云南省应用基础研究基金(2007C0003Z)
- 作品数:68 被引量:338H指数:12
- 相关作者:苗永旺袁峰霍金龙刘丽仙李卫真更多>>
- 相关机构:云南农业大学云南大学云南农业职业技术学院更多>>
- 发文基金:云南省应用基础研究基金云南省应用基础研究计划面上项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学理学更多>>
- 西畴乌骨鸡mtDNA D-loop区遗传多样性分析被引量:24
- 2010年
- 为了从母系遗传角度深入阐明西畴乌骨鸡的群体遗传背景,采用PCR直接测序法测定了36只西畴乌骨鸡的线粒体DNA D-loop区第I高变区520 bp序列。结果表明:在所分析的西畴乌骨鸡D-loop区序列中,T,C,A和G平均含量分别为30.3%,29.7%,27.4%和12.6%;共检测到核苷酸变异位点26个,核苷酸多样度为0.014 52±0.000 98;D-loop区序列存在12种单倍型,单倍型多样度为0.884±0.027,表明西畴乌骨鸡遗传多样性较丰富。聚类分析显示西畴乌骨鸡聚为A,B两大支,其中,A世系分为3小支,B世系分为2小支,说明西畴乌骨鸡在母系血统上存在较大遗传分化。
- 黄道平李大林袁峰林聪李辉建苏绍华
- 关键词:线粒体DNAD-LOOP单倍型
- 利用76个微卫星标记分析滇南小耳猪的遗传多样性被引量:7
- 2008年
- 滇南小耳猪是云南省优良地方猪种之一,其数量大,分布广。为了阐明其群体遗传变异情况,以对其进一步有效保护和合理利用提供科学依据,本研究采用分布在家猪19条染色体上的76个微卫星标记对该猪群体54个个体进行了群体遗传变异检测。共检测到338个等位基因,每个座位的等位基因数在2~8个之间,有效等位基因数在1.9560~5.71432:间,平均每个座位等位基因数(4.4474±1.2044)个,有效等位基因数(3.5091±0.9197)个,群体平均杂合度及平均多态信息含量分别为0.6917±0.09797和0.6388±0.1142。研究结果表明,滇南小耳猪群体遗传多样性较丰富。
- 霍金龙霍海龙苗永旺李大林刘丽仙刘建平李云辉
- 关键词:微卫星标记杂合度多态信息含量
- 槟榔江水牛体重及体尺生长规律的研究被引量:29
- 2011年
- 为了阐明槟榔江水牛的生长发育规律,分别利用Brody,Gompertz和Logistic模型对其体重、体高、体斜长、胸围、腹围、管围6个指标进行了累积生长曲线方程的拟合和比较分析,并利用日增重描述了该水牛的绝对生长,进一步采用改进的计算方法对其相对生长规律作了分析。结果表明:3种曲线模型拟合的效果都很好(r2>0.95)。通过比较各个性状的拟合度,Brody模型的拟合度最大,最适合用于槟榔江水牛的生长发育研究。由Gompertz模型计算出槟榔江水牛公牛的拐点月龄和拐点体重分别为7.1月龄和122.4 kg;母牛的拐点月龄和拐点体重分别为6.0月龄和107.9 kg。公、母牛都在6月龄达到绝对生长高峰,而18月龄绝对生长速度最慢。公牛的日增重呈先下降后上升的过程。母牛的日增重出现了2个峰,一个在6月龄,另一个在24月龄。公、母牛的相对生长曲线较一致,后期生长强度明显不如前期,整条曲线大致上呈下降趋势,表明在幼年时新陈代谢旺盛,生长发育的强度大,成年后趋于稳定。本研究提示应加强槟榔江水牛的饲养管理,特别应重视其母牛和育成期牛的饲养管理。
- 熊飞苗永旺李大林袁峰李卫真屈在久
- 关键词:槟榔江水牛
- 水牛ABCG2基因第9外显子群体遗传特征分析被引量:2
- 2012年
