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番茄NAC基因家族的系统进化及表达分析被引量：11: 2016年; 本研究挖掘番茄(Solanum lycopersicum)中NAC转录因子家族成员104个,为研究番茄NAC转录因子在响应生物及非生物胁迫中的调控作用提供理论基础,也为番茄NAC转录因子的全基因组分析提供了依据。通过SOL数据库下载番茄NAC、NAM基因及蛋白序列,根据NAC保守域序列号PF01849、PF02365,利用HMMER 3.0软件鉴定番茄NAC基因。再利用保守结构域预测软件Pfam和SMART对候选序列进行筛选鉴定。使用DNAMAN5.0、Web Logo、MEGA5.2、GSDS2.0、Map Inspect、Ex Pasy和Swiss-Model等软件对获选番茄NAC转录因子进行生物信息学分析。通过RT-PCR技术检测番茄NAC转录因子在不同组织中的表达情况。本实验通过生物信息学方法对番茄中NAC基因家族成员进行了预测及分析。预测及分析结果显示,番茄NAC基因家族包含104个蛋白质,通过分组鉴定和进化树分析将番茄NAC基因家族分为12个亚族,番茄特有的TNAC亚族成员最多为28个。本实验对挖掘到的104个NAC转录因子的分子量、等电点、保守结构域及蛋白质二、三级结构进行了预测及分析。本实验选取12个NAC转录因子家族成员进行RT-PCR技术检测,获得其在根、茎、叶、花、果中的表达情况,半定量结果显示,7个Sl NAC基因在根、茎、叶、花、果(红熟)中均有表达,并呈现出多种表达模式。番茄NAC转录因子家族在结构上高度保守,并参与番茄生长发育、生物及非生物胁迫的调控过程。; 姜秀明牛义岭许向阳; 关键词：番茄 NAC 生物信息学转录因子

番茄耐盐性的遗传分析被引量：5: 2017年; 为研究番茄耐盐性的遗传规律,选用耐盐性差异较大的品种早粉2号和醋栗番茄(LA2184)配制早粉2号×醋栗番茄杂交组合,对其P_1、P_2、F_1、F_2、BC_1P_1、BC_1P_2共6个家系世代群体苗期植株进行耐盐性调查,通过6个世代联合分析的方法,研究番茄耐盐性的遗传规律。结果表明,早粉2号×醋栗番茄耐盐性遗传模型为2对加性-显性上位性主基因+加性-显性-上位性多基因混合遗传模型,在该群体中加性效应(d_a、d_b)均为1.332 1,显性效应(h_a、h_b)分别为1.038 0、3.510 4,上位性效应(i、j_(ab)、j_(ba)、l)分别为1.325 6、-1.259 9、-3.732 4、-1.004 9,BC_1P_1、BC_2P_2、F_2的主基因遗传力(h_(mg)~2)分别为0.579 1、0.342 0、0.601 1。; 姜淼许向阳姜景彬李景富; 关键词：番茄耐盐性

外源ABA对番茄幼苗抗冷性差异的研究被引量：14: 2016年; 以高代自交系"东农11537"番茄幼苗为试验材料,通过叶面喷施不同浓度的脱落酸,在筛选出适宜浓度为200μL/LABA的基础上,进一步探讨外源喷施ABA对番茄幼苗抗冷性的影响。结果表明,在200μL/L的ABA预处理番茄幼苗后,随冷处理时间延长,叶片内脯氨酸、可溶性糖和可溶性蛋白含量均逐渐升高,在同一时期的抗氧化酶活性和叶绿素含量高于CK,而MDA含量低于CK。冷胁迫下两组叶片中抗冷相关基因CBF1、SLCZFP1、SLCMYB1、LENLP4的表达量都出现上升趋势,其中SLCMYB1、LENLP4两个基因在ABA预处理后表达量上升显著高于CK,经ABA预处理的幼苗能够促进冷胁迫相关基因的表达并提高其抗冷性。; 尹松松赵婷婷李景富姜景彬张贺陈秀玲许向阳; 关键词：番茄脱落酸抗冷性生理指标

番茄抗叶霉病基因Cf19的抗性特点及遗传连锁分析被引量：1: 2015年; 番茄抗叶霉病基因Cf19的抗性范围基本涵盖了中国目前分化出的所有叶霉菌生理小种,且抗性显著;台盼蓝染色结果显示该基因介导的抗性应答中出现明显的超敏反应,强度介于Cf4和Cf9基因之间;遗传连锁分析说明该基因的遗传特性符合单基因显性遗传规律;通过进一步SSR和AFLP分子标记连锁分析,共找到6个与Cf19基因连锁的分子标记,并将该基因初步定位于番茄1号染色体短臂区域。; 赵婷婷张帆李帅刘冠李景富姜景彬张贺许向阳; 关键词：番茄番茄叶霉病基因定位

