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GST基因家族成员鉴定与表达分析
2024年
为解析姜(Zingiber officinale Roscoe)谷胱甘肽硫转移酶(glutathione-S-transferase,GST)基因家族的信息,基于姜基因组数据,分析鉴定了ZoGST家族成员及其表达模式,并进一步利用qRT-PCR检测了10个ZoGST在不同胁迫下的表达特性。在姜基因组中共鉴定到58个GST家族成员,其编码蛋白的氨基酸长度在110~675 aa之间,分子量12.21~72.51 kD,等电点4.55~9.51。系统进化树显示,ZoGST可分为Ⅰ~Ⅹ亚家族,第Ⅶ和Ⅹ亚家族成员居多数;ZoGST家族成员分布在11条染色体上,共线性分析表明该家族成员存在6对片段重复;顺式作用调控元件分析发现上游启动子区含有与光响应、逆境胁迫、激素调节相关的作用元件;转录组测序数据分析显示,ZoGST有一定的组织表达特异性且响应病害、低温等逆境胁迫,其中,ZoGSTDHAR5、ZoGSTF9、ZoGSTF13等在姜不同生长时期、不同部位、低温和病害胁迫下均有较高表达。qRT-PCR分析表明,盐胁迫下ZoGSTDHAR2(除根茎外)、ZoGSTEF1G2、ZoGSTF9在姜不同组织表达量均显著下调;淹水胁迫下,ZoGSTDHAR2等在叶和根茎中表达量显著上调;干旱胁迫下,ZoGSTF9等在根中表达量显著上调。
王艳红席克勇田野刘德麒周克贵尹军良刘奕清朱永兴
关键词:GST基因家族
藜麦GST基因家族鉴定及冷胁迫下表达模式分析
2024年
冷胁迫会直接影响植物的生长和发育,并在植物体内不断累积有害物质。谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferase, GST)是一种对细胞保护至关重要的抗氧化酶,通过减少活性氧引起的生理性损伤,在生物和非生物应激反应中发挥重要作用。藜麦(Chenopodium quinoa Willd.)中富含蛋白质、氨基酸等对人体有益的物质,但藜麦苗期易受冷空气侵袭而导致减产。因此,鉴定藜麦耐寒相关基因是必要的,为此鉴定藜麦GST基因家族成员,并分析藜麦GST基因在冷胁迫下不同组织中的表达模式。结果表明,在藜麦基因组中共鉴定出59个藜麦GST基因成员,其氨基酸长度范围为199~416 aa,分子量在22.72~47.45 ku范围内,随机分布在14条染色体上,通过系统发育分析将其分为8个亚家族,在启动子区域中分析发现多个低温顺式作用元件(LTR)和多种生长发育及代谢相关的元件。在藜麦GST基因家族中共发现11对串联重复基因和11对片段重复基因,表明基因复制事件是该物种GST基因家族进化的主要驱动力。基因的组织特异性表达分析结果显示,大多数藜麦GST基因在不同持续时间的冷胁迫下可以作出响应,特别是在叶片上高表达。结果可为进一步研究藜麦GST基因功能提供基础,为藜麦耐寒品种选育提供候选基因。
周光怡李魁印王睿刘晓娟覃显娇简子林任明见
关键词:冷胁迫基因鉴定
Rapid discovery of a novel “green” and natural GST inhibitor for sensitizing hepatocellular carcinoma to Cisplatin by visual screening strategy
2024年
Over-expression of glutathione S-transferase(GST)can promote Cisplatin resistance in hepatocellular carcinoma(HCC)treatment.Hence,inhibiting GST is an attractive strategy to improve Cisplatin sensitivity in HCC therapy.Although several synthesized GST inhibitors have been developed,the side effects and narrow spectrum for anticancer seriously limit their clinical application.Considering the abundance of natural compounds with anticancer activity,this study developed a rapid fluorescence technique to screen“green”natural GST inhibitors with high specificity.The fluorescence assay demonstrated that schisanlactone B(hereafter abbreviated as C1)isolated from Xue tong significantly down-regulated GST levels in Cisplatin-resistant HCC cells in vitro and in vivo.Importantly,C1 can selectively kill HCC cells from normal liver cells,effectively improving the therapeutic effect of Cisplatin on HCC mice by downregulating GST expression.Considering the high GST levels in HCC patients,this compound demonstrated the high potential for sensitizing HCC therapy in clinical practice by down-regulating GST levels.