- 三磷酸腺苷结合转运蛋白G超家族成员2(ABCG2)对普通奶牛泌乳性状有直接影响。水牛中该基因的遗传特征与产奶性状间是否有遗传关联目前还不十分清楚。本文采用PCR-SSCP和PCR产物直接测序相结合的技术,对4个河流型水牛群体和9个沼泽型水牛群体共计466个个体的ABCG2基因第9外显子进行了变异检测。结果表明,水牛ABCG2基因第9外显子由251个核苷酸组成,所有的河流型和沼泽型水牛序列相同,未发现SNP位点,但在第9内含子内检测到1个T>C替换(g.SNP44769 T>C)。与GenBank数据库中已发表的牛科物种同源序列比对后发现,数据库中一条河流型水牛序列该外显子第66位核苷酸处有1个G>A替换(c.SNP1018 G>A),导致所编码的氨基酸发生p.V340I的改变;与普通牛、山羊和绵羊该基因第9外显子序列的核苷酸差异位点个数分别为5,8和11个,表明水牛与其他牛科物种间具有较大的遗传差异。本文结果提示ABCG2基因第9外显子在水牛中已纯化固定,且与水牛产奶量性状间无直接关联性。
- 李卓然李卫真苗永旺李大林袁跃云袁峰刘丽仙章纯熙
- 关键词:河流型水牛沼泽型水牛PCR-SSCP
- 4个黄牛群体黑素皮质素受体1(MC1R)基因变异研究被引量:5
- 2010年
- 为了评价E(extension)座位对牛毛色性状的影响,采用DNA序列分析和PCR-RFLP技术对云南地区4个黄牛群体(3个本地群体和1个引进品种)的黑素皮质素受体1(MC1R)基因的编码区进行了基因特征分析和群体变异检测。结果,在文山黄牛、昭通黄牛和短角牛中发现E+和e2种等位基因,检测到E+/E+、E+/e和e/e3种基因型。在文山黄牛中E+和e等位基因的频率分别为0.54和0.46,在昭通黄牛中分别为0.70和0.30;而在迪庆黄牛中共检测到E+、ED和e3种等位基因,它们的频率分别为0.76、0.14和0.10,该群体存在E+/E+、ED/ED、E+/ED、E+/e和ED/e5种基因型,未发现e/e型个体。与所研究个体的毛色性状相联系,发现E座位对牛的毛色有重要影响,E+和ED等位基因与黑色表型有关,而e等位基因与红色表型有关,但黄色、棕色和红色表型还与其它座位基因相关联。
- 唐贺高英凯苗永旺
- 关键词:毛色PCR-RFLP
- 水牛β-LG基因3,4外显子遗传特征分析
- 2011年
- 本文通过PCR产物直接测序法得到水牛β-LG基因第3,4外显子及其旁侧序列后,采用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法对属于10个群体的224头水牛该基因第4外显子进行了多态性检测,又从中随机抽取属于9个群体的69头水牛采用PCR-SSCP结合测序的方法检测了其第3外显子的遗传多态性。结果显示:河流型水牛和沼泽型水牛β-LG基因的第3外显子均为74 bp;它们的第4外显子均为111 bp;在所研究群体中,两类水牛第3,4外显子序列完全相同,并未发现具有多态现象。与牛科物种同源序列比较显示:水牛β-LG基因3,4外显子在进化上比较保守,相应于普通牛的B等位基因。由于产奶量有明显差异的河流型水牛与沼泽型水牛的β-LG基因第3,4外显子序列间无差异,提示它们对水牛产奶量无直接影响。
- 祁宏李卫真袁峰李大林刘丽仙钱坤苗永旺
- 关键词:河流型水牛沼泽型水牛PCR-RFLPPCR-SSCP
- 大额牛群体遗传多样性的微卫星标记分析被引量:2
- 2011年
