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国家自然科学基金(60671017)
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2
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肖鹏峰
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三维聚丙烯酰胺凝胶DNA芯片用于大样本单核苷酸多态分型的方法研究
2009年
目的建立三维聚丙烯酰胺凝胶DNA芯片用于大样本单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNP)分型的方法。方法丙烯酰胺基团修饰的PCR产物与丙烯酰胺单体混合后,在丙烯酰胺基团修饰的玻片上点样进行共聚合,建成三维凝胶DNA阵列;芯片与一对特异探针和一对分别标记了Cy3或Cy5的通用序列标签(Tag1和Tag2)进行杂交;杂交后用施加电场的方法去除非特异吸附和错配,最后通过双色荧光共聚焦扫描进行SNP分型。结果3-D凝胶芯片不但具有很高的固定效率,而且可以提供高效的杂交环境;通用序列标签的使用不需对每个位点都标记荧光,使检测成本大幅降低;外加电场使得单碱基错配容易识别,且能显著降低芯片的信噪比。结论基于3-D凝胶的基因芯片技术用于大样本SNPs分型简单易操作,且高通量、高特异性、低成本,该方法将可以更广泛地应用于不同需求的DNA检测中。
程璐
肖鹏峰
孙蓓丽
葛芹玉
陆祖宏
关键词:
DNA芯片
单核苷酸多态
聚丙烯酰胺凝胶固定核酸方法及其应用
被引量:1
2009年
固相核酸已被广泛用于DNA/cDNA微阵列、固相PCR及其它核酸与生物分子检测的传感技术中.和硬质玻璃载片相比,三维聚丙烯酰胺凝胶作为固定核酸的载体具有结合核酸容量高、利于反应的类似液相环境和较少的空间效应等优点.综述了丙烯酰胺凝胶作为固定核酸载体的发展历史,着重介绍了丙烯酰胺修饰核酸直接聚合固定的方法以及在DNA芯片、焦测序、固相PCR(克隆)、及全基因组测序等核酸分析中的应用.
唐静
肖鹏峰
关键词:
聚丙烯酰胺凝胶
寡核苷酸
DNA芯片
基于聚丙烯酰胺凝胶微阵列的冠心病相关SNPs关联性分析
本文采用了一种具有自主产权的新型聚丙烯酰胺凝胶芯片进行单碱基多态性(SNP)分型检测的方法,对氧化低密度脂蛋白受体1(OLR1)基因上两个SNP位点与冠心病相关性进行了研究。聚丙烯酰胺凝胶因其特殊的三维网状结构,能高效率...
孙蓓丽
程璐
肖鹏峰
陆祖宏
关键词:
生物芯片
聚丙烯酰胺凝胶
冠心病
文献传递
聚丙烯酰胺凝胶固定引物的固相PCR
本文报道了一种基于凝胶固定寡核酸引物的固相PCR制备单链DNA模板用于核酸分子检测的方法。在固相PCR中,包括一对液相引物目的是扩增提高进行固相扩增反应的模板量,通过丙烯酰胺修饰寡核酸和丙烯酰胺单体聚合凝胶固定一个引物的...
肖鹏峰
黄欢
周国华
陆祖宏
关键词:
聚丙烯酰胺凝胶
杂交
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