崔燕余四九樊江峰
- 关键词:TMT蛋白质组学牦牛血清差异表达蛋白
- 基于血清蛋白质组学分析健脾益气合剂对脾虚证FD模型大鼠的作用机制
- 2024年
- 目的筛选健脾益气合剂治疗功能性消化不良(functional dyspepsia,FD)的蛋白靶点,探讨其作用机制。方法将36只SPF级SD雄性大鼠随机分为正常组、模型组及治疗组,每组12只。模型组及治疗组采用碘乙酰胺联合小平台站立法复制FD脾虚证模型。模型成功复制后,治疗组以健脾益气合剂3.2ml/kg灌胃,正常组和模型组给予同等体积蒸馏水灌胃,每天1次,连续灌胃14天。评估治疗前后各组大鼠的一般情况,检测各组大鼠治疗后胃动素、胃泌素及D-木糖含量评估健脾益气合剂干预效果,同时通过血清蛋白质组学分析治疗组和模型组的差异蛋白。结果治疗组大鼠给药后体重、饮水量、进食量、活动度等接近正常组;与模型组比较,治疗组血清胃动素、胃泌素及D-木糖含量显著升高(P<0.05)。蛋白质组学分析结果显示:模型组与治疗组相比,显著性上调蛋白16个,显著性下调蛋白46个;富集分析得到GO条目26条,KEGG条目112条。构建蛋白相互作用网络分析发现PEBP1、AK1、PRDX1等蛋白可能在健脾益气合剂干预FD脾虚证中发挥核心作用。结论健脾益气合剂可能通过PEBP1、AK1、PRDX1等蛋白参与多途径的调节,从而干预FD。
- 邹孟龙黄晓燕陈雅璐梁巧俐陈柏辉周树珩涂严平宁芯谭瑾轩邓娴王文妤
- 关键词:功能性消化不良蛋白质组学脾虚证
- 复方止痛药药物过量性头痛脑部静息态fMRI特征及血清蛋白质组学的研究
- 目的:通过采用静息态功能磁共振分析复方止痛药(头痛粉)过量使用引起的药物过量性头痛(medication overuse headache,MOH)患者的脑功能异常活动;同时采用蛋白质组学筛选MOH患者及健康组的血清差异...
- 漆盼
- 关键词:静息态功能磁共振蛋白质组学CCL5TOLL样受体信号通路
- 基于血清蛋白质组学分析桥本甲状腺炎合并肥胖患者血清蛋白质差异表达被引量:1
- 2023年
- 目的探讨体质量对桥本甲状腺炎(HT)患者中肥胖与正常体质量对血清中蛋白质表达差异的影响,探寻存在的差异蛋白质与相关通路。方法收集桥本甲状腺炎患者中肥胖与正常体质量患者血清各10例,健康对照组血清10人,提取血清中蛋白质,使用胰蛋白酶降解,进行液相色谱-质谱联用分析,与对照组对比分析,鉴定两组差异蛋白质的表达变化,并进行生物信息学分析。结果检测到正常体质量的桥本甲状腺炎组与对照组的血清差异蛋白质共有180个,差异表达的蛋白质参与的通路有Relaxin信号通路,心肌细胞中肾上腺素能信号通路和心肌收缩等;桥本甲状腺炎合并肥胖组与对照组进行对比,血清中差异蛋白质共有232个,差异蛋白质相关的通路有TRP通道的炎性反应介质调节,C型凝集素受体信号通路,Apelin信号通路;正常体质量的桥本甲状腺炎和桥本甲状腺炎合并肥胖组对比,结果显示血清中差异蛋白质共有212个,差异蛋白质富集的通路是雌激素信号通路。结论桥本甲状腺炎患者是否合并肥胖对血清中蛋白质表达具有一定的影响,合并肥胖时可能增加向甲状腺癌转化的风险。该结论为桥本甲状腺炎进一步的研究提供理论基础,对临床诊断与治疗具有重要意义。
- 马国英加孜热亚·再依拿提李素丽李素丽
- 关键词:桥本甲状腺炎肥胖蛋白质组学差异蛋白质
- 阻塞性睡眠呼吸暂停不同症状亚型患者血清蛋白质组学分析
- 2023年
