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云南蝙蝠轮状病毒的分离与鉴定被引量：5: 2013年; 蝙蝠是携带人兽共患病毒最多的一种哺乳动物,调查蝙蝠携带病毒的病原生态学本底对防范蝙蝠病毒威胁人类健康具有重要意义。本研究采集云南省部分地区蝙蝠进行病毒宏基因组学分析,在一组食虫蝙蝠样品中发现了A群轮状病毒(Group A rotaviruses,RVA)序列,经过进一步RT-PCR筛查验证及病毒的分离鉴定,最终从勐远县的1只三叶蹄蝠中分离出一株轮状病毒。扩增该毒株的VP7与VP4基因进行分型与系统进化分析,结果表明其VP7基因为G3型,与来自阿根廷的1株马轮状病毒的同源性最高,为93%;其VP4基因为P[10]型,与来自泰国的1株人轮状病毒同源性最高,为94.8%。通过与本实验室之前分离的首株蝙蝠G3P[3]型轮状病毒MSLH14的比较,确定该毒株为一株新的蝙蝠轮状病毒,命名为RVA/Bat-tc/MYAS33/2013/G3P[10],简称MYAS33。本研究结果进一步证明了蝙蝠轮状病毒的多样性,突显了蝙蝠作为轮状病毒潜在宿主的重要性。; 夏乐乐何彪胡挺松张文东王意银徐琳李楠邱薇余静范泉水张富强涂长春; 关键词：蝙蝠轮状病毒系统进化分析

阿卡斑病毒云南分离株全基因组序列特征研究被引量：13: 2016年; 为阐明分离自云南省的蚊媒阿卡斑病毒(Akabane virus,AKV)DHL10M110株(简称云南株)的分子生物学特征,采用RT-PCR和核苷酸序列测定方法,对云南株进行全基因组序列测定和分析。结果获得了云南株全基因组核苷酸序列,该病毒株的L、M和S基因核苷酸序列全长分别为6 869bp、4 309bp和856bp,其中开放读码框(Open reading frame,ORF)核苷酸序列依次为6 756bp、4 206bp和702bp,并分别编码2252、1402和234个氨基酸。这三个基因片段ORF的系统进化分析表明,云南株L基因与AKV标准株OBE-1(日本)和AKVS-7/SKR/2010株(韩国)处于同一进化分支;在M和S基因进化树中,云南株与日本、韩国和台湾地区的AKV流行株亲缘关系较近,但云南株单独处于一个小的进化分支。同源性分析表明,云南株L、M和S片段ORF与OBE-1株的核苷酸(氨基酸)同源性分别为92.6%(98%)、88.5%(94%)和96.4%(99.1%)。云南株与OBE-1株的L、M和S片段分别有45、84和2个氨基酸位点的差异。此外,无论L、M和S基因核苷酸序列的同源性或系统进化分析均表明,云南株与肯尼亚和澳大利亚AKV分离株进化关系较远,同源性较低。本研究进一步通过病毒全基因组序列分析证实DHL10M110病毒株为AKV,属亚洲进化群,但与日本和韩国株相比仍有一定差异,云南株地域特征明显。这是首次在中国大陆地区测定到该病毒的全基因组序列。; 冯云章域震杨卫红张海林; 关键词：全基因组系统进化分析同源性分析

中国部分地区蝙蝠携带病毒的宏基因组学分析被引量：15: 2013年; 蝙蝠携带有60多种病毒,其中许多对人有高度致病性。为了解中国蝙蝠携带病毒的自然本底、蝙蝠病毒的多样性和挖掘潜在的病毒病原,通过基于Solexa高通量测序的病毒宏基因组学技术对从吉林、云南、湖南采集的蝙蝠组织进行病毒组学研究,获得了11 644 232条读长(Reads),并拼接出44 872条重叠序列(Contig)。通过核酸序列注释发现,其中8.2%(4 002/44 872)的重叠序列与病毒相关,能进一步注释到36个病毒科,包括19种脊椎动物病毒、6种植物病毒、4种昆虫病毒和4种噬菌体。通过对重叠序列的遗传进化分析、多序列比对显示,被注释为细小病毒、腺联病毒、博卡病毒、腺病毒、小双节RNA病毒等的重叠序列与已知病毒相似,部分序列却又呈现出明显的序列差异。通过对腺病毒和博卡病毒进一步的PCR扩增证实了此研究方法可靠。旨在了解我国蝙蝠携带病毒组的构成,对建立高效的野生动物源人兽共患病的监测方法提供参考。; 杨凡力王意银郑文成何彪江廷磊李莹莹夏乐乐冯烨范泉水涂长春; 关键词：蝙蝠高通量测序

云南省啮齿动物及人血清中SARS冠状病毒抗体调查被引量：3: 2014年; 目的了解云南省啮齿动物及人血清中携带SARS冠状病毒(SARS-CoV)抗体状况。方法在居民区用笼夜法捕鼠并采集鼠血清,在当地采集健康人群血清。用ELISA双抗原夹心法和间接ELISA法分别检测鼠和人血清中SARS-CoV IgG抗体。结果 2003-2004年在云南省16个县(区、市)捕获啮齿动物3属6种807只,黄胸鼠、褐家鼠、大足鼠、大绒鼠、小家鼠和斯氏家鼠构成比依次为46.22%、38.04%、8.67%、4.71%、1.98%和0.37%。动物血清SARS-CoV IgG抗体阳性率为0.62%(5/813),其中黄胸鼠阳性3份、褐家鼠阳性2份。健康人血清SARSCoV抗体阳性率为0.73%(4/548)。结论云南省啮齿动物和健康人群中极有可能存在SARS-CoV感染,应加强云南省啮齿动物及其它野生动物SARS-CoV的监测。; 杨卫红章域震冯云张云智张海林; 关键词：啮齿动物健康人 SARS冠状病毒 IGG抗体

我国蝙蝠携带新发现病毒的研究进展被引量：5: 2015年; 蝙蝠是多种新发现病毒的自然储存宿主。近几年的调查研究表明,我国蝙蝠中广泛存在新型SARS样冠状病毒及其他多种类型冠状病毒的自然感染,还从蝙蝠中检测或分离到新型轮状病毒、肝炎病毒、汉坦病毒、腺病毒、呼肠孤病毒和副粘病毒等多种重要病毒以及埃博拉病毒和尼帕病毒抗体。现就我国自然界蝙蝠携带新发现病毒的研究进展做一综述。; 张海林; 关键词：蝙蝠储存宿主

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NSFC—云南联合基金(U1036601)

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