国家自然科学基金(30970152)
- 作品数：22 被引量：19H指数：3
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- 巯基琥珀酸包被的CdTe量子点的制备及其对毕赤酵母生长的影响
- 2013年
- 以巯基琥珀酸作为稳定剂,合成CdTe量子点.通过荧光发射光谱、紫外吸收光谱对其荧光性能进行表征,结果表明在505 nm左右出现明显的特征吸收峰,在551 nm处出现一个很强的发射峰.实验又以毕赤酵母为指示生物,考察了毕赤酵母与CdTe量子点共培养后的生长曲线,结果表明CdTe量子点须控制在一定浓度(5.1μmol/L)范围内,对毕赤酵母的生长影响不大.
- 宋有涛王莹李辉董微孙晓霞
- 关键词：CDTE量子点毕赤酵母
- 定量研究菲啶对酵母朊病毒[PSI^+]的治愈作用被引量：4
- 2012年
- 为系统研究菲啶对酵母朊病毒的治愈效果,借助表达融合蛋白GFP-Sup35p的酵母朊病毒模型(NGMC),引入半变性琼脂糖凝胶电泳技术和荧光漂白后恢复技术在蛋白和细胞水平定量分析了菲啶对酵母朊病毒的治愈效果。结果表明,蛋白和细胞水平采用的定量分析方法能够精确定量菲啶对酵母朊病毒的治愈作用,菲啶作用酵母朊病毒[PSI+]1~5 d的治愈率分别为0%、0%、51.7%、87.5%和94.4%。另外,菲啶作用酵母朊病毒[PSI+]细胞1~2 d后出现的粉色菌落中朊病毒的聚集状态与[PSI+]相似,而3~5 d后出现的粉色菌落中朊病毒的状态与[psi-]相似。
- 钟正伟王莉洁谢辉李辉何剑为宋有涛
- 关键词：治愈
- Val55点突变对鸡胱抑素I66Q结构稳定性影响的分子动力学研究
- 2012年
- Val55是鸡胱抑素(Chicken cystatin,cC)铰链环状区的重要位点。本文采用分子动力学模拟的方法研究了V55位点突变对cC典型的淀粉样突变体I66Q结构稳定性的影响情况,并深入探讨了其分子机制。研究表明V55N和V55D对I66Q突变体都有稳定其结构的作用,但V55N的稳定作用更显著。进一步研究发现V55N和V55D对I66Q的这种稳定作用是由于突变后的55位残基与邻近残基形成了较多稳定的氢键,从而增加了自身位点及Loop1、β2-β3的稳定性,并进一步稳定了I66Q的α-螺旋和疏水核心结构。这可能最终阻碍胱抑素淀粉样突变体I66Q结构域交换的发生。
- 张梦媛徐利楠沈曼莉何剑为宋有涛
- 关键词：胱抑素分子动力学模拟
- 马铃薯贮藏蛋白Patatin及其突变体分子动力学和分子对接的研究被引量：2
- 2014年
- 马铃薯贮藏蛋白Patatin具有水解脂肪的能力,且特定位点的突变能够影响Patatin的水解酶活性.Patatin的水解酶活性中心是由Ser77和Asp215组成,首先采用分子动力学方法研究Patatin及其突变体的稳定性和构象变化,通过结构比对没有发现构象规律性的变化,然后采用分子对接方法,发现了两个基团(Patatin及其突变体活性位点Ser77的羟基与底物p-硝基苯基癸酯的酯键)间的距离具有规律性:即H109A和D182A(活性减弱)两个基团之间的距离偏大,而R368A,E140A,H109N(活性增强)两个基团之间的距离偏小,符合之前的生化数据.这说明Ser77的羟基与底物PNPC10的酯键间的距离可能能够影响底物小分子与Patatin蛋白的结合,从而影响Patatin酯酶的活性.同时,根据细胞内溶质磷脂酶A2(cPLA2)反应过程,我们推测了Patatin与底物之间可能的催化机制.