Linxi MaoYan QinJialong FanWei YangBin LiLiang CaoLiqin YuanMengyun WangBin LiuWei Wang
关键词:GSTHEPATOCARCINOMA
GST family genes in jujube actively respond to phytoplasma infection
2024年
Jujube witches’broom(JWB)caused by phytoplasma has a severely negative effect on multiple metabolisms in jujube.The GST gene family in plants participates in the regulation of a variety of biotic and abiotic stresses.This study aims to identify and reveal the changes in the jujube GST gene family in response to phytoplasma infection.Here,70 ZjGSTs were identified in the jujube genome and divided into 8 classes.Among them,the Tau-class,including 44 genes,was the largest.Phylogenetic analysis indicated that Tau-class genes were highly conserved among species,such as Arabidopsis,cotton,chickpea,and rice.Through chromosome location analysis,37.1%of genes were clustered,and 8 of 9 gene clusters were composed of Tau class members.Through RT-PCR,qRT-PCR and enzyme activity detection,the results showed that the expression of half(20/40)of the tested ZjGSTs was inhibited by phytoplasma infection in field and tissue culture conditions,and GST activity was also significantly reduced.In the resistant and susceptible varieties under phytoplasma infection,ZjGSTU49-ZjGSTU54 in the cluster IV showed opposite expression patterns,which may be due to functional divergence during evolution.Some upregulated genes(ZjGSTU45,ZjGSTU49,ZjGSTU59,and ZjGSTU70)might be involved in the process of jujube against JWB.The yeast two-hybrid results showed that all 6 Tauclass proteins tested could form homodimers or heterodimers.Overall,the comprehensive analysis of the jujube GST gene family revealed that ZjGSTs responded actively to phytoplasma infection.Furthermore,some screened genes(ZjGSTU24,ZjGSTU49-52,ZjGSTU70,and ZjDHAR10)will contribute to further functional studies of jujube-phytoplasma interactions.
Qipeng WangLiman ZhangChaoling XueYao ZhangXiangrui MengZhiguo LiuMengjun LiuJin Zhao
关键词:PHYTOPLASMAEXPRESSION
重金属汞胁迫下菲律宾蛤仔GPx和GST基因表达分析
2024年
为研究重金属汞胁迫下菲律宾蛤仔谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPx)和谷胱甘肽-S-转移酶(glutathione-S-transferase,GST)基因的表达情况,用汞对指示生物菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)进行单一慢性暴露试验,分别在0、12、24 h以及2、3、4、5、6、7和8 d时检测菲律宾蛤仔内脏团和鳃中GPx和GST基因的表达情况。结果表明,菲律宾蛤仔内脏团中GPx和GST基因的表达量都呈现波动变化趋势,分别在24和12 h时表达量最高(P<0.05),6 d时GPx基因表达量最低(P>0.05),3 d时GST基因表达量最低(P<0.05);GPx基因在鳃中的表达量在8 d时最高(P<0.05);鳃中GST基因的表达量在5 d时最高(P<0.05)。以上结果表明汞暴露在短期内能够诱导GPx和GST基因进行不同程度的表达,但其随着时间的延长呈明显的抑制作用。该研究结果为揭示重金属汞对菲律宾蛤仔的毒性机理提供了理论依据。
郑志龙闫路路闫喜武秦艳杰
关键词:菲律宾蛤仔谷胱甘肽-S-转移酶
基于GST薄膜的弯曲波导相变光学器件光学仿真与分析
2024年
研究了相变光学器件的光传输性能,使用时域有限差分法建立覆盖Ge_(2)Sb_(2)Te_(5)(GST)薄膜的弯曲波导模型,得到了在晶态和非晶态两种情况下GST的面积、厚度和在弯曲波导中的位置对光传输效率及损耗的影响规律。结果表明:GST的最优覆盖面积为0.415μm^(2),厚度为17nm,器件光传输不受GST覆盖位置影响,光传输对比度最佳达到90.8%,插入损耗低至0.321dB,在1500~1670nm波长范围内能够实现宽光谱并行传输。该器件尺寸小,消光比大,理论上满足提高光计算准确率的需求。研究结果对于非易失性、并行集成光子矩阵计算单元器件的研制具有一定的参考意义。
罗明馨张东亮鹿利单祝连庆
关键词:弯曲波导
结合ANN的VO_(2)/GST光子结构的多级动态光谱选择性调控
2024年
光谱选择性吸收/发射的微纳光子结构广泛应用在诸多领域。本文提出了结合两种相变材料的简单多层光子结构的设计。首先采用FEM对该结构的光谱反射进行计算,建立数据集并训练了快速计算的ANN模型。最后展示了结合相变材料VO_(2)和GST的光子结构的多级动态光谱选择性调控。结果显示光子结构参数为d_(1)=0.1μm、d_(2)=0.3μm时,ANN模型计算时间为1.5 s,节省了计算耗时;此光子结构的四种模态表现不同的光谱选择性吸收。为光谱选择性调控提供了多级动态调控的新设计思路。
宋奎龙谢鸣艾青
关键词:人工神经网络
云南越桔T2T基因组测序及GST基因家族全基因组分析
蓝莓(Vacciniums.spp)是一种常见的越桔属(Vaccinium)小浆果,其味道鲜美,甜酸适中,营养丰富,有“黄金浆果”的美誉,富含多种维生素与丰富的抗氧化物质。其花青素水平显著高于其他果实,在食品、制药、化妆...