辣椒GATA转录因子的生物信息学分析被引量：6: 2017年; 本研究旨在分析和鉴定辣椒GATA转录因子的家族成员的生物信息学特征,为今后进一步的实验研究奠定基础。利用生物信息学手段,通过HMMER和SMART软件对辣椒GATA转录因子进行鉴定。利用Clustal X 1.83、MEGA5.05、GSDS、MEME等软件对辣椒GATA转录因子进行生物信息学分析。本研究鉴定出24个辣椒GATA转录因子家族成员。系统进化树的结果显示,24个GATA家族成员分为4个亚族。GSDS软件结果表明辣椒GATA转录因子的内含子、外显子分布情况。DNAMAN软件和MEME软件结果显示辣椒的大部分GATA转录因子是保守的。染色体定位软件Map Inspect分析表明,辣椒GATA转录因子在辣椒12条染色体上分布并不均匀。本研究鉴定并分析了辣椒GATA转录因子的生物信息学的特征,为以后继续研究其功能提供了一定的理论基础与现实意义。; 袁岐张春利赵婷婷许向阳; 关键词：辣椒转录因子生物信息学

番茄PIN2基因的生物信息学分析被引量：4: 2017年; PIN基因家族是调控生长素运输的重要输出载体。拟南芥PIN2介导的生长素极性运输在生长素不对称分布在根的向重力性反应中起着关键性调控作用(潘建伟等,2010)。植物根系的重力性决定着根系空间生长的趋势,对植物养分的吸收有着重要的影响。本研究选择功能已知的拟南芥PIN2基因为参考序列,对番茄PIN2基因开展了蛋白组分和理化性质,系统进化分析,蛋白结构预测,跨膜结构分析等生物信息学研究,为番茄PIN2基因的生物学功能及分子机理提供理论基础。; 张春利袁岐赵婷婷许向阳; 关键词：番茄生物信息学

番茄与叶霉菌互作机制研究进展被引量：5: 2016年; 番茄-叶霉菌互作已成为研究植物与病原真菌互作的模式系统,文章从番茄叶霉病症状、叶霉菌侵入机制、番茄抗叶霉菌免疫系统及抗病基因和无毒基因互作等方面论述番茄与叶霉菌互作机制研究进展,并讨论和展望有待进一步研究的问题。; 刘冠赵婷婷李宁姜景彬李景富许向阳; 关键词：番茄叶霉菌互作机制

番茄抗黄化曲叶病ty-5基因的PCR快速检测被引量：1: 2016年; 以番茄抗病材料CLN32120a-23(含ty-5基因)和感病材料Moneymaker(不含抗病基因)为试材,通过杂交、自交获得的F1、F2代,利用SSR分子标记技术筛选出了1个与抗病性状共分离的共显性SSR标记。结果表明:该标记在CLN32120a-23中可以扩增出550bp的条带,在Moneymaker中可以扩增出780bp的条带,在F1中可以扩增出上述2条条带,标记结果与田间鉴定基本一致,证明该标记能够区分抗病材料、感病材料及杂合抗病材料,是与番茄抗黄化曲叶病毒病基因ty-5紧密连锁的共显性标记。对27份番茄材料进行检测,鉴定出有15份材料基因型为ty-5/ty-5,分子标记检测与田间检测结果吻合率达80%。该标记可用于番茄抗黄化曲叶病毒ty-5基因的PCR快速检测,同时为ty-5分子标记辅助选择育种的应用提供一定的参考依据。; 杨欢欢姜景彬李景富许向阳商珺鸣; 关键词：番茄黄化曲叶病毒病 SSR分子标记 PCR

番茄转录组学研究进展被引量：26: 2016年; 番茄是一种世界范围内种植的蔬菜作物,随着番茄基因组测序的大规模完成,转录组学在番茄研究中发挥着无可替代的作用。转录组学作为功能基因组学的代表,在植物抗病、抗逆的过程中有着诸多应用。转录组学的研究可以从整体的水平上反映出细胞中基因的表达情况及其调控规律。本综述主要介绍了转录组学的主要技术及其原理,同时结合转录组学在番茄中的一些应用来展开,为研究番茄复杂的农艺性状的分子机制、不同的发育阶段基因表达调控网络等提供理论依据。; 刘冠赵婷婷杨欢欢张冬野姜景彬李景富许向阳; 关键词：番茄转录组学

番茄果实光滑基因F的分子标记筛选及种质资源鉴定被引量：3: 2014年; 以含F基因的果实光滑型品种12509为母本,以果实皱褶型品种12510为父本配制杂交组合,以亲本、F1及其F2代分离群体为研究材料,采用AFLP分子标记技术筛选与果实光滑基因F连锁的分子标记。通过对256对AFLP引物进行筛选,获得6个与F基因连锁的标记:E13M08、E11M07-B、E11M12-D、E11M08-A、E01M10和E10M16-E,连锁遗传距离分别为6.4、8.5、10.9、17.1、23.5和24.2 cM。将E13M08标记用于种质资源筛选,获得45份果实光滑型材料,为番茄外观品质育种奠定基础。; 许向阳于亭亭赵婷婷李帅姜景彬张贺李景富; 关键词：番茄果实 F基因 AFLP 种质资源

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国家自然科学基金(31272171)

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