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国家自然科学基金(KJ2010A142)

作品数:5 被引量:22H指数:3
相关作者:郝家胜孙晓燕杨群陈梅田丽丽更多>>
相关机构:安徽师范大学中国科学院南京地质古生物研究所山西省农业科学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 5篇中文期刊文章

领域

  • 5篇生物学

主题

  • 4篇线粒体基因
  • 4篇线粒体基因组
  • 4篇鳞翅目
  • 4篇基因
  • 4篇基因组
  • 3篇英文
  • 3篇蛱蝶
  • 3篇蛱蝶科
  • 3篇线粒体基因组...
  • 2篇系统学
  • 1篇蛋白质编码
  • 1篇蝶类
  • 1篇蚬蝶科
  • 1篇系统学意义
  • 1篇鳞翅目昆虫
  • 1篇昆虫
  • 1篇核糖体RNA...
  • 1篇IMPLIC...
  • 1篇ITS
  • 1篇FAMILY

机构

  • 3篇安徽师范大学
  • 2篇中国科学院南...
  • 1篇山西省农业科...

作者

  • 3篇郝家胜
  • 2篇田丽丽
  • 2篇杨群
  • 2篇陈梅
  • 2篇孙晓燕
  • 1篇曹天文
  • 1篇盖永华
  • 1篇孙倩倩
  • 1篇胡静
  • 1篇张大秀
  • 1篇王晓灿
  • 1篇石庆会

传媒

  • 5篇Zoolog...

