国家重点基础研究发展计划(无)
- 作品数:2 被引量:63H指数:2
- 相关作者:孙效文耿波欧阳洪生童金苟梁利群更多>>
- 相关机构:中国水产科学研究院黑龙江水产研究所中国科学院吉林大学更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 利用17个微卫星标记分析鳙鱼的遗传多样性被引量:58
- 2006年
- 选用实验室克隆的17个鳙鱼微卫星分子标记分析四川泸州和江西鄱阳湖的两个种群鳙鱼的遗传多样性及种质特性,计算和统计了杂合度、多态信息含量(P/C)、有效等位基因数、等位基因频率、遗传距离、遗传相似系数、Hardy-Weinberg平衡偏离指数等方面内容。结果表明:选择使用17个微卫星标记,其中有4个为单态标记,13个为多态标记。江西和四川鳙鱼群体每个微卫星位点的平均等位基因数分别为3.325及3.882,平均有效等位基因数分别为3.531及2.676,多态位点百分率分别为82.4及70.5,17个微卫星标记共有等位基因71个,多态微卫星位点的P/C在0.0770.960之间变动,平均为0.417,两群体位点平均观测杂合度为0.385和0.360,平均期望杂合度为0.452和0.422,两个群体间的遗传相似系数为0.897,群体间的遗传距离为0.109。
- 耿波孙效文梁利群欧阳洪生童金苟
- 关键词:微卫星标记鳙鱼等位基因频率
- 黑龙江野鲤细菌人工染色体基因组文库构建被引量:5
- 2009年
- 为了开展鲤基因组研究,深入研究遗传连锁图谱遗传标记的定位及数量性状的定位和克隆,并最终为分子育种提供服务,本实验构建了鲤的BAC基因组文库。通过采集黑龙江野鲤(Cyprinus caxpio haematopterus)全血细胞制备琼脂糖凝胶包埋块的方法获得了高分子量(HMW)DNA。通过BamHⅠ部分酶切和PFGE电泳分离选择获得100~300kb的DNA片段,用电洗脱和透析的方法对产物进行浓缩和纯化。纯化的HMWDNA连接到大小为7.2kb的克隆载体pEZBAC上。为了评估构建的文库的质量使用一系列引物对文库进行了验证。本研究首次构建黑龙江野鲤的BAC文库,该库含有46656个克隆,插入片段大小在50~300kb之间,平均大小在100kb左右,覆盖鲤全基因组2.45倍,调取任一基因的概率为90%左右。获得的BAC克隆,保存在378块96孔板和27块384孔板中。建立了高效稳定的2步3维PCR筛选黑龙江野鲤BAC文库的方法。本实验为今后进一步进行鲤的功能基因定位及染色体步行、BAC-FISH等研究工作打下重要基础。
- 耿波关云涛孙效文
- 关键词:黑龙江野鲤基因组文库