国家科技重大专项(2012ZX10004-210)
- 作品数：57 被引量：498H指数：12
- 相关作者：陈瑜崔大伟谢国良杨先知郑书发更多>>
- 相关机构：浙江大学医学院附属第一医院浙江大学中国人民解放军更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项浙江省医药卫生科学研究基金浙江省湖州市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 湖州地区食源性腹泻患者粪便细菌病原学特征分析被引量：2
- 2018年
- 目的了解湖州地区食源性腹泻病原谱的分布特征，可疑中毒食物范围和感染的季节分布为临床诊断和制定防控措施提供依据。方法通过对湖州地区2016年食源性腹泻患者的粪便进行细菌病原学检测，并对检测结果进行分析。结果510例食源性腹泻患者的粪便共分离得到病原菌110株，检出率21．57％，检出的病原菌包括致泻性大肠杆菌60株11．76％（60／510）、副溶血性弧菌41株8．04％（41／510）、沙门菌5株0．78％（5／510）、气单胞菌3株0．59％（3／510）、其它肠道病原菌2株0．40％（2／510），志贺氏菌未检出。510例食源性腹泻患者中主要可疑食物为肉类与肉制品24．2％，果蔬类占18．1％，混合多种食品占17．1％，水产品类占13．9％。结论湖州地区食源性腹泻感染高发期为8月份，病原菌前三位是致泻性大肠杆菌，副溶血性弧菌，沙门菌，同时肉类和肉制品、果蔬类、混合多种食品和水产品是可能的污染食品。
- 周丽华王萍强鑫华柳秋霞
- 关键词：病原谱季节性分布
- 双重荧光定量PCR检测志贺毒素stx1和stx2基因被引量：2
- 2017年
- 目的建立一种双重荧光定量PCR检测志贺毒素stx1和stx2基因的方法。方法根据不同细菌来源的stx1和stx2序列,设计PCR引物和TaqMan探针,建立双重实时荧光定量PCR检测体系,进行灵敏度、特异性和重复性评价,并对腹泻患者粪便样本进行检测分析。结果双重实时荧光定量PCR检测含志贺毒素基因重组质粒的最低检测下限为102 copies/mL;该法对12种常见肠道病原菌均无特异性扩增,对不同浓度的标准质粒检测重复性高,Ct值变异系数均小于10%;对急性腹泻粪便标本的检测阳性率高于细菌分离培养。结论建立的双重实时荧光定量PCR可作为不同细菌来源的志贺毒素基因的快速鉴定方法,亦可用于人感染性腹泻标本的快速筛查。
- 陆芸王若南谢国良余斐郑书发陈晓
- 关键词：志贺毒素实时荧光定量PCR
- 食源性腹泻副溶血弧菌分离株调查分析被引量：2
- 2018年
- 目的 分析食源性腹泻患者副溶血弧菌（VP）季节分布及感染患者年龄特征、毒力基因、血清学分型.方法 对2014年1月至2016年12月急性腹泻患者粪便分离的125株副溶血弧菌进行常规培养、血清分型及PCR毒力基因检测.结果 副溶血弧菌感染发生有明显的季节性,夏秋季高发,尤以6～10月份为高峰期.感染患者中21～30岁占37.6％,31～40岁占24.8％.分离得到17个血清型,其中O3：K6占59.2％.经单重PCR进行毒力基因检测显示：tdh＋/trh-分离株所占比例为88.0％,tdh-/trh-分离株为6.40％,检测到2株携带（tdh＋/trh＋）基因.结论 湖州地区副溶血性弧菌感染发生呈明显的季节分布特征,且感染的患者以青壮年居多,优势血清型为O3：K6;多数菌株携带tdh＋/trh-毒力基因.