吕薇
关键词:蓝莓花青素
P-gp、GSTπ联合TOPOⅡα检测对三阴性乳腺癌新辅助化疗病理完全缓解的预测价值
2024年
目的分析P⁃糖蛋白(P⁃gp)、谷胱甘肽转移酶(GSTπ)联合拓扑异构酶Ⅱα(TOPOⅡα)检测对三阴性乳腺癌(TNBC)患者新辅助化疗(NAC)病理完全缓解(pCR)的预测价值。方法本研究为一项回顾性、单中心、双盲法的试验,选取郑州大学第一附属医院自2020年3月至2022年10月,经纳入、排除标准共筛查135名TNBC患者作为研究对象,均为女性。采用SP免疫组化法检测P⁃gp、GSTπ、TOPOⅡα,分析TNBC患者NAC疗效,行单因素、多因素分析P⁃gp、GSTπ、TOPOⅡα表达与NAC pCR的关系,绘制ROC曲线分析P⁃gp、GSTπ、TOPOⅡα单一及联合检测对TNBC患者NAC pCR的预测价值。结果NAC后,cCR者47例(34.81%),cPR者72例(53.33%),SD者12例(8.90%),PD者4例(2.96%),总有效率88.14%;pCR者21例(15.55%)。经单因素分析,P⁃gp、GSTπ阳性表达pCR率低于P⁃gp、GSTπ阴性表达pCR率,TOPOⅡα阳性表达pCR率则高于阴性性表达pCR率,差异均有统计学意义(P<0.05)。P⁃gp、GSTπ、TOPOⅡα表达与pCR具有显著相关性[OR(95%CI)分别为1.446(1.127~1.858)、1.640(1.304~2.063)、1.548(1.227~1.984),P<0.05]。P⁃gp、GSTπ、TOPOⅡα联合检测对NAC pCR灵敏度、特异度分别为90.73%、86.73%,AUC(95%CI)为0.813(0.743~0.908),均高于上述指标单一检测(P<0.05)。结论P⁃gp、GSTπ和TOPOⅡα表达与TNBC患者NAC pCR有一定关联,且通过联合上述指标检测NAC pCR有着较高预测价值,有利于帮助临床医生为TNBC患者进一步制定更合适的治疗策略。
吕宁王芳陈卓
关键词:谷胱甘肽转移酶三阴性乳腺癌新辅助化疗
血清AGEs、NSE、GST水平与伴T2DM的急性前循环脑梗死并发血管性认知障碍的关系
2024年
目的探讨血清晚期糖基化终末产物(AGEs)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)、谷胱甘肽硫转移酶(GST)水平与伴2型糖尿病(T2DM)的急性前循环脑梗死(AACI)并发血管性认知障碍(VCI)的关系。方法选取2021年1月至2022年12月南京医科大学附属苏州医院收治的185例伴T2DM的AACI患者作为观察组,185例不伴T2DM的AACI患者作为AACI组,另选取同期在南京医科大学附属苏州医院体检的185例健康志愿者作为对照组。采用酶联免疫吸附试验检测受试者血清AGEs、NSE、GST水平对所有患者随访1年,统计观察组和AACI组患者VCI发生率,根据是否并发VCI将观察组患者分为VCI组和非VCI组,比较VCI组和非VCI组临床资料。采用多因素Logistic回归分析伴T2DM的AACI患者并发VCI的危险因素。绘制受试者工作特征(ROC)曲线评估血清AGEs、NSE、GST对伴T2DM的AACI患者并发VCI的预测效能。结果观察组和AACI组血清AGEs、NSE水平高于对照组,且观察组高于AACI组,差异均有统计学意义(P<0.05)。观察组和AACI组血清GST水平低于对照组,且观察组低于AACI组,差异均有统计学意义(P<0.05)。VCI组有73例患者,非VCI组有112例患者。观察组、AACI组VCI的发生率分别为39.46%(73/185)和27.57%(51/185)。观察组VCI发生率高于AACI组(P<0.05)。VCI组患者T2DM病程、发病至入院时间长于非VCI组,入院时美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分、有颈动脉斑块患者比例、合并高血压患者比例、合并高脂血症患者比例及血清AGEs、NSE水平高于非VCI组,血清GST水平低于非VCI组,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,T2DM病程延长、入院时NIHSS评分升高、有颈动脉斑块、合并高血压及血清AGEs、NSE水平升高,GST水平降低均是伴T2DM的AACI患者并发VCI的危险因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血清AGEs、NSE、GST联合预测伴T2DM的AACI患者并发VCI的曲线下面积(AUC)为0.947,大于�
张豪王怡静张亚娟王小红何维李嵩韬聂莉赵宗权
关键词:晚期糖基化终末产物谷胱甘肽硫转移酶急性前循环脑梗死血管性认知障碍