中国科学院知识创新工程领域前沿项目(MGE2008KG06)
- 作品数：2 被引量：7H指数：1
- 相关作者：李铁刚于心科萨仁高娃马学恩王峰更多>>
- 相关机构：内蒙古农业大学中国科学院更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程重要方向项目中国科学院知识创新工程领域前沿项目更多>>
- 相关领域：生物学天文地球更多>>
- 西菲律宾海比科尔陆架深海沉积物古菌多样性研究被引量：1
- 2011年
- 通过构建16S rRNA基因文库,对西太平洋西菲律宾海东板比科尔陆架5个不同层位沉积物样品中的古菌的多样性进行了研究,并获得了465个有效克隆63个OTUs(Operational Taxonomic Units)。通过16S rRNA序列与GenBank已知序列的同源性比较及构建系统进化树的结果显示,古菌序列分别来自泉古菌(Crenarchaeota)和广古菌(Euryarchaeota),以Marine Benthic Group B(MBGB)、Marine Group I(MGI)、Miscellaneous Crenarchaeotic Group(MCG)和Marine Benthic Group D(MBGD)为主。少量序列为Marine Hydrothermal Vent Group(MHVG)。研究结果表明,该垂直分布的5个不同层位的沉积物样品仅有5个古菌类群,古菌群落多样性并不高,且5个层位中的优势古菌类群稍有差异。研究结果揭示了比科尔陆架深海古菌垂向分布特征,为今后大范围自然海区古菌生态学研究提供科学参考。
- 格根塔娜萨仁高娃于心科李铁刚周伟光
- 关键词：西太平洋沉积物古菌
- 西太平洋深海沉积物古菌多样性垂直分布被引量：6
- 2010年
- 以提取并纯化的西太平洋深海沉积物DNA为模板,利用古菌PCR特异性引物扩增出样品中古菌的16S rDNA片段,构建其克隆文库,建立阳性克隆子RFLP(Restriction Fragment Length Polymor-phism)酶切图谱。据酶切图谱对所获得的120个克隆进行测序,并与数据库中的序列进行比对,从而进行古菌的多样性和系统发育分析。结果表明,沉积物中扩增的16S rDNA古菌序列分别来自泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota),以Marine Benthic Group B(11.8%)、Marine Benthic Group D(13.6%)、Marine Crenarchaeotic Group(68.69%)为主。少量序列为South African Gold Mine Euryarchaeotic Group(1.07%)、Deep-Sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group(1.61%)、UIIB(1.25%)、VALIII(1.79%)、Marine Benthic Group E(0.18%)。以上结果表明西太平洋深海沉积物中有丰富多样的古菌群落。
- 王峰萨仁高娃李铁刚马学恩于心科
- 关键词：西太平洋RDNA
