国家自然科学基金(31070828)
- 作品数：2 被引量：5H指数：2
- 相关作者：焦雄王美华田绪红常珊宋婕更多>>
- 相关机构：太原理工大学华南农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 蛋白质氨基酸网络研究进展被引量：3
- 2011年
- 氨基酸网络是运用复杂网络工具对蛋白质结构-功能关系研究的新方法。本文回顾了氨基酸网络中常用网络参量的计算方法,如:度分布,聚集系数,平均最短路径等。结合本研究小组的工作,介绍了常用的网络构建和分析方法,并总结了氨基酸网络在蛋白质折叠以及蛋白质分子对接问题中的应用。最后,分析了氨基酸网络研究目前存在的主要问题,并对未来的工作进行了展望。
- 常珊焦雄王美华田绪红
- 关键词：蛋白质复杂网络
- 整合素黏附体信号转导通路预测研究被引量：2
- 2016年
- 目的运用生物信息学方法预测整合素黏附体信号蛋白间的信号转导通路,为以实验方法研究整合素相关信号转导通路的机制提供参考。方法把相互作用的整合素黏附体信号分子对搭建成相互作用网络;利用相互作用的置信概率构建边权;然后,采用动态规划算法计算出最小权重的线性通路,再把这些线性通路组装成通路网络。结果从147个整合素黏附体蛋白所组成的736对相互作用中预测出7个信号通路网络,并计算出各个通路网络中基因本体论注释蛋白的占有率。结论对信号转导通路的研究能够在分子水平上探索疾病的发病机制。预测出可能的信号通路网络,不仅为基础医学研究疾病机制提供有用信息,也为探索包括力学、化学等外界信号刺激下的信号转导通路提供有益参考信息。
- 张晓盼宋婕焦雄
- 关键词：信号转导通路动态规划算法