年份

  • 2篇2013
  • 2篇2012
  • 1篇2011
5 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
The first mitochondrial genome for the butterfly family Riodinidae(Abisara fylloides)and its systematic implications
2013年
The Riodinidae is one of the lepidopteran butterfly families.This study describes the complete mitochondrial genome of the butterfly species Abisara fylloides,the first mitochondrial genome of the Riodinidae family.The results show that the entire mitochondrial genome of A.fylloides is 15301 bp in length,and contains 13 protein-coding genes,2 ribosomal RNA genes,22 transfer RNA genes and a 423 bp A+T-rich region.The gene content,orientation and order are identical to the majority of other lepidopteran insects.Phylogenetic reconstruction was conducted using the concatenated 13 protein-coding gene(PCG)sequences of 19 available butterfly species covering all the five butterfly families(Papilionidae,Nymphalidae,Peridae,Lycaenidae and Riodinidae).Both maximum likelihood and Bayesian inference analyses highly supported the monophyly of Lycaenidae+Riodinidae,which was standing as the sister of Nymphalidae.In addition,we propose that the riodinids be categorized into the family Lycaenidae as a subfamilial taxon.
Fang ZHAODun-Yuan HUANGXiao-Yan SUNQing-Hui SHIJia-Sheng HAOLan-Lan ZHANGQun YANG
残锷线蛱蝶线粒体基因组全序列及其系统学意义(英文)被引量:11
2012年
对残锷线蛱蝶(Parathymasulpitia)(鳞翅目:蛱蝶科)线粒体基因组全序列进行了测定。结果表明:残锷线蛱蝶线粒体基因组全序列全长为15268bp,除了在trnS1(AGN)和trnE基因之间有一段121bp长的基因间隔外,其基因的排列顺序及排列方向与大多数已测鳞翅目物种基本一致。在蛋白质编码基因中,除cox1以CGA作为其起始密码子之外,其余12个蛋白质编码基因都以标准的ATN作为起始密码子。此外,除nad4基因以单独的T为终止密码子,其余12个蛋白质编码基因都以TAA结尾。除trnS1(AGN)缺少DHU臂之外,22个tRNA基因都显示典型的三叶草形二级结构。除A+T富集区外的非编码序列中,线粒体基因组共含有11个基因间隔区。其中,最长的一个121bp的基因间隔区位于trnS1(AGN)和trnE之间,其A+T含量高达100%。另外,和其他鳞翅目物种一样,在其A+T富集区的3'端有一段长达18bp的poly-T结构。A+T富集区内部没有明显的小卫星样多拷贝重复序列,而含有一些微卫星样的重复结构。本研究基于13种蛋白编码基因序列的组合数据,用最大似然法和贝叶斯法对蛱蝶科几个主要亚科间共9个代表物种间的系统发生关系进行了分析。结果表明,本研究的结果与前人的分子系统学研究结论基本吻合(其中,线蛱蝶亚科和釉蛱蝶亚科互为姐妹群),而与形态学的研究结论不一致。
田丽丽孙晓燕陈梅盖永华郝家胜杨群
关键词:鳞翅目蛱蝶科线粒体基因组
柳紫闪蛱蝶线粒体基因组全序列及与相关蛱蝶类的比较分析(英文)被引量:11
2012年
该文对柳紫闪蛱蝶Apaturailia(鳞翅目:蛱蝶科)的线粒体基因组全序列进行了测定,同时结合其它已知蛱蝶类的相应序列进行了比较分析。结果显示:柳紫闪蛱蝶的线粒体基因组(GenBankaccessionno.:JF437925)是一个15242bp的环状DNA分子,包含13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和22个tRNA基因。13个蛋白编码基因中,除了COI基因的起始密码子是CGA外,其余12个蛋白编码基因都具有标准的ATN起始密码子;柳紫闪蛱蝶与其它已测的10种蛱蝶在基因定位和排列顺序方面几乎相同,只是在非编码序列上存在细微的差异,其核苷酸的构成及密码子使用频率都处于鳞翅目昆虫的范围之内。22个的tRNA基因中,除了tRNASer(AGN)缺少DHU臂,其余的tRNA基因都显示为典型的三叶草结构。基因组共存在9处基因间重叠区(总长度为33bp)以及12个基因间隔区(总长为155bp,最长间隔是49bp,最短的是1bp)。在ND6和Cytb间的间隔区中还发现有(TA)23似微卫星结构。与其他蛱蝶类相似,403bp的AT富集区包含有ATAGA,ATTTA二个保守模块(一个21bp的poly-T,一个10bp的poly-A),以及二个似微卫星的重复结构((TA)10和(TA)7)。
陈梅田丽丽石庆会曹天文郝家胜
关键词:线粒体基因组鳞翅目蛱蝶科
斐豹蛱蝶线粒体基因组全序列的测定和分析(英文)被引量:12
2011年
该研究对斐豹蛱蝶(Argyreus hyperbius)(鳞翅目:蛱蝶科)线粒体基因组全序列进行了测定和初步分析。结果表明:斐豹蛱蝶线粒体基因全序列全长为15156bp,包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA和2个rRNA基因以及1个非编码的A+T富集区,基因排列顺序与其它鳞翅目种类一致;线粒体全序列核苷酸组成和密码子使用显示出明显的A+T偏好(80.8%)和轻微的AT偏移(AT skew,?0.019)。基因组中共存在11个2~52bp不等的基因间隔区,总长96bp;以及14个1~8bp不等的基因重叠区,总长34bp。除COI以CGA作为起始密码子外,13个蛋白质编码基因中的其余12个基因是以ATN作为起始密码子。除COI和COII基因是以单独的一个T为终止密码子,其余11个蛋白质编码基因都是以TAA结尾的。除了缺少DHU臂的tRNASer(AGN),其余的tRNA基因都显示典型的三叶草结构。tRNA(AGN)和ND1之间的基因间隔区包含一个ATACTAA结构域,这个结构域在鳞翅目中是保守的。A+T富集区没有较大的多拷贝重复序列,但是包含一些微小重复结构:ATAGA结构域下游的20bp poly-T结构,ATTTA结构域后的(AT)9重复,以及位于tRNAMet上游的5bp poly-A结构等。这项研究所揭示的斐豹蛱蝶的线粒体基因组特征,不仅为认识蛱蝶科的遗传多样性贡献数据,而且对于该物种的保护生物学、群体遗传学、谱系地理及演化研究等具有重要意义。
王晓灿孙晓燕孙倩倩张大秀胡静杨群郝家胜
关键词:蛱蝶科鳞翅目线粒体基因组
The first mitochondrial genome for the butterfly family Riodinidae(Abisara fylloides) and its systematic implications被引量:3
2013年
The Riodinidae is one of the lepidopteran butterfly families. This study describes the complete mitochondrial genome of the butterfly species Abisara fylloides, the first mitochondrial genome of the Riodinidae family. The results show that the entire mitochondrial genome of A. fylloides is 15 301 bp in length, and contains 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA genes, 22transfer RNA genes and a 423 bp A+T-rich region. The gene content, orientation and order are identical to the majority of other lepidopteran insects. Phylogenetic reconstruction was conducted using the concatenated 13 protein-coding gene(PCG) sequences of19 available butterfly species covering all the five butterfly families(Papilionidae, Nymphalidae, Peridae, Lycaenidae and Riodinidae). Both maximum likelihood and Bayesian inference analyses highly supported the monophyly of Lycaenidae+Riodinidae,which was standing as the sister of Nymphalidae. In addition, we propose that the riodinids be categorized into the family Lycaenidae as a subfamilial taxon.
Fang ZHAODun-Yuan HUANGXiao-Yan SUNQing-Hui SHIJia-Sheng HAOLan-Lan ZHANGQun YANG
关键词:线粒体基因组蚬蝶科系统学核糖体RNA基因鳞翅目昆虫蛋白质编码
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