重庆市杰出青年科学基金(CSTC2010BA1007)
- 作品数：4 被引量：17H指数：2
- 相关作者：王金勇陈磊潘红梅吴霞黄微更多>>
- 相关机构：重庆市畜牧科学院四川农业大学更多>>
- 发文基金：重庆市杰出青年科学基金国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学经济管理生物学更多>>
- 荣昌猪SLA-DQB基因β1结构域突变分析及蛋白质序列模式预测被引量：3
- 2012年
- 为了深入了解荣昌猪SLA-DQB基因β1结构域的变异及蛋白质序列模式分布情况,对53头荣昌猪SLA-DQB基因的β1结构域进行了克隆测序和序列多重比对,并在线预测蛋白质序列模式。结果发现,222bp区域内存在9个单核苷酸的插入位点、16个单核苷酸的缺失位点和89个SNPs位点。74个氨基酸中仅由SNP位点导致的氨基酸变异位点共37个,其中有24个位点氨基酸的类型发生变化。对50条SLA-DQB基因β1结构域蛋白质序列分析发现7种类型共174个蛋白质序列模式位点。单条序列中蛋白质序列模式位点最多的12个,最少的2个。蛋白质序列模式突变位点主要发生在第9、26、45、53、61个氨基酸上,涉及到5种类型蛋白质序列模式位点的改变。结果提示,荣昌猪SLA-DQB基因β1结构域存在丰富的遗传变异和多样化的蛋白质序列模式。
- 白小青刘文黄微王鹏孙艳王金勇
- 关键词：荣昌猪SLA-DQB突变分析
- 三十年来我国生猪养殖区域分布变化趋势被引量：11
- 2013年
- 生猪生产不仅在我国肉类生产中占主导,而且在世界畜禽生产中占据举足轻重的地位。本文通过分析1981—2011年我国各省区的生猪养殖量和玉米产量等统计数据,揭示30年间我国生猪养殖区域分布变化趋势。分析发现,生猪生产区域逐渐向粮食主产区集中,中部地区的优势地位开始凸显,西南、华东生猪养殖优势区的地位逐渐下降,到2011年华中、西南、华东3个地区的生猪出栏量几乎持平,共占全国总出栏量的69.6%。预测华中地区的优势地位会继续升高,华北、东北生猪出栏量会继续增加,西南、华东、华南生猪占全国总出栏量的比例会逐渐下降。
- 吴霞陈磊潘红梅王金勇
- 关键词：生猪养殖
- 细胞内脂滴定量分析的方法比较被引量：1
- 2014年
- 为找出准确定量分析细胞脂滴的方法,以猪卵母细胞为模型,利用2种非破坏性的形态学方法——三维重建分析法和平面光密度法,通过荧光染料特异性标记脂滴,对单个细胞内脂滴含量进行准确定量和对比分析。结果表明:2种方法都能根据荧光图像定量细胞内脂滴,并统计出脂滴大小、密度和分布规律等指标;随机选取100个脂滴含量不等的卵母细胞,三维重建分析法能更准确地反映样本脂滴含量变异情况(变异系数C.V.=0.86),而光密度法的C.V.=0.68;针对同一细胞不同角度的重复观察,三维重建分析法具有更好的重复性(变异系数C.V.=0.07,组内相关系数ICC>0.9),而光密度法C.V.=0.37、ICC<0.4。因此基于激光共聚焦扫描的三维重建法能够更准确地对细胞内的脂滴含量进行定量分析。
- 秦先红潘红梅张亮陈磊王金勇朱砺
- 关键词：细胞分析方法
- 荣昌猪杂交群体基因组拷贝数变异鉴定与分析被引量：2
- 2014年
- 为找出可能的性状相关遗传标记,本研究利用猪SNP60芯片对150头荣昌猪杂交群体基因组拷贝数变异区域(CNV regions,CNVRs)进行检测。结果,发现5个CNVRs,其中缺失CNVRs 3个(CNVRs 2,4,5),重复CNVRs 2个(CNVRs 1,3),分别位于1、7、8、13、14号染色体上。其中CNVR1和CNVR5为新发现的CNVRs,CNVR2和CNVR3为已有报道但还未验证过的区域。采用qPCR方法对CNVRs进行拷贝数变异验证,发现CNVR2、CNVR3和CNVR5在多个猪种中都具有丰富多态性;而CNVR4为芯片假阳性结果。在qPCR验证的3个CNVRs中有46个蛋白编码基因,这些基因主要富集在嗅觉受体活性、乙醇代谢、神经系统发育以及脂肪酸代谢通路中。本研究结果为解析品种间表型变异的遗传基础提供了新的遗传变异素材。
- 龙熙邱小田陈磊王金勇李学伟
- 关键词：荧光定量PCR拷贝数变异