- 强鑫华周丽华王萍柳秋霞
- 关键词：副溶血弧菌季节性分布血清分型毒力基因
- 人感染高致病性H5N6禽流感病毒的分子生物学特征被引量：10
- 2016年
- 目的分析2014-2015年3例新型人感染高致病性禽流感（HPAI）H5N6毒株的血凝素（HA）与神经氨酸酶（NA）基因序列,探讨该病毒的遗传变异及分子生物学特征。方法收集Gen Bank、全球共享禽流感数据倡议组织（GISAID）及浙江大学传染病诊治国家重点实验室提供的H5N6病毒基因序列,利用生物信息软件MEGA6.0及Net Nglyc服务器对基因序列进行遗传进化和分子变异特征分析。结果 3例感染HPAI-H5N6患者毒株的HA与NA氨基酸序列的同源性分别为96.5%～98.7%和90.1%～98.2%;HA氨基酸序列比对分析发现A/Guangzhou/39715/2014（H5N6）和A/Sichuan/26221/2014（H5N6）与A/duck/Eastern China/1111/2011（H5N2）同源性最近,分别为97.7%和98.5%;A/Yunnan/0127/2015（H5N6）与A/muscovy duck/Vietnam/LBM631/2014（H5N1）同源性最近（97.2%）;NA氨基酸序列比对分析发现A/Guangzhou/39715/2014（H5N6）和A/Yunnan/0127/2015（H5N6）与A/swine/Guangdong/K6/2010（H6N6）同源性最近,分别为97.2%和97.6%,A/Sichuan/26221/2014（H5N6）与A/duck/Guangdong/S3073/2010（H6N6）同源性最近（97.4%）;进化树分析显示3例患者毒株处于2个不同的分支;HA基因包含有S137A、T160A等突变,糖基化分析显示有6～7个N-糖基化位点。结论新型人感染HPAI-H5N6病毒是一种重组病毒,其HA基因来源于亚洲禽类H5亚型,NA基因来源于亚洲禽类H6N6;HA基因位点突变及N-糖基化改变可能有助于增强对人类的感染。
- 高敏崔大伟杨先知谢国良车飞虎孙海燕陈瑜
- 关键词：血凝素神经氨酸酶N-糖基化
- 2010-2013年杭州地区甲型流感H3N2分子流行病学分析被引量：4
- 2016年
- 目的对2010-2013年杭州地区甲型流感H3N2进行分子流行病学调查分析。方法收集2010-2013年杭州地区H3N2监测样本数据,对样本数据按年份、性别以及年龄进行分组,比较各组之间的差异。查询、整理GenBank中的中国H3N2序列并建立数据集,并对国内H3N2的HA基因及2010-2013年杭州地区H3N2病毒HA、NA序列进行系统生物进化分析。结果 2010-2013年杭州地区H3N2感染率分析,不同年度间H3N2感染率差异具有统计学意义(χ2=14.004,P<0.05),不同性别和年龄组间差异无统计学意义(χ2=3.552,χ2=2.691,P>0.05)。杭州地区2010年与2012、2013年H3N2感染病毒株,在系统进化树上分布存在两个不同分支,且HA序列进化属于广东省H3N2进化的不同时间点的两个分支,在国内H3N2系统进化树上存在一类未见人类感染的病毒分支。结论 H3N2感染无性别选择性及年龄差异,不同年度的感染率存在差异;杭州及我国多省市流行的H3N2感染存在广泛迁徙的现象,今后仍然具有引起高致病性大规模流行的能力,因此应加强各地监测及信息共享,做到早发现和及时防控。
- 汪艳戴玉柱崔大伟杨先知谢国良成军孙长贵王国政金美彤李静云陈瑜
- 关键词：流行病学调查系统进化分析
- 2013-2015年浙江地区哨点医院H3N2甲型流感病毒感染患者临床特点与流行病学特征被引量：3
- 2016年
- 目的分析2013-2015年浙江地区哨点医院监测纳入的H3N2甲型流感病毒感染患者的临床特点及流行病学特征。方法对2013年1月至2015年12月浙江地区8家哨点医院纳入的符合急性呼吸道感染（acute respiratory infection,ARI）定义的病例进行流行病学和临床信息调查,采集呼吸道标本进行流感病毒核酸检测。按检测结果将病例分为H3N2阳性组和流感阴性组,分析两组病例流行病学和临床特征。结果 2013-2015年浙江地区8家哨点医院共纳入7 602例急性呼吸道感染,其中实验室确诊H3N2病例490例（占6.4%）。浙江地区连续3年的监测共出现3次发病高峰,分别是2013年12月-2014年3月、2015年1-3月和2015年7-8月。H3N2病例年龄中位数为50岁,其中男性占62.0%,慢性基础性疾病史、恶性肿瘤病史及吸烟史的患者在H3N2阳性组的比例高于流感阴性组,差异有统计学意义（其中慢性基础性疾病史χ~2=6.600、7.519、3.875、53.719、3.997、31.086、63.789、21.309和53.95;恶性肿瘤史χ~2=55.316;吸烟史χ~2=14.418,P值均〈0.05）。H3N2阳性组出现排痰性咳嗽、咯血、X线/CT表现异常和肺部听诊异常的比例较流感阴性组高,而H3N2阳性组白细胞总数和血小板总数较流感阴性组低,差异均有统计学意义（排痰性咳嗽χ~2=82.703,咯血χ~2=104.807,X线/CT表现异常χ~2=5.114,肺部听诊异常χ~2=11.823;白细胞总数t=-2.602,血小板总数t=-3.488,P值均〈0.05）。结论浙江地区H3N2流感多发生在冬春季和夏季,具有慢性基础性疾病及肿瘤等病情的患者是感染的高危人群。
