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适于蛹虫草遗传多样性研究的线粒体分子标记的筛选被引量：9: 2015年; 【目的】从蛹虫草线粒体DNA中寻找适于遗传多样性研究的分子标记。【方法】通过PCR扩增和序列分析,比较了20个蛹虫草菌株在12个线粒体DNA片段和3个细胞核DNA片段上的序列变异。【结果】蛹虫草在线粒体DNA上的变异水平高于核DNA,主要表现为线粒体基因内含子的插入缺失多样性和较多的碱基变异位点。不同线粒体DNA片段的变异水平也有差异,而且内含子蛋白比外显子编码的蛋白质更易发生氨基酸的改变。增加使用的分子标记数目,其所揭示的遗传多样性程度也在逐渐提高。【结论】我们依次推荐nad3-cox2、cox2-nad5、cox2、cox3、cob和cox1这6个线粒体DNA位点用于今后蛹虫草遗传多样性或群体遗传结构的分析。; 张永杰郭丽宏张姝刘杏忠; 关键词：蛹虫草线粒体DNA 分子标记

冬虫夏草菌交配型基因MAT1-2-1的克隆与分析: 冬虫夏草作为一种传统名贵中药材，尚未实现商业化栽培.一个关键的问题是从人工接种形成的僵虫上很难生长出子座.真菌的交配方式是其有性生殖的决定性因素，但冬虫夏草菌的交配型基因迄今尚未进行研究.本研究通过PCR克隆了冬虫夏草菌...; 张永杰张姝刘杏忠文华安旺姆; 关键词：冬虫夏草人工栽培

利用CTAB法和子囊孢子破壁法提取冬虫夏草菌DNA被引量：5: 2013年; 通过CTAB法从冬虫夏草菌株和天然冬虫夏草不同部位提取DNA,并用PCR扩增进行验证,证明了CTAB法适合从冬虫夏草子座、菌核和冬虫夏草菌培养物中提取DNA。首次报道1种将子囊孢子破壁直接进行PCR扩增的方法,并比较了该方法和CTAB法在提取冬虫夏草DNA方面的差异。2种方法获得的DNA用于PCR扩增均能得到较好的结果。; 李渊张永杰刘杏忠白飞荣; 关键词：冬虫夏草 DNA提取 PCR扩增 CTAB法

冬虫夏草菌3个细胞核蛋白编码基因的分子进化被引量：4: 2015年; 【目的】分析3个细胞核蛋白编码基因(csp1、MAT1-1-1和MAT1-2-1)在不同冬虫夏草菌株间的分子进化。【方法】从125个冬虫夏草样品中分别扩增csp1、MAT1-1-1和MAT1-2-1基因序列,比较外显子和内含子间以及2个交配型基因间的序列变异程度,比较基于不同基因或基因区域所构建的系统发育树拓扑结构的差异,分析3个基因承受的选择压力和DNA重组情况。【结果】3个蛋白编码基因外显子区的长度在不同菌株间高度保守,具有4.5%-5.7%的变异位点;内含子区的长度在不同菌株间相同或不同,具有1.8%-22%的变异位点。对于2个交配型基因,MAT1-1-1的碱基变异率低于MAT1-2-1。基于外显子与内含子构建的系统发育树的拓扑结构,以及基于2个交配型基因外显子构建的系统发育树的拓扑结构都存在明显差异。3个蛋白编码基因都经历着净化选择作用。基因内部的不同DNA位点间有重组,但3个基因片段之间没有明显的重组发生。【结论】由于冬虫夏草菌不同基因以及基因的不同区域表现出进化上的差异,所以在开展冬虫夏草菌进化相关的研究时,应该联合使用多个不同的基因片段。; 张姝张永杰; 关键词：冬虫夏草菌丝氨酸蛋白酶基因分子进化

冬虫夏草菌和蛹虫草菌的研究现状、问题及展望被引量：124: 2013年; 冬虫夏草菌和蛹虫草菌是两种最著名的虫草菌。从分类学地位、分布、生活史及有性生殖类型、寄主范围、遗传多样性、分子遗传学和基因组学、生态学、人工栽培及产品开发等方面对冬虫夏草菌和蛹虫草菌的研究现状进行总结,指出了研究中存在的一些问题,并对研究前景进行展望。; 张姝张永杰SHRESTHA Bhushan徐建平王成树刘杏忠; 关键词：冬虫夏草菌有性生殖分子遗传学基因组学生态学人工栽培

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国家教育部博士点基金(20101401120007)