- 目的阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)患者存在日间过度思睡(EDS)、失眠等症状不同的亚型。目前尚不清楚蛋白质组学在OSA伴EDS和伴失眠的患者之间是否存在差异。因此,我们检测了OSA不同临床亚型患者的血清蛋白质组,旨在确定潜在的生物标志物,为OSA不同临床亚型的划分提供依据,同时探讨不同亚型的分子生物学机制。方法本研究纳入空军军医大学第二附属医院的6例OSA患者,其中3例为OSA伴EDS患者,3例为OSA伴失眠患者,均进行整夜多导睡眠监测(PSG)及睡眠量表评估,并在PSG次日晨采集血液,应用蛋白质非标记定量方法(Label-free)筛选差异表达蛋白并进行生物信息学分析。结果我们确定了34个蛋白的一个子集,这些蛋白在OSA伴EDS、伴失眠患者之间表达不同。相对于OSA伴失眠组,OSA伴EDS组血清蛋白表达上调的有20个,表达下调的有14个。生物信息学分析发现,差异蛋白的主要功能集中于DNA损伤、活性氧清除、免疫调节和炎症反应,主要参与细胞内转运、分泌和囊泡转运等生物过程。差异表达蛋白主要定位在细胞质,或为分泌蛋白。可能在OSA不同临床亚型中发挥重要作用的途径为APRT-AK1相互作用。结论在本研究中,我们确定了两种亚型OSA患者的34种差异表达蛋白,如在OSA伴EDS患者血清中显著上调的DDI2、PRDX6蛋白等,可识别OSA不同的临床亚型。此外,可能在OSA不同亚型中发挥重要作用的途径为APRT-AK1相互作用。
- 张丽萍赵显超程金湘任佳封薛盛文刘宇航宿长军
- 关键词:阻塞性睡眠呼吸暂停失眠蛋白质组学
- 中医“实热”上火牙龈炎患者血清蛋白质组学特征研究被引量:3
- 2022年
- 目的:采用蛋白组学技术研究牙龈炎,筛选实热“上火”血清差异表达蛋白,为实热“上火”机制引起的牙龈炎的进一步研究提供科学依据。方法:收集“实热”上火牙龈炎患者和健康对照者血清,采用相对和绝对定量同位素标记(iTRAQ),并对血清蛋白质进行检测。结合生物信息学分析(GO、STRING)筛选并鉴定出实热“上火”者与对照者人群差异显著的蛋白质。结果:筛选出实热“上火”牙龈炎组与正常对照组相比有43个差异蛋白,其中上调的有27个,下调的有16个。C反应蛋白(CRP)、载脂蛋白家族(ApoC2,APOD,APOM)、血清淀粉样酶A(SAA)、凝血因子12等显著上调,而α-1抗胰蛋白酶(AAT)、热休克蛋白(HSPB1)、微管蛋白等显著下调。结论:实热“上火”牙龈炎组脂质代谢异常与氧化应激、细胞凋亡、炎症反应的发生密切相关。通过研究分析凝血功能下降,易造成出血,筛选的差异蛋白可为实热“上火”牙龈炎的生物学基础研究提供理论依据。
- 张苗贺源方谢冠群徐莉范永升陈娟
- 关键词:实热上火牙龈炎血清蛋白质组学差异蛋白
- 一种血清蛋白制备方法及血清蛋白质组质谱检测方法
- 本发明公开了一种血清蛋白制备方法及血清蛋白质组质谱检测方法。本发明针对目前血清蛋白质组样品制备方法的局限性,建立了基于表面亲水与疏水性材料混合的磁性纳米材料,利用纳米颗粒‑蛋白在溶液中接触所形成在的“蛋白冠”,实现了对血...
- 孙龙钦李京丽
相关作者
- 朱慧

- 作品数:16被引量:15H指数:2
- 供职机构:南京师范大学
- 研究主题:高丰度蛋白 血清蛋白质组学研究 蛋白质组学研究 血清蛋白质组学 蛋白质组学
- 刘玉美

- 作品数:60被引量:177H指数:8
- 供职机构:广州市胸科医院
- 研究主题:结核 肺结核 结核病患者 肺结核患者 可疑症状
- 刘志辉

- 作品数:228被引量:822H指数:12
- 供职机构:广州市胸科医院
- 研究主题:结核 结核分枝杆菌 肺结核 分枝杆菌 结核病
- 丁彦青

- 作品数:577被引量:2,410H指数:20
- 供职机构:南方医科大学
- 研究主题:大肠癌 结直肠癌 病理学 肿瘤转移 大肠肿瘤
- 刘银坤

- 作品数:306被引量:1,153H指数:17
- 供职机构:复旦大学附属中山医院
- 研究主题:肝癌 肝细胞 肿瘤转移 蛋白质组学 肝细胞癌