国家自然科学基金(31060006) 作品数:5 被引量:6 H指数:1 相关作者: 康颖倩 赵亮 王梅竹 陈玉如 曹煜 更多>> 相关机构: 贵阳医学院附属医院 贵阳医学院 千叶大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 教育部留学回国人员科研启动基金 贵州省社会发展科技攻关计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
Genotypes of Candida albicans from clinical sources in Guiyang,China <正>Objectives:To investigate the genetic diversity of Candida albicans associated with vaginal and systemic ca... KANG Ying-Qian~1 WANG Mei-Zhu~1 ZHAO Liang~1 CHEN Yu-Ru~1 BAI Feng-Yan~(2*) (1 Teaching and Research Section of Microbiology,Guiyang Medical College,Guiyang 550004,China文献传递 云贵地区淡水湖中类蛭弧菌的多样性分析 目的对云贵地区阿哈湖、百花湖及云南滇池不同深度的湖水中分离的类蛭弧菌进行分类鉴定,深入了解云贵地区淡水中类蛭弧菌多样性,发掘研究云贵地区的淡水类蛭弧菌资源。方法①利用筛选出的2株宿主菌株分离培养类蛭弧菌;②对分离出的类蛭... 刘涛华 曾佳 金方 陈玉如 牟丽丽 吕倩 王颜颜 康颖倩关键词:系统发育树 多样性 文献传递 新生隐球菌毒力差异菌株的全基因组测序及毒力相关基因的筛选 被引量:1 2016年 目的了解及分析新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neoformans var grubii)两组毒力差异明显的多位点微卫星型(multilocus microsatellite typing,MLMT)菌株的全基因组序列,筛选出引起其毒力差异的相关基因。方法选取毒力差异最为明显的不同基因型菌株各1株进行全基因组重测序,运用比较基因组学方法全面分析测序结果,使用非同义SNPs(non-synonymous SNPs,nsSNPs)、无义突变SNPs、产生移码突变InDels的策略广泛筛选差异基因。对筛选出的基因在所有实验菌株中进行DNA测序验证,并提取总RNA,采用快速扩增5’和3’cDNA末端(rapidamplificationof5’and3’cDNAends,RACE)技术,克隆后测序获得对应基因的完整cDNA全长序列信息。结果通过全基因组重测序,环境株IFM56731和临床株IFM56800均分别获得127倍和111倍覆盖率的有效数据。分别对SNPs和InDels数据进行统计分析,应用无义突变SNPs和产生移码突变的InDel分别筛选出3个差异基因。对筛选出的6个基因在所有实验菌株中进行扩增测序,并对其中3个基因进行cDNA的测序分析,最终确定基因CNAG_01032的转录序列位置和结构,并验证了预测的无义突变位点存在于实际的mRNA中。结论本研究通过全基因重测序数据分析证明,应用无义突变SNPs和产生移码突变的InDels进行差异基因筛选的策略具有较好针对性,并筛选出6个潜在与毒力相关的基因,通过对所有实验菌株的测序和对全长cDNA的测序验证,最终筛选出基因CNAG一01032为可能引起菌株毒力差异的基因。 刘涛华 王颜颜 陈玉如 赵亮 吕倩 牟丽丽 康颖倩关键词:全基因序列分析 毒力 贵州贵阳及广西柳州地区新生隐球菌临床株微卫星基因分型对比研究 目的:了解贵阳及柳州地区新生隐球菌临床株的种群分布特点及多位点微卫星基因分型(multilocus microsatellite typing,MLMT)规律,探讨微卫星分型与新生隐球菌流行分布的相关性。