- 宋有涛徐姣周雷孙玉娜周小红张桥石薛友林
- 关键词：PATATIN动力学模拟分子对接突变体
- 酵母抗朊病毒药物筛选模型细胞培养条件优选
- 2013年
- 目的探讨基于酵母的抗朊病毒药物筛选模型在初级筛选时的细胞培养最佳条件。方法通过表型分析的方法探讨了培养基pH值、初始菌液浓度、细胞生长时期3个因素对基于酵母的抗朊病毒药物筛选模型灵敏度的影响。结果培养基pH值能够影响酵母朊病毒[psi-]细胞的颜色表型,pH>7.46时,[psi-]酵母菌落变为白色,但对[PSI+]的聚集状态不造成影响;菌液初始浓度为A600nm=0.02时,相对于A600nm=0.5、A600nm=0.2时的药物治愈率要高几倍到几十倍;处于对数生长期的[PSI+]酵母细胞对药物的敏感性较差,而处于延滞期和稳定期的[PSI+]酵母细胞对药物的敏感性较强。结论酵母抗朊病毒药物筛选模型在初级筛选时的细胞培养最佳条件为pH<6,菌液初始浓度为A600nm=0.02,处于稳定期的酵母细胞。
- 李辉王莹钟正伟王莉洁何剑为宋有涛
- 关键词：PH
- Hsc70-Auxilin复合物的拉伸分子动力学模拟被引量：2
- 2014年
- Hsc70与auxilin蛋白组成的系统是Hsp70/Hsp40分子伴侣系统家族的一员,在热休克反应中发挥重要作用。本文为得出auxilin蛋白J结构域的关键氨基酸,首先采用由二硫键交联的Hsc70 R171C与auxilin D876C的复合物结晶结构作为初始模型,进行分子动力学模拟,通过比较平衡后的结合部位发现,将形成二硫键的氨基酸突变为原来的氨基酸结构在结合位点上与生化结果较为相近,之后利用此结构通过拉伸动力学模拟分析了auxilin蛋白J结构域与Hsc70的ATPase功能域的解离过程,并探讨了Hsc70与auxilin蛋白之间的相互作用力。结果表明位于HPD loop上的His874,Asp876,Thr879,螺旋Ⅲ上的Glu884,Asn895,Asp896,Ser899,Glu902,Asn903为关键氨基酸,这些数据符合之前核磁共振实验证实的T抗原J结构域的HPD基序和螺旋Ⅲ与Hsc70的ATPase功能域之间的相互作用。
- 周雷徐利楠周小红薛友林李辉宋有涛
- 关键词：AUXILINJ-DOMAIN蛋白相互作用
- 淫羊藿提取物对酵母朊病毒[PSI^+]治愈的影响被引量：2
- 2013年
- 研究6种菊科中药对酵母朊病毒[PSI+]治愈效果。通过在培养基内加入适量浓度中药成分的方式,利用表型检测方法在细胞水平上检测中药对酵母朊病毒的治愈。淫羊藿醇提物对朊病毒[PSI+]最佳治愈浓度为0.097 5 g/mL,治愈率可达到3%,而水提物没有治愈作用。淫羊藿醇提物对酵母朊病毒有一定的治愈作用。
- 李辉卜祥龙窦爽郭晏华张波宋有涛
- 关键词：淫羊藿醇提物治愈
- 钩藤提取物对感染朊病毒酵母模型的治疗作用被引量：1
- 2015年
- 通过已建立的抗朊病毒药物筛选模型,研究钩藤提物对酵母朊病毒细胞模型的治疗作用。通过在液体培养基中加入钩藤提取物的方式,利用酵母朊病毒[PSI+]表型分析方法和蛋白水平的半变性琼脂糖凝胶电泳技术分析钩藤提取物抗朊病毒的效果。结果显示,钩藤醇提取物对感染朊病毒酵母[PSI+]作用5d后的治愈率为5%,而水提取物没有治疗效果。蛋白水平检测进一步说明钩藤醇提取物具有抗酵母朊病毒的作用。
- 张艳刘宴村宋有涛
- Hsp70核苷酸结合域突变体影响酶活的分子动力学模拟研究被引量：2
- 2013年
- 分子伴侣蛋白Hsp70氮端核苷酸结合域(NBD,nucleotide-binding domain)的ATP酶活性变化对其行使分子伴侣功能具有重要作用。本文采用分子动力学模拟方法研究酵母分子伴侣Hsp70氮端NBD内残基A17,R23,G32和R167点突变对其ATP酶活性区域构象影响及功能关系。结果表明,突变体A17V,T23H,G32S的ATP结合口袋袋口的loop1(第一个转角,连接β1与β2)结构柔性增强,活性残基T11侧链明显向内移动,从而更加接近ATP的γ-磷酸基团,更容易使ATP水解。这可能最终导致ATP酶活性增强,从而引起分子伴侣功能的变化。
- 周小红徐利楠薛友林宋有涛
- 关键词：HSP70分子动力学模拟突变体
- 淀粉样蛋白纯化方法的研究进展
- 2012年
- 淀粉样纤维是一种富含β折叠的高度有序的由淀粉样蛋白前体聚集而成的蛋白聚集体。由于淀粉样蛋白较普通蛋白具有不稳定、易于聚集的特性,此类蛋白的表达和纯化与常规方法有较明显的差别,主要体现在更为严格的技术和过程要求。基于近年来淀粉样蛋白分离纯化技术领域取得的进展,并结合作者的相关研究,总结淀粉样蛋白的分析和制样方法,为淀粉样蛋白沉积疾病的分子机理研究提供理论依据和技术支撑。
- 何剑为陈应广王禹宋有涛
- 关键词：淀粉样蛋白纯化