- 孙海燕崔大伟车飞虎高敏杨先知谢国良陈瑜
- 关键词：流感甲型流感病毒H3N2亚型流行病学特征
- 肠道外感染气单胞菌属的临床分布与耐药性分析被引量：16
- 2015年
- 目的了解临床肠道外感染气单胞菌属的分布特点及耐药率,为临床治疗气单胞菌属感染提供参考。方法对2001-2011年肠道外标本中分离的304株气单胞菌属分布和耐药性进行回顾性分析,数据采用SPSS17.0进行统计处理。结果 11年间共分离到肠道外气单胞菌属304株,以嗜水气单胞菌为主,共188株占61.8%;标本来源以血液为主,共96份占31.6%;气单胞菌属对氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢唑林、阿莫西林/克拉维酸和四环素耐药率均>50.0%,不同标本类型或不同种间气单胞菌属对抗菌药物的耐药率有差异。结论肠道外气单胞菌属感染以嗜水气单胞菌为主,且以中老年人和夏秋季多见,临床医师应了解气单胞菌属的耐药特点,根据药敏结果合理选择抗菌药物。
- 方海英李医陈晓余斐郑书发张文陈瑜
- 关键词：肠道外感染气单胞菌属耐药性
- 中国26省(直辖市、自治区)2011-2014年5岁以下儿童腹泻病例轮状病毒流行特征分析被引量：70
- 2016年
- 目的了解我国5岁以下儿童腹泻患者中轮状病毒的流行特征。方法在国内26省（直辖市、自治区）162家医院的门/急诊中开展腹泻监测,收集腹泻病例临床和流行病学资料,同时采集病例粪便标本,送92家网络实验室采用酶联免疫吸附试验（ELISA）、反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）和巢式PCR等方法检测轮状病毒,并分析2011 2014年不同时间、不同地区5岁以下儿童腹泻患者中轮状病毒检出率以及不同基因型的变异变迁情况。结果在19 849例儿童腹泻病例中,22.9%的病例检出轮状病毒,其中,1~2岁和6月龄至1岁儿童检出率最高,分别为29.0%和26.1%。轮状病毒在水样便中检出率最高,为26.2%。轮状病毒在冬季检出率最高,为39.4%,夏季检出率最低,为9.9%。轮状病毒在我国南部和中部地区的检出率最高,分别为28.0%和27.0%。A组轮状病毒为常见的血清型,占95.1%,其中G9 P[8]、G1 P[8]和G3 P[8]最为常见,分别占39.5%、16.8%和9.9%。2011年以来,G9 P[8]逐渐取代G1 P[8]和G3 P[8]成为目前我国最主要的流行株。结论轮状病毒是我国5岁以下儿童腹泻的常见病原体,并且呈现明显的时间和空间流行特征,G9 P[8]为主要流行株。
- 耿启彬赖圣杰余建兴张子科杨婉琪李中杰吴建国杨维中
- 关键词：轮状病毒腹泻病哨点监测基因分型
- 高通量测序平台测定混合病毒样品基因组序列(英文)
- 2014年
- 目的建立RNA病毒基因组的从头测序方法,验证高通量测序平台同时测定不同RNA病毒基因组序列的能力。方法选取日常监测工作中分离的一株EV71毒株和一株季节性流感病毒,提取病毒RNA,制备测序文库,按标准步骤在GS-Junior完成测序反应,分析数据。结果共得到超过14万序列片段,总计46.9M碱基,平均读长334bp。初步拼接可以得到914个片段(contig),而以相应参考毒株基因组为标准,一次反应得到EV71全长基因组的99.84%及流感病毒的96.7%。结论高通量测序仪能够同时快速、准确地从头测定多株RNA病毒基因组序列,适合应用于多个病原生物学领域。
- 张拥军陈炜翁育伟谢剑锋何文祥吴冰珊郑奎城严延生
- 关键词：高通量测序肠道病毒71型流感病毒基因组
- 急性腹泻患者类志贺邻单胞菌流行及药物敏感性分析被引量：7
- 2015年
- 目的了解类志贺邻单胞菌在急性腹泻患者中的分布及对常用抗菌药物的敏感性,为疾病的预防和临床治疗提供依据。方法收集2012年6月至2013年12月期间浙江省4家医院急性腹泻患者病例,采用常规微生物检验程序对常见肠道致病菌进行分离培养及检测。分离到的类志贺邻单胞菌采用K-B法进行药物敏感性试验。结果收集1 640例病例,共分离到类志贺邻单胞菌共41株,检出率为2.5%,占所有分离菌株的7.5%,居细菌性病原第四。41例病例中,男女检出率分别为2.6%和2.4%,差异无统计学意义;患者半数以上分布在18-44岁;每月均能够分离到类志贺邻单胞菌,其中夏季（6-8月）分离率最高,达3.9%。类志贺邻单胞菌对氨苄西林耐药率高达89.3%,对阿米卡星、复方新诺明、庆大霉素耐药率分别在30%-50%,未出现对头孢哌酮-舒巴坦、哌拉西林-他唑巴坦、亚胺培南及美罗培南耐药株。结论类志贺邻单胞菌是沿海地区夏秋季腹泻较为常见的病原菌之一,是临床肠道感染中不可忽视的病原。
- 王若南李医陈晓万颖陈瑜
- 关键词：急性腹泻类志贺邻单胞菌抗菌药物耐药性
