重庆市卫生局科研项目(03-2-073)
- 作品数：5 被引量：16H指数：2
- 相关作者：杨凯梅杰张国栋温玉明陈睿更多>>
- 相关机构：重庆医科大学附属第一医院四川大学重庆医科大学附属口腔医院更多>>
- 发文基金：重庆市卫生局科研项目重庆市应用基础研究项目博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 用全基因芯片技术对金黄地鼠口腔颊黏膜癌前病变相关基因的筛选和分析被引量：2
- 2010年
- 目的:利用全基因芯片技术筛选口腔颊黏膜癌前病变发生发展的相关致病基因。方法:用9、10-二甲基;1,2-苯并蒽(Dimethyl benzanthracene,DMBA)诱导建立金黄地鼠颊鳞癌模型,分别提取正常颊黏膜和癌前病变组织的总RNA并合成用Cy3荧光标记的cRNA,分别与含有41000个基因/ESTs序列的Agilent大鼠全基因芯片杂交,以Log2Ratio≥2.5和Log2Ratio≤-2.5为阈值来确定差异表达基因,然后用Gene Ontology对差异表达基因行功能分类分析,最后用RT-PCR对部分差异表达基因进行验证。结果:金黄地鼠颊黏膜自正常黏膜到癌前病变发展过程中,共得到1331条差异表达基因,其中上调基因747条,下调基因584条。Gene Ontology分析发现这些差异基因主要涉及到大分子代谢、信号传导等8大功能分类。对上调基因Atp6v0d2和下调基因Sfrp2行RT-PCR验证结果与芯片结果相符。结论:口腔颊黏膜癌前病变的发生涉及众多基因表达的改变,通过对这些基因的进一步研究,将对探索口腔黏膜癌前病变的发病机制、有效的干预防止癌前病变的发生或逆转癌前病变具有重要意义。
- 张国栋杨凯梅杰
- 关键词：癌前病变全基因表达谱
- DMBA诱导金黄地鼠颊囊癌变的组织学动态变化研究被引量：2
- 2010年
- 目的:观察分析金黄地鼠在致癌剂二甲基苯并蒽(9,10-Dimethyl-1,2 Benzanthracene,DMBA)作用下颊囊粘膜癌变不同时期在肉眼和光镜下的组织学动态变化过程。方法:用DMBA涂抹金黄地鼠颊囊粘膜,每周3次。在肉眼下动态观察颊囊粘膜的癌变过程;分别在第2、4、6、8、10、12、14周时处死动物,在光镜下动态观察颊囊粘膜癌变过程的显微组织学改变。结果:DMBA涂抹金黄地鼠颊囊粘膜2周时出现单纯增生改变,4周时出现轻度上皮异常增生,6周时出现中度异常增生,8周时出现重度异常增生,部分出现原位癌改变,10周时已发生癌变,实验中得到的癌症模型均为高分化鳞状细胞癌。结论:DMBA诱导的金黄地鼠颊囊粘膜癌和人类口腔鳞状细胞癌(Oral squamous cell carcinoma,OSCC)相似,是研究口腔鳞癌多阶段、多步骤动态发展的理想模型。
- 梅杰张国栋杨凯
- 关键词：金黄地鼠颊囊鳞状细胞
- 基因芯片数据分析方法研究进展被引量：2
- 2010年
- 基因芯片是生物芯片的一种，是最先研究也是最成熟的生物芯片。其产生的海量数据中隐含着许多有价值的生物信息，人们越来越重视探索和开发用以分析这些数据的方法。目前已有统计分析、聚类分析、自组织映射等众多的方法用于大规模的基因表达的数据挖掘整理。对基因芯片试验数据现有的基础分析方法进行综述，并介绍一些新的分析方法。
- 梅杰杨凯
- 关键词：基因芯片基因表达分析方法
- 纳米靶向给药系统在口腔癌靶向治疗中的应用展望被引量：10
- 2004年
- 纳米技术与生物技术和生物信息学技术已被公认为是推动当今医学发展的三大支柱动力。特别是近年来纳米技术在肿瘤靶向给药系统方面的发展尤其引人注目,已显示出巨大的发展前景。本文就纳米靶向给药系统用于恶性肿瘤靶向治疗的靶向机理和方式等问题作一总结,希望更多的纳米技术应用于口腔医学的研究,推动口腔医学的发展。
- 杨凯温玉明
- 关键词：纳米靶向治疗口腔肿瘤
- 金黄地鼠颊癌差异表达基因谱的构建及相关生物信息学分析
- 2010年
- 目的:构建二甲基苯并蒽(9,10-Dimethylen-1,2Benzanthracene,DMBA)诱导金黄地鼠颊囊黏膜癌变过程中基因差异表达谱,用相关生物信息学分析方法筛选在癌变过程中起重要作用的基因和信号通路。方法:用DMBA诱导建立金黄地鼠颊鳞癌模型,以Ratio≥2和Ratio≤0.5为阈值,用Agilent全基因表达谱芯片检测金黄地鼠颊囊黏膜癌变的差异表达基因,并对这些差异基因进行(Gene ontology,GO)功能分类和Pathway通路分析。结果:金黄地鼠正常颊黏膜和癌变组织之间共有1 943条差异表达基因,其中上调基因787条,下调基因1 156条;GO分析差异表达基因涉及结构分子相关基因群、转录调控相关基因群和代谢相关基因群等10类;Pathway分析在颊黏膜癌变中共有27条通路发生显著性异常改变,有136条差异基因在以上27条异常通路上发生富集,其中Ppp3r2、Actn1、Src等13条基因均分别富集在3条以上异常改变的通路上。结论:金黄地鼠颊癌的发生共有1 943条基因发生差异表达和27条通路发生异常改变,其中Ppp3r2、Actn1、Src等13条基因是导致细胞通路改变而最终发生癌变的重要致病基因,针对以上基因和通路的深入研究,将有助于揭示口腔黏膜癌变的分子机制,并为基因治疗提供新的靶点。
- 梅杰杨凯张国栋张福军陈丹陈睿
- 关键词：金黄地鼠颊黏膜癌变全基因表达谱
