国家自然科学基金(30270215)
- 作品数：2 被引量：20H指数：2
- 相关作者：李明魏辅文刘海吕晓平杨光更多>>
- 相关机构：中国科学院中国科学院研究生院南京师范大学更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程国家自然科学基金国家杰出青年科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 一种筛选微卫星位点的改进方法及其在小熊猫微卫星基因文库构建上的应用被引量：8
- 2005年
- 微卫星基因位点是在各个遗传学领域被广泛使用的分子标记.而对于首次研究的物种,必须筛选出可以应用的微卫星位点.对于分离微卫星位点来说由于只有大约0.5%～2%的重组体含有微卫星位点,所以标准的基因组文库需要至少产生5 000个重组体.传统的筛选方法就是通过检测大量重组体来定位这些少量的位点.近几年来出现了一些新的筛选方法,采用'富集'微卫星序列的技术将包含微卫星位点的重组体比例提高了10～100倍.这样就降低了筛选工作的时间和劳动强度,大大提高了筛选微卫星位点的效率.本文在结合了几种筛选微卫星位点技术路线的基础上,采用生物素标记探针杂交、富集和PCR筛选技术,对原有技术路线进行了改进.主要实验步骤为:1)基因组DNA的提取和消化;2)生物素标记探针富集;3)克隆建库;4)'PCR'筛选;5)引物设计和多态性检测.新的方法在小熊猫微卫星基因文库的构建中取得成功,获得了10个具有多态性的(CA)n重复序列微卫星位点.
- 艳丽刘志瑾魏辅文李明
- 关键词：微卫星基因组文库小熊猫
- 中国梅花鹿(Cervus nippon)遗传多样性及与日本梅花鹿间的系统关系被引量：12
- 2006年
- 在4个中国梅花鹿(Cervusnippon)种群45个样品的335bp线粒体DNA控制区序列中,共发现25个变异位点,并定义了8种单元型.AMOVA分析表明,中国梅花鹿种群间出现了显著的遗传分化(Φst=0.744,P<0.05),但种群的遗传距离与地理距离间没有显著的相关性(P>0.05).系统进化关系分析也显示了中国梅花鹿单倍型的系统地理格局与地理分布区或亚种划分之间不存在明显的相关性.基于最大似然法和最大简约法及最小跨度网络图的系统进化分析均表明单倍型聚类对应于中国、日本南部和日本北部的3个单系,其中中国大陆种群和日本南部的梅花鹿之间亲缘关系较近,与日本北部种群则较远,而中国台湾种群与中国东北和四川种群间的亲缘关系较近,与华南种群较远.
- 吕晓平魏辅文李明杨光刘海
- 关键词：梅花鹿MTDNA种群结构系统进化
