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国家自然科学基金(31030014)

作品数:10 被引量:43H指数:4
相关作者:张大勇朱璧如张全国徐冰倪川更多>>
相关机构:北京师范大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学理学农业科学更多>>

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 7篇生物学
  • 2篇理学
  • 1篇农业科学

主题

  • 4篇杆菌
  • 4篇大肠杆菌
  • 3篇进化
  • 2篇适合度
  • 2篇土壤
  • 2篇土壤细菌
  • 2篇内蒙古草
  • 2篇内蒙古草地
  • 2篇焦磷酸
  • 2篇焦磷酸测序
  • 2篇
  • 2篇DIVERS...
  • 2篇草地
  • 2篇测序
  • 1篇多度
  • 1篇性状
  • 1篇生产力
  • 1篇生态学
  • 1篇生物多样性
  • 1篇适应性进化

机构

  • 8篇北京师范大学

作者

  • 8篇张大勇
  • 4篇张全国
  • 4篇朱璧如
  • 3篇徐冰
  • 3篇赵琳
  • 3篇倪川
  • 1篇姜新华

传媒

  • 5篇北京师范大学...
  • 2篇生物多样性
  • 2篇Journa...
  • 1篇生命科学

年份

  • 1篇2017
  • 3篇2016
  • 2篇2015
  • 1篇2014
  • 2篇2012
  • 1篇2011
10 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
Demographic trade-offs determine species abundance and diversity被引量:4
2012年
Aims Much recent theory has focused on the role of neutral processes in assembling communities,but the basic assumption that all species are demographically identical has found little empirical support.Here,we show that the framework of the current neutral theory can easily be generalized to incorporate species differences so long as fitness equivalence among individuals is maintained through trade-offs between birth and death.Methods Our theory development is based on a careful reformulation of the Moran model of metacommunity dynamics in terms of a non-linear one-step stochastic process,which is described by a master equation.Important Findings We demonstrate how fitness equalization through demographic trade-offs can generate significant macroecological diversity patterns,leading to a very different interpretation of the relation between Fisher’s a and Hubbell’s fundamental biodiversity number.Our model shows that equal fitness(not equal demographics)significantly promotes species diversity through strong selective sieving of community membership against high-mortality species,resulting in a positive association between species abundance and per capita death rate.An important implication of demographic trade-off is that it can partly explain the excessively high speciation rates predicted by the neutral theory of the stronger symmetry.Fitness equalization through demographic trade-offs generalizes neutral theory by considering heterospecific demographic difference,thus representing a significant step toward integrating the neutral and niche paradigms of biodiversity.