- 利用26对黄牛微卫星引物,对分别来自云南省泸水县凤凰山大额牛保种区和贡山县独龙野牛种源保护基地的2个大额牛群体进行遗传变异分析,研究其群体内的遗传变异和群体间的遗传分化。结果共检测到105个等位基因,每个座位的等位基因数从2~6不等,所有座位平均等位基因数、平均有效等位基因数、平均期望杂合度、平均多态信息含量分别为4.038 5±0.999 9,3.139 3±0.950 7,0.649 0±0.124 6和0.590 4±0.133 4,表明大额牛群遗传多样性比较丰富。F统计量、基因流、Nei氏遗传距离和遗传相似系数等值反映出两个群体遗传差异较小,遗传分化不明显,遗传一致性较大。
- 田应华霍金龙李石友霍海龙钱林东徐英凌军杨有昌法林荣苗永旺
- 关键词:大额牛微卫星标记遗传分化
- 水牛瘦素受体基因密码子使用偏好性分析被引量:1
- 2017年
- 试验选取27头河流型水牛和41头沼泽型水牛,以从NCBI数据库中下载的家牛、野牦牛、野牛、绵羊、山羊、小鼠和人的序列作对照,对编码瘦素受体(leptin receptor,LEPR)基因的密码子偏好性及水牛与其他物种间密码子使用的差异和进化关系进行了深入分析。结果发现,所有的密码子在河流型水牛和沼泽型水牛LEPR基因中均有使用,两种类型水牛偏好使用的密码子有28个,其中使用偏好性较强的密码子为AGA(RSCU≥2),表明河流型水牛和沼泽型水牛LEPR基因密码子使用特征相似。水牛及参考物种LEPR基因均偏好使用以A/U结尾的密码子,但水牛与其他参考物种间偏好使用密码子的种类和数目有差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型水牛与沼泽型水牛亲缘关系最近,先聚为一类,然后与家牛、野牦牛和野牛聚为一类,再与绵羊、山羊、小鼠和人等物种聚为一类。在密码子使用频率上,河流型水牛LEPR基因与酵母密码子偏好性差异小于与大肠杆菌和小鼠密码子偏好性差异,从而揭示酵母更适合作为水牛LEPR基因的外源表达系统。
- 范新阳欧阳依娜王鹏武张永云滕晓红苗永旺
- 关键词:河流型水牛沼泽型水牛
- 德宏水牛和摩拉×德宏杂种水牛血清生化指标的测定被引量:1
- 2013年
- 本试验对德宏水牛和摩拉×德宏杂种水牛(简称摩杂水牛)的血清总蛋白、总脂含量及GOT、GPT、LDH、γ-GT4种酶的活性进行测定。结果表明,德宏水牛血清总蛋白含量高于摩杂水牛,差异显著(P<0.05);血清总脂含量、GPT和γ-GT活性略高于摩杂水牛,差异不显著(P>0.05);GOT活性高于摩杂水牛,差异极显著(P<0.01);LDH活性高于摩杂水牛,差异显著(P<0.05)。
- 贺珠婷王绍卿张永云张颖樊月圆霍金龙苗永旺李卫真
- 关键词:水牛血清生化指标
- 华坪乌骨鸡mtDNA D-loop遗传多样性分析被引量:12
- 2012年
- 为了阐明华坪乌骨鸡群体遗传背景信息,采用PCR产物直接测序技术对36只华坪乌骨鸡样品的线粒体DNA控制区高变区Ⅰ(长520 bp)进行了测序和序列分析。结果:在所检测华坪乌骨鸡序列中,碱基T、C、A和G平均含量分别为30.1%、29.8%、27.4%和12.6%;共检测到31个核苷酸多态位点,占检测核苷酸位点总数的5.96%,其中22个为简约信息位点,9个为单一信息位点。在该群体中共检测到12种单倍型,单倍型多样度(H)为(0.867±0.038),核苷酸多样度(π值)为(0.01547±0.00085),群体内遗传距离和序列间平均核苷酸差异数分别为(0.016±0.004)和8.044。系统发育分析显示,华坪乌骨鸡包含A、B、C、E、F和G等6个mtDNA世系。结果揭示华坪乌骨鸡群体内遗传变异较丰富,在遗传组成上具有6个母系血统来源。
- 刘丽仙苗永旺孙利民李大林袁峰杨永军贺明仙倪有崇陈官国
- 关键词:遗传分化