广州市医药卫生科技项目(2006-YB-196)
- 作品数：5 被引量：26H指数：3
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- 相关机构：中山大学广州开发区医院更多>>
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- 脐血乙型肝炎病毒核酸载量检测被引量：1
- 2007年
- 目的:评价脐血乙型肝炎病毒(hepatitis Bvirus,HBV)核酸载量检测结果。方法:通过建立扩增效率分析法,评价脐血进行HBV-DNA定量检测的有效性;通过比较脐血HBV血清学标志物的检测结果与脐血标本HBV-DNA定量检测结果,评价检测方法。结果:HBV血清学标志物检测结果为大三阳,即HBsAg(+)、HBeAg(+)和HBcAb(+)的乙型病毒性肝炎产妇,其新生儿脐血标本在HBV-DNA定量检测中,20例中有13例(65%)发生扩增,扩增效率分析与其他血清标本差异无显著性;该20例脐血标本的HBV血清学标志物检测结果HBcAb(+)12例(60%),HBeAg(+)11例(55%),而其中HBsAg(+)仅1例(5%)。结论:脐血标本可用于检测HBV核酸载量。
- 余南陈小坚毕晓云张云娇
- 关键词：肝炎病毒乙型脐血荧光定量PCR
- 实时荧光定量PCR检测乙型肝炎病毒核酸载量的测量不确定度构成分析被引量：10
- 2006年
- 目的研究实时荧光定量PCR用于乙型肝炎病毒(HBV)核酸载量检测时的测量不确定度构成。方法采用实时荧光定量PCR检测乙型肝炎患者血清标本中HBV核酸载量,收集检测过程中的各类数据,计算以下6种来源的测量不确定度,对该方法的测量不确定度构成进行评估。⑴标本浓缩的不确定度(uenrich);⑵核酸提取的不确定度(uex);⑶扩增反应体系的不确定度(upcr);⑷热循环仪的不确定度(uins);⑸数据处理的不确定度(uana);⑹加样枪的不确定度(upip)。其中热循环仪的不确定度检测样本数为7份,其他各种不确定度检测的样本数为10份。结果核酸浓度为5.610E+07拷贝/ml的标本,其浓缩过程来源的相对不确定度达0.437;核酸提取来源的浓度真值无偏估计在6.585E+03、9.067E+04、7.223E+06拷贝/ml样本的相对不确定度分别为0.249、0.173、0.140;热循环仪和数据分析来源的相对不确定度分别为0.020和不大于0.050。结论标本制备过程中的浓缩和DNA提取步骤所带来的不确定度是实时荧光定量PCR检测HBV核酸载量测量不确定度的主要分量,因此标本制备处理的方法与标准操作程序能否有效地提取核酸并去除PCR反应的抑制物对于该项检测十分关键;起始模板浓度与测量不确定度相关,低浓度的样本显示出更大的相对不确定度。
- 余南毕晓云崔进陈小坚李汛
- 关键词：肝炎病毒乙型核酸类
- HBV基因型分析及B/C型共感染的血清病毒种群分析被引量：1
- 2011年
- 为了解HBV大三阳青年妇女的HBV基因型及体内病毒种群特征,从19～35岁青年妇女HBV感染者血清样本中筛选出24例HBV血清学标志物检测结果为大三阳的样本进行HBV基因分型检测,14例为B型,9例为C型,1例为B/C基因型共感染。对14例大S蛋白基因通过特异性扩增、序列克隆和测序确认的分型结果与分型检测一致。发现的1例B/C共感染样本来自阿德福韦酯抗病毒治疗35周患者,大S蛋白基因序列分析显示10条序列中4条为B型,准种分散值为2.8;其6条为C型,准种分散值为0.6。α决定簇分析该患者体内病毒种群包含3种血清型。病毒种群分析结果提示本地区青年妇女HBV感染的基因型主要为B型和C型,B/C基因型共感染患者体内HBV病毒种群呈复杂的多基因型分布,不同基因型内部以准种形式存在。
- 余南崔进程相华周国宝
- 关键词：准种
- 脂血标本的核酸定量检测效果评价被引量：3
- 2007年
- 目的评价脂血标本的核酸定量检测实时扩增曲线,以探讨此类标本进行HBV DNA定量检测的可接受性。方法建立扩增曲线观察法、扩增效率Grubbs离散值分析法及扩增效率置信区间估计法,评价接收脂血标本进行荧光定量PCR法HBV DNA定量检测的有效性。结果该2批次扩增的各样品扩增效率数值未发现离散值,3例脂血标本的扩增效率在同批样品扩增效率的90%置信区间内,与扩增曲线观察法结果一致。结论3种评价方法均对修正标准操作程序以接收该类标本提供了支持性的依据。
- 余南陈小坚甘明詹希美
- 关键词：荧光定量PCR乙型肝炎病毒
- 乙型肝炎病毒核酸定量检测中不确定度的研究被引量：19
- 2007年
- 目的研究应用实时荧光定量PCR(Fluorescence Quantitative PCR,FQ-PCR)开展乙型肝炎病毒(Hepatitis Bvirus,HBV)核酸定量检测中的测量不确定度。方法通过实时荧光定量PCR进行乙型肝炎病毒核酸定量检测的实验分组设计与数据处理分析,计算分析该检测方法不同来源的测量不确定度值。结果对3组不同水平浓度值样本来源的数据采用两种方法进行统计分析,QDNA的组标准差远远大于LGQDNA的标准差,初始浓度数值经过对数转化后离散程度降低,统计平均值也发生了偏离。LGQDNA为3.465、4.927和6.018的样本,其浓缩过程来源的相对不确定度分别为0.020、0.019和0.009;LGQ无偏估计在3.706、6.750的样本的核酸提取来源相对不确定度分别为0.016和0.009;数据分析来源的LGQ不确定度为0.000～0.008;热循环仪来源的LGQ不确定度为0.002～0.008。结论使用核酸浓度值QDNA与使用其对数值LGQDNA进行数据统计分析的结果存在差异;标本制备过程中的浓缩和DNA提取是实时荧光定量PCR进行HBV核酸定量检测时测量不确定度的重要来源,标本制备环节是影响该项检测的关键因素,包括试剂、方法和操作者的准确操作能力。
- 余南甘明詹希美陈小坚
- 关键词：荧光定量PCR测量不确定度乙型肝炎病毒