Da-Yong ZhangBo-Yu ZhangKui LinXinhua JiangYi TaoStephen HubbellFangliang HeAnnette Ostling
不同进化类型大肠杆菌的适合度频率依赖性
2016年
进化实验中使用竞争实验测量两个物种或基因型的相对适合度时,通常假定两者的适合度差异是恒定的。然而竞争双方的相互作用可能导致适合度差异受到初始相对频率的影响。本研究通过测量两种进化株系的大肠杆菌(Escherichia coli)在不同初始相对频率下的相对适合度,分析了初始相对频率对相对适合度的影响。结果发现高氮进化株系相对低氮进化株系的相对适合度随其初始相对频率的减小而增加,表现出显著的负频率依赖。两种株系在培养高氮株系的滤出液中均没有显著的生长,在培养低氮株系的滤出液中均有生长,但高氮株系的细胞加倍次数是低氮株系的3倍,说明导致适合度出现负频率依赖的原因可能是低氮株系的竞争能力较低,不能完全利用培养基中的资源;也可能是低氮株系的代谢产物能被高氮株系利用,产生互养作用。不同的相互作用可能导致不同的初始相对频率与相对适合度间的关系,因此,为了更准确地衡量适合度,进化实验中需要考虑初始相对频率对相对适合度的影响。
倪川朱璧如张大勇
关键词:他感作用
内蒙古草地土壤细菌生物多样性与生产力的相关关系分析
2015年
以内蒙古草地土壤细菌为研究对象,在3个不同的空间尺度上采集土壤样品,探讨内蒙古草地土壤细菌群落生物多样性与生产力之间的关系.内蒙古草地土壤细菌物种丰富度很高,达到上千个实用分类单元(OTUs);分属14个门,其中放线菌、变形菌和酸杆菌相对多度之和达80%以上.细菌群落生物量(每克干土DNA条带数)介于2.91×108~4.28×109条·g-1.稀化处理后的细菌OTUs数目、香侬-威纳指数和辛普森指数分别为721.79~1 023.47、5.84~6.21和82.98~229.02.但是,土壤细菌群落的生物多样性与生产力之间并不存在显著的相关关系,并且该模式与地理尺度无关.该结果暗示着该地区土壤细菌可能是中性或者近中性共存.
徐冰张全国卢函姝赵琳张大勇
关键词:土壤细菌生产力焦磷酸测序
Dispersal and recruitment limitation contribute differently to community assembly被引量:4
2012年
Aims The neutral theory of biodiversity has been criticized for being fragile with even slight deviations from its basic assumption of equal fitness among species.In response to this criticism,Hubbell((2001)The Unified Neutral Theory of Biodiversity and Biogeography.Princeton,NJ:Princeton University Press)proposed that competitive exclusion can be infinitely delayed by dispersal and recruitment limitation,thus making species effectively neutral.But the theoretical foundation for this claim still remains unclear and controversial,and the effects of dispersal and recruitment limitation are often confounded,especially in field studies.This study aims to provide an affirmative theoretical answer to the question of whether dispersal limitation and recruitment limitation can separately or jointly overwhelm the effects of fitness differences among species and lead to neutral community dynamics.Methods Computer simulations were used to investigate the effects of dispersal and recruitment limitation on delaying competitive exclusion in a homogeneous habitat in a spatially explicit context.Important Findings We found that even a slight competitive asymmetry would require extremely strong dispersal and recruitment limitation for neutrality to emerge.Most importantly,when the effects of dispersal and recruitment limitation were set apart,it is found that recruitment limitation is more effective in delaying competitive exclusion,whereas dispersal limitation tends to have a stronger impact on the general shape of both species abundance distributions and species–area relationships.
