福建省自然科学基金(2006J0018)
- 作品数：10 被引量：19H指数：3
- 相关作者：宁正元李金铭王李进赖贤伟胡山立更多>>
- 相关机构：福建农林大学福州大学福建师范大学更多>>
- 发文基金：福建省自然科学基金国家自然科学基金福建省教育厅科技项目更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学农业科学自然科学总论更多>>
- 基于茎区的神经网络方法预测RNA二级结构
- 2011年
- RNA二级结构预测是生物信息学的一个重要研究内容。作为预测方法之一的神经网络已被广泛应用于蛋白质结构预测,但在RNA二级结构的应用甚少。本文改进传统预测RNA二级结构的Hopfield神经网络。算法以茎作为网络神经元,通过与相似结构茎区的比对,初始化神经元,并据此修改网络的激励系数。实验把改进后算法与改进前2种算法、Mfold、RNAStructure比较,结果表明本文提出的算法对序列长度较小并且保守性较好的tRNA分子有很好的效果。
- 许丹王爱荣李金铭
- 关键词：HOPFIELD神经网络RNA二级结构茎区TRNA
- 生物数据标准化,从HTML到RDF被引量：2
- 2007年
- 随着各种生物信息数据的巨量产出,计算机辅助数据管理和自动数据处理成为必然.文章分析了当前因特网上生物数据的复杂性以及生物信息数据自动处理和分析的前提要求,然后回顾了HTML、XML 2种标记语言在生物数据建模和标准化方面的优缺点,并介绍将RDF与XML相结合实现生物数据基于语义的描述,最后展望了相关的语义网技术在生物信息学中的应用.
- 宁正元黄伟奇
- 关键词：生物数据
- 置换流水车间调度问题的离散粒子群优化算法被引量：3
- 2008年
- 提出了一种求解置换流水车间调度问题的离散粒子群优化算法.在该算法中,定义粒子的位置为作业的置换,粒子的速度为置换中作业的交换,根据离散量运算的特点,对粒子的运动规则进行了重新定义.采用变邻域搜索算子和逆序算子来保持粒子群的多样性和提高算法的局部求精能力,使算法在空间探索和局部求精间取得了较好的平衡.在Taillard测试问题集上对算法性能进行了仿真实验,结果表明,离散粒子群优化算法具有良好的性能.
- 宁正元林大辉李丽珊钟一文
- 关键词：离散粒子群优化置换流水车间调度问题变邻域搜索
- 投影寻踪模型在软件质量评价中的应用被引量：4
- 2009年
- 利用投影寻踪模型对软件质量多个指标综合成一维综合投影值,提出了基于遗传优化的投影寻踪模型在软件质量评价中的应用。利用样本数据求解最佳投影方向,确定评价等级的综合投影值区间,根据待评价样本综合投影值与区间值比较,得出综合评价。实例评价结果表明,投影寻踪模型应用于软件质量评价是可行的,具有较强的适用性和应用性,能够准确、科学和客观地评价软件质量。
- 梁忠王李进周术诚
- 关键词：投影寻踪软件质量综合评价遗传算法
- 基于贝叶斯算法的森林成熟预测研究被引量：3
- 2009年
- 我国的森林资源调查和监测工作起步较早,具有丰富的森林资源监测基础数据资料,激增的数据背后隐藏着许多重要的信息,简单的查询和统计已经无法满足林业的需求,需要出现一种挖掘数据背后隐藏的知识手段.该文将数据挖掘的方法引入林业应用,从而为林业的经营决策提供一条新的思路.通过挖掘林龄与其它调查因子间的关系来建立贝叶斯算法预测模型,利用其它调查因子较准确、有效率地预测林龄;确定了与林龄相关性最高的因子:胸径、树高、公顷畜积和郁闭度,解决了传统测量林龄的困难,并可进一步确定森林是否成熟,为合理采伐提供依据.
- 李金铭刘荣其宁正元
- 关键词：数据挖掘贝叶斯算法
- Alternating-time Temporal Belief and Knowledge Logic in Multi-agent Systems
- Multi-agent cooperation logics,which provide powerful tool for modeling knowledge-based systems and cooperativ...
- Zhengyuan Ning 1
- 基于正则表达式的生物序列检索方法被引量：1
- 2009年
- 提出利用正则表达式进行生物序列检索时应先确定该正则表达式的最优NFA,然后再转化为相应的算法步骤,进而提高生物序列的检索效率。并给出了一个具体的序列检索实例。
- 郑珂晖宁正元王健
- 关键词：正则表达式
- 个体与群体思维状态下的AOP语言
- 2008年
- 引入群体思维状态对GOAL进行改进,建立了个体与群体思维状态下的AOP语言IG-AOP,给出其语法和操作语义。举例证明该语言的表达力比GOAL强,可以较好地满足多Agent合作求解过程的刻画与并发编程的需要,初步解决了Agent研究理论与实践脱节的问题。
- 赖贤伟胡山立宁正元詹青青
- 关键词：多AGENT系统信念
- 交互时态逻辑下的三种模糊信念算子
- 2008年
- 前期工作交互时态信念逻辑ATBL仅在二值语义下刻画了三种信念算子,没有探讨它们的模糊语义问题.利用可信度函数给出模糊并发博弈结构,以模态算子的形式在ATL的语法层面给出了三种模糊信念算子,在模糊并发博弈结构下给出其语义,建立了模糊交互时态信念逻辑FATBL,使得ATBL成为FATBL的特殊情况.对Agent认知形式化作了进一步探索,为多Agent系统研究提供了一个较好的形式化工具.
- 赖贤伟胡山立宁正元王秀丽
- 关键词：信念
- 基于改进粒子群算法的造林规划被引量：2
- 2009年
- 一直以来造林规划的工作者主要是靠手工进行规划或者运用一些通用的计算机软件来辅助规划,表现出工作繁琐、效率低、设计粗糙、计算不科学.首先给出一种改进的粒子群算法,即使用最简单的罚函数法将约束优化问题转化为无约束优化问题,然后将不同阶段搜索进度应用到粒子群算法中.该算法在优化目标函数的分析性质上没有特殊要求,并具有较强的全局寻优能力.用该改进粒子群算法来确定在资金、计划、苗木品种和数量等约束条件下小班造林规划最优方案,结果表明该算法在约束条件下造林规划效果很理想.
- 李金铭王梅芳
- 关键词：改进粒子群算法造林规划
