民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室项目(SYSXM200909)
- 作品数：8 被引量：45H指数：5
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- 杉木CCoAOMT基因部分cDNA克隆与序列分析被引量：7
- 2009年
- 利用CODEHOP设计CCoAOMT基因的简并引物,通过RT-PCR的方法,从杉木茎段中克隆到1个长度为614 bp的PCR产物,产物经pMD18-T载体克隆转化至DH5α大肠杆菌中,序列通过同源性比对后显示该片段与其它植物的CCoAOMT基因具有较高的同源性.利用生物信息学方法分析发现,该序列在112－651 bp片段上有一个开放性阅读框,该序列编码的是一个酸性蛋白,亲水性较弱,疏水性较强;信号肽序列为第23位至第45位,二级结构以α-螺旋（40.62%）与不规则盘绕（45.31%）为主,没有发现β转角区域.
- 蒋向辉佘朝文许栋张青桦赵旺
- 关键词：生物技术杉木CDNA克隆
- 浏阳朝天椒的ITS序列分析及分类地位研究被引量：1
- 2010年
- 对浏阳朝天椒(Capsicum furtescensvar.Liuyang)rDNA的ITS序列进行了PCR扩增和克隆测序,用DNA-MAN软件对浏阳朝天椒ITS序列进行了分析,将浏阳朝天椒及其近缘种进行聚类分析。结果为:(1)浏阳朝天椒ITS序列长719 bp,G+C含量为51.3%。(2)将浏阳朝天椒与其他3种辣椒和同科不同属的3种枸杞及3种烟草的rDNA的ITS序列进行比较,发现其与辣椒Capsicum eximium及C.lyciant的ITS序列同源性较低,与辣椒C.baccatu的ITS序列差异较小,相似性达78.3%,可认为浏阳朝天椒与C.baccatu亲缘关系近,可归为一类。研究认为,ITS序列在近缘类群间的系统学研究、居群进化学研究及品种鉴定上具有较大的应用潜力。
- 蒋向辉佘朝文许栋张青桦朱超
- 关键词：辣椒朝天椒ITS序列克隆系统学
- 2个朝天椒变种农艺性状调查及指纹图谱构建研究被引量：2
- 2010年
- 从株展最宽、单果长、叶长、心室数、果肉厚、种子数等农艺性状对2个朝天椒品种进行了比较分析,结果显示所考察的14个性状,除株展最窄与心室数2性状在2品种间没有显著性差异外,其他性状在2品种间的差异都达到极显著水平。通过RAPD引物的筛选及RAPD反应体系的优化,分别找到了12个与2品种特有农艺性状紧密连锁的分子标记,构建了地方朝天椒品种的特有指纹图谱,有利用于从分子水平对2品种进行准确区分,为特有地方辣椒品种的保护提供了参考。
- 蒋向辉佘朝文许栋张青桦
- 关键词：朝天椒RAPDDNA指纹图谱
- 应用形态学与RAPD标记对朝天椒遗传多样性的分析被引量：11
- 2010年
- 为阐明朝天椒种质资源的遗传基础,结合运用形态标记与RAPD标记对7份朝天椒种质资源的遗传多样性进行分析。结果表明,形态标记以10.25的遗传距离将7个朝天椒辣椒种质材料分成了5类,RAPD分子标记以15的遗传距离将供试辣椒种质分成4类,扩增片段的多态性比例为24.4%,扩增多态性位点多,材料间遗传相似系数变幅不明显,对于亲缘关系较近的品种,从分子水平和传统形态学方法进行聚类分析的结果相似。
- 蒋向辉佘朝文许栋张青桦赵旺
- 关键词：朝天椒形态学标记RAPD标记聚类分析
- ITS序列在西红柿种质资源鉴定中的应用被引量：5
- 2010年
- 为了更精确有效地鉴定西红柿种质，根据番茄的45S rDNA序列设计引物，以西红柿基因组DNA为模板通过PCR方法扩增出ITS（internal translation spacer）序列，在克隆测序的基础上对番茄属两个野生种与三个栽培种进行分子鉴定与亲缘关系分析。结果表明：（1）五个供试材料ITS序列的变异小，GC含量高，为57.0%~65.4%。（2）用不同的聚类方法分析发现三个栽培种供试材料亲缘关系较近，而野生种醋栗番茄（Solanum pimpinellifolium）都处于不同的分支类群，表明其与其他品种亲缘关系相对较远，同时发现其生物学特性与其他品种明显不同。
- 蒋向辉佘朝文许栋张青桦赵旺
- 关键词：西红柿ITS序列种质资源鉴定
- 七叶一枝花基于ITS序列的DNA条形码构建研究被引量：9
- 2010年
- 目的为便于准确鉴定七叶一枝花品种,控制药材质量,进行基于ITS序列的条形码构建研究。方法在对怀化野生七叶一枝花、大理重楼、华重楼及花叶重楼进行表型比较的基础上,进一步对ITS序列进行克隆测序,并用MEGA4.0软件进行聚类分析。结果供试种质表型相似,仅在植株高度,叶片数目,叶片形状与颜色等方面略有不同,怀化野生七叶一枝花ITS序列长为660 bp,GC含量为56%,聚类分析表明,与其他3个材料为重楼属同一个种。结论 ITS序列的长度在属内种间较为保序,碱基组成有明显差异,可用于七叶一枝花DNA条形码的构建。
- 蒋向辉佘朝文许栋张青桦
- 关键词：七叶一枝花ITS序列DNA条形码重楼属碱基组成华重楼
- 杉木CAD基因生物信息学分析被引量：2
- 2009年
- 杉木CAD片段为信息探针,利用序列拼接方法获得了738bp的cDNA序列.利用MEGA4.0软件对不同进化层次的代表植物相应CAD基因进行比对,构建系统进化树.利用生物信息学方法分析了杉木CAD基因的结构与功能,其中包括核苷酸序列的组成、ORF识别、CpG岛、限制性酶切位点分析、卷曲螺旋、亲水性、糖基位点及二级结构.结果表明:杉木与铁杉的CAD基因具有99.00%的同源性;该序列在88～737bp片段上有一个开放性阅读框,该序列编码的是一个碱性蛋白,亲水性较强,疏水性较弱,信号肽序列为第1位～第11位,二级结构以α-螺旋(27.50%)与不规则盘绕(41.50%)为主,延伸链(22.50%)也是该蛋白的重要结构元件,β转角区域仅为8.50%.
- 佘朝文许栋张青桦蒋向辉
- 关键词：杉木生物信息学
- CODEHOP在线简并引物设计与杉木4CL基因片段克隆被引量：9
- 2009年
- 利用CODEHOP设计4CL酶的简并引物,利用设计的3对简并引物进行RT—PCR,从杉木幼茎中克隆到2个长度分别为502 bp和536 bp的PCR产物,产物经pMD18—T载体克隆转化至DH5α大肠杆菌中,序列通过Blastx检索与Genbank进行同源性比对后,发现2片段都与其它植物的4—CL基因具有较高的氨基酸序列同源性。研究表明,该程序设计的简并引物可信性强,阳性率高。该基因的成功克隆将为研究杉木木质素的合成提供科学依据。
- 佘朝文蒋向辉许栋张青桦赵旺
- 关键词：CODEHOP克隆