Zechen PengShurong ZhouDa-Yong Zhang
关键词:COMMUNITYDIVERSITYSADSAR
大肠杆菌对氮限制的适应性进化
2017年
自然界中生物常常面临氮资源限制,它们可能会采用不同的策略来适应.通过比较现存物种的研究认为生物采取的是节约氮的策略,而进化实验的研究发现生物提高了吸收氮资源的能力.这2类研究都有一些方法缺陷,因此本研究设计了一个更系统的进化实验,让大肠杆菌种群在2种氮资源环境中进化1 300代,分析其对不同氮资源环境的适应性进化.1 300代后,2种氮资源环境中进化的大肠杆菌株系适合度均提高,低氮进化株系适合度提升幅度大于高氮进化株系.与祖先相比,低氮株系氮质量分数和DNA质量分数均显著提高,碳、氮质量比显著降低,而高氮株系在RNA质量分数上显著提高.说明在本研究体系中,大肠杆菌采用了增强氮获取能力的策略来适应氮限制,而不是节约氮.
倪川朱璧如姜新华张大勇
关键词:相对适合度
基于过程的群落生态学理论框架被引量:28
2011年
如何解释群落的物种多样性是群落生态学的核心问题之一,贯穿于群落生态学的整个发展过程,至今仍未得到圆满解决。与这个问题有关的理论层出不穷,使得群落生态学研究产生了很多混乱,这种状况促使一些生态学家开始反思群落生态学是否一定要从群落结构出发?最近,一个新的、基于过程的理论框架为群落生态学提供了更有前景的发展方向。该理论框架认为群落的形成只包含了选择、漂变、成种和扩散这四个过程,不同的群落中四个过程的相对重要性不同,而各种群落生态学理论间的差别就在于强调了不同的过程。本文在介绍该理论框架的基础上,分析了已有的用于解释局域群落多样性的理论所包含的过程。其中,与生态位有关的理论主要强调了平衡选择的过程;局域与区域过程的共同作用理论强调了成种、扩散和选择的过程;而与生态漂变有关的理论则强调了漂变、成种和扩散的过程,但忽略了选择作用。在这个理论框架下,这些理论本身及其相互之间的关系显得更加清晰。
朱璧如张大勇
关键词:扩散群落多样性
利用实验细菌种群的元素表型尝试构建适应性景观
2016年
适应性景观这一概念激发了进化生物学领域内的许多研究,它的性质对预测种群进化过程具有重要意义.理论研究预测了多种景观的形态,但能被实验数据支持的还很少,因为实验构建适应性景观非常困难.一些微生物实验进化研究通过分析种群进化的可重复性,间接推测了景观的崎岖性,但不能给出其拓扑结构的具体信息.本研究尝试将适合度数据映射到表型空间的办法来直接呈现适应性景观的形态.共使用9个不同基因型的大肠杆菌株系作为祖先,对每个基因型建立6个重复家系,在一个限定养分的环境中对这54个种群进行了约1 100代的选择实验.在考察后代种群对选择环境响应(菌株的氮、磷质量分数w及适合度变化)的同时,利用进化断点处的实测数据信息,通过局域多项式回归拟合的方法,构建了基于细菌元素表型的适应性景观.研究发现,不同菌株家系对相同的选择环境表现出不同的响应模式;大部分后代种群相比其祖先提高了适应性;适应性景观呈现崎岖多峰的形态.
赵琳张全国张大勇
关键词:大肠杆菌
微生物多样性及其分布的研究进展:模式与过程被引量:7
2014年
生物多样性产生和维持机制长期以来是生态学研究的核心问题。人们通过实验观察和理论推导揭示了很多群落生物多样性的共有模式及其背后的生态学过程,而相关的工作主要集中在动植物等大型生物中。微生物是地球上数量最多、分布最广,以及在生态系统过程中发挥极其重要作用的生物类群,但人们对其群落多样性的认识还非常有限。将介绍目前人们对能够独立自由生活的微生物多样性分布模式的探索,总结对其背后的生物学和生态学过程的研究现状,并探讨当前面临的挑战。
徐冰张大勇
关键词:生物多样性微生物
内蒙古草地土壤细菌区域分布与局域多度的关系
2015年
物种间区域分布与局域多度之间的正相关关系是宏生态学的经典模式之一,即局域高密度的物种地理分布范围广,而局域低密度的物种地理分布范围较窄.这种模式在不同的大型生物类群中得到了广泛的证实.但是微生物群落的相关研究还比较薄弱,并且已有工作主要集中在水体环境中.本文以内蒙古草地土壤细菌为研究对象,在3个不同的空间尺度上采集土壤样品,探讨土壤细菌区域分布与局域多度之间的关系.结果表明,在不同的地理尺度上,土壤细菌区域分布与局域多度之间均呈现显著的正相关关系,二者之间的相关性随分类阶元的降低而有所减弱.该结果暗示细菌群落中常见种和稀有种的多样性维持机制可能存在差异,生态位和中性过程可能同时在起作用.
徐冰张全国朱璧如张大勇
关键词:土壤细菌焦磷酸测序
同域培养下大肠杆菌氮、磷含量的进化趋异研究被引量:1
2016年
利用9株具有不同进化背景的大肠杆菌构成5个短期可竞争共存的祖先配对,在限制氮、磷资源的环境下,对5个进化组下6个重复家系进行了约1 100世代的选择实验,考察了这些细菌在进化前后菌体氮、磷质量分数w的变化,并评估了这些性状的趋异程度.研究发现:后代细菌w(氮)的变动范围在13.1%~14.2%,而w(磷)为1.70%~1.95%;不同进化组内,细菌氮、磷含量改变的模式不同;同域后代细菌的趋异模式也并不相同.推测细菌进化本身可能会产生许多独特的性状,连同生态相互作用一起,增加了结果的复杂性,需要在更精细的水平上寻找产生这种结果的原因.
赵琳倪川张全国张大勇
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