方法:从贵州贵阳... 赵亮 唐秀文 康颖倩 罗红梅 金方 王梅竹 陈玉如植物精油组份松油烯-4-醇抗真菌作用研究 目的:研究松油烯-4-醇对白色念珠菌、近平滑念珠菌、新生隐球菌、红色毛癣菌的体外抗真菌效果,以及对白色念珠菌超微结构和其两种致病性胞外酶的影响,进一步丰富松油烯-4-醇的抗真菌理论,为以后其深度开发及新型抗真菌药的研究提... 瞿任 康颖倩 赵亮 曹煜关键词:松油烯-4-醇 逆转录聚合酶链式反应 粪肠球菌导致两例新生儿肠炎的病原学分析 目的通过形态学及分子生物学方法分离及鉴定贵阳某医院新生儿科病房新生儿便血中的病原菌,结合医院诊断,分析新生儿便血原因,辅助临床诊断与治疗:方法1.直接标本涂片镜检观察鉴定;2.采用营养肉汤培养基富集培养,通过形态学观察结... 牟丽丽 王颜颜 刘涛华 吕倩 金方 康颖倩关键词:粪肠球菌 耐药 文献传递 姜黄挥发油组份中芳姜黄酮的抗红色毛癣菌体外实验的研究 目的 通过体外红色毛癣菌的培养,体外药敏试验,研究芳姜黄酮对红色毛癣菌的抑菌作用机理,为进一步的临床试验及基础研究奠定基础,并为研制抗红色毛癣菌新型制剂开发利用提供科学依据.方法:1.通过气相色谱质谱联用仪对姜黄挥发油进... 艾平 康颖倩 赵亮 曹煜关键词:姜黄挥发油 药敏试验 体外实验 红色毛癣菌 新生隐球菌格鲁比变种表型变异菌株的基因及毒力对比研究 被引量:1 2012年 新牛隐球阕(Cryptococcus neofor-mans)属于真菌界担子菌门隐球菌属,是临床上的致病真菌,可致器官移植等免疫抑制患者发生新生隐球菌病。 赵亮 王梅竹 曹煜 贺娟 金方 陈玉如 苑天红 罗红梅 康颖倩关键词:毒力 基因 表型 变种 致病真菌 隐球菌属 贵州地区感染外阴阴道念珠菌病的白念珠菌微卫星多态性研究 被引量:1 2014年 目的:调查贵州地区感染外阴阴道念珠菌病( vulvovaginal candidiasis , VVC)的白念珠菌CAI区微卫星基因型分布及其与当地VVC流行病学之间的关系。方法收集贵州地区90株引起VVC的白念珠菌菌株,对其进行CAI区单链构象多态性( single strand conformation polymorphism , SS-CP)及GeneScan分析,对贵州地区VVC患者白念珠菌进行了基于CAI区微卫星分型,运用SPSS19.0软件对分离的白念珠菌进行基因多态性及聚类分析,并采用logistic 回归模型分析白念珠菌CAI区微卫星基因型分布与VVC的关系。结果90株VVC来源的白念珠菌中共有27种CAI-SSCP 图谱,结合GeneScan 分析结果证实为27种基因型,3种主要优势基因型30-45、32-46、30-46以及其他7种与其非常接近的基因型共63株,占70.0%;聚类分析将贵州地区白念珠菌分为3个群系( ClusterⅠ~ClusterⅢ),其中优势基因型全部聚类为Cluster Ⅱ;logistic 回归分析显示,白念珠菌优势基因型对VVC具有高危险度比值比(OR=4.3)。结论贵州地区感染VVC的白念珠菌的CAI基因型呈明显的优势分布,这些优势基因型与贵州地区VVC的发生高度相关。 王梅竹 曹煜 徐小珊 张佩芳 牟丽丽 白逢彦 康颖倩关键词:单链构象多态性分析 白念珠菌 基因分型 新生隐球菌毒力相关基因的重测序筛选及基因敲除实验研究 本研究主要探讨可用于筛选引起新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neoformans var.grubii.)毒力差异相关基因的有效方法策略,并从中筛选和验证与毒力相关的差异基因。实验中筛选了毒力差异明显的两... 陈玉如 赵亮 金方 牟丽丽 刘涛华 吕倩 王颜颜 康颖倩关键词:新生隐球菌 毒力基因 基因敲除 文献传递