黑龙江省普通高等学校新世纪优秀人才培养计划(1252-NCET-009)
- 作品数：4 被引量：6H指数：2
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- 相关机构：东北农业大学吉林大学更多>>
- 发文基金：黑龙江省普通高等学校新世纪优秀人才培养计划中国博士后科学基金国家自然科学基金更多>>
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- 鸡内质网分子伴侣Calnexin基因的生物信息学与组织表达谱分析被引量：1
- 2014年
- 为探明鸡内质网分子伴侣钙联结蛋白(Calnexin,CNX)基因特性及蛋白结构和功能,以鸡CNX基因序列为对象,利用生物信息学方法分析了12个物种该分子核苷酸和氨基酸序列的同源性及蛋白的结构和功能,并应用qRTPCR法分析了35日龄海兰白鸡30个组织中CNX mRNA组织表达谱。结果表明,CNX核苷酸序列及氨基酸序列在不同物种中具有一定保守性,该蛋白属于跨膜蛋白,不存在信号肽,酶分类可能属于EC 1.11.1.9,并与糖类特异性结合发挥活性。鸡CNX mRNA在鸡组织中广泛表达,其中在回肠、动脉和腺胃组织中表达量很高,表明CNX是鸡机体内必需蛋白分子,可能在消化系统和心血管系统中发挥更为重要作用。
- 李楠王丽丽曹嫦妤龚都强王伟李金龙
- 关键词：生物信息学分析组织表达谱荧光定量PCR
- 鸡Hemeo xygenase 1基因克隆、结构功能预测及组织表达特性分析被引量：3
- 2014年
- 旨在克隆鸡Hteme oxygenase 1(HO-1)基因,探明其蛋白结构、功能及组织表达特性。以海兰白鸡(W-36)为材料,利用RT-PCR技术克隆鸡HO-1基因CDS区,利用生物信息学方法预测蛋白结构与功能,应用qRT-PCR检测组织表达特性。结果表明,鸡HO-1基因的CDS为891bp,编码296个氨基酸,其核苷酸和氨基酸序列与其他种属间的差异较大。鸡HO-1为跨膜非分泌蛋白,具有HO家族的结构域,酶分类为EC1.14.99.3,能够结合-HEM、BLA、OXN、Q80、SUC、TRE和Na^+等分子。鸡HO-1基因在组织内广泛表达,在动脉、脑干、大脑、坐骨神经、十二指肠及小肠等组织表达量较高。预测HO-1蛋白具有调控糖类和盐类等相关分子功能作用,其在组织中广泛表达,在循环系统、神经系统和消化系统中具有重要的生物学功能。
- 江秀清王丽丽曹嫦好李楠葛延松张颖李金龙
- 关键词：HEMEOXYGENASE基因克隆
- 鸡硒蛋白T的硒代半胱氨酸插入序列元件、蛋白结构与功能及组织表达差异被引量：2
- 2014年
- 应用生物软件分析鸡和其他11种脊椎动物硒蛋白 T （ selenoprotein T ,SelT ）的硒代半胱氨酸插入序列（ selenocysteine insertion sequence , SECIS）元件、SelT核苷酸和氨基酸序列的同源性,并分析鸡SelT 的结构及功能；采用实时荧光定量PCR（ fluorescent quantitative real-time PCR , fqRT-PCR）方法检测SelT基因在35日龄鸡体内30种组织中的表达谱.结果显示：脊椎动物 SelT的SECIS元件均属于Ⅱ型结构；鸡 SelT核苷酸序列与其他11种脊椎动物的同源性在48.0％～85.1％之间,而氨基酸序列与非洲爪蟾、斑马鱼的同源性低于90.0％,与其他9种动物的同源性在90.6％～94.9％之间；鸡 SelT 属于跨膜蛋白,存在信号肽,属于 RDx 家族,酶活性分类为EC 2.5.1.18,具有氧化还原功能,且存在Ca2＋结合位点.SelT在鸡各组织中广泛表达,在睾丸中含量极其丰富,提示鸡SelT在雄性生殖系统中可能发挥功能.
- 葛延松曹嫦妤王丽丽李楠江秀清李金龙
- 关键词：组织表达谱进化关系
- 鸡钙离子结合分子伴侣Calreticulin的结构与功能预测及组织表达特性被引量：1
- 2014年
- 【目的】揭示鸡组织细胞内质网(endoplasmic reticulum,ER)中关键Ca2+结合分子伴侣钙网蛋白(calreticulin,CRT)的结构与功能及组织表达特性。【方法】应用Laser Gene软件,通过比对Gene bank已登录的12种脊椎动物CRT核苷酸及氨基酸序列以分析其进化关系,利用生物信息学方法预测鸡CRT蛋白的结构与功能,并采用荧光定量RT-PCR方法检测CRT在鸡30个不同组织中的表达特性。【结果】同源性分析结果显示:鸡与其他11个物种CRT基因核苷酸序列中,鸡与兔核苷酸序列同源性最高,为78.7%,与虹鳟的同源性最低,为70.5%;氨基酸序列中,鸡与蛇的亲缘关系最近,为85.0%,与虹鳟的亲缘关系最远,为69.0%,与鼠、猕猴、人、兔、猪、牛和非洲爪蟾蜍的亲缘关系也相对较近,并均在80.1%及以上。蛋白结构与功能预测结果为:鸡CRT由404个氨基酸组成,相对分子质量46.8802 kD,理论等电点为4.41,负电荷氨基酸残基数为102,正电荷氨基酸残基数为53,分子式为C2074H3107N543O684S9,鸡CRT具有22个疏水区域,其C端与N端具有很高的疏水性,而C端的亲水性要强于N端,且形成α1(7-17)-α2(22-25)-β1(26)-β2(38-41)-β3(50-54)-β4(69-70)-β5(75-82)-β6(92-99)-β7(110-114)-β8(129-133)-β9(144-151)-β10(171-178)-β11(183-187)-β12(314-322)-β13(326-332)-α3(337-348)-α4(350-375)-α5(377-379)-α6(395-401)的二级结构。CRT蛋白属于跨膜蛋白,存在信号肽,且为分泌蛋白,酶分类属于EC 3.2.1.55或EC 3.4.24.68。组织表达检测结果表明:CRT基因在鸡各组织中广泛表达,其中在回肠、腺胃和十二指肠等组织中表达量较高,且高出肾脏(对照)20倍以上。【结论】鸡CRT核苷酸及氨基酸序列在12种脊椎动物物种中具有相对保守性,鸡CRT为跨膜分泌蛋白,为酸性蛋白,属于α-N-阿拉伯糖苷酶或Tentoxilysin,催化α-L-阿拉伯糖苷内的终端非还原性α-L-阿拉伯呋喃糖苷残基的水解,作用于α-L-阿拉伯呋喃糖苷、含(1,3)和/或(1,5)�
- 王丽丽李楠曹嫦妤龚都强于东王伟李金龙
- 关键词：CALRETICULIN进化关系
