国家自然科学基金(30970204)
- 作品数：2 被引量：6H指数：1
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- 相关机构：中国科学院中国科学院研究生院更多>>
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- 相关领域：生物学更多>>
- 南川绣线菊和细枝绣线菊分子水平研究被引量：1
- 2012年
- 对6个野外居群(南川绣线菊和细枝绣线各3个)36个个体进行叶绿体(chloroplast,cp)DNA trnL-trnF片断测序分析。在南川绣线菊中发现了3个单倍型(Ros1-Ros3),在细枝绣线菊中发现了2个单倍型(Myr1-Myr2)。两个种的序列联合分析对位排列后得到850 bp,共有9个变异位点,其中一个为碱基插入或缺失,另外8个为碱基置换,变异位点的百分率为0.11。对单倍型的遗传多样性分析表明同一区域亲缘关系相近的单倍型发生于同一居群中,并且存在着明显的分子系统地理学关系。以蔷薇科另两个外属植物Rosa californica和Sorbaria sorbifolia为外类群构建这两个种的最大简约(MP)树、最大似然(ML)树及贝叶斯树,结果获得了分辨良好的种间关系树。这表明在分子水平上两个种之间存在明显的差异,这与形态学上的表现是相一致的。遗传多样性分析结果表明了cpDNAtrnL-trnF片段对于绣线菊属的分子地理学研究还是比较有效的,可以通过进一步的大面积采样和分析来揭示植物的遗传结构、冰期避难所等问题。
- 张发起高庆波李印虎付鹏程邢睿陈世龙
- 关键词：CPDNA单倍型
- 横断山区高山绣线菊的谱系地理学研究被引量：6
- 2012年
- 横断山区作为青藏高原东南部主要的一个冰期避难所,第四纪冰期气候的变化对该地区的植物地理分布和居群遗传结构都产生了重要的影响。为了揭示该地区物种分布的分子系统地理学结构,选取在该地区广泛分布的一种高山灌木-高山绣线菊的叶绿体trnL-trnF序列进行研究。采集了15个居群182个个体进行测序,共发现7个单倍型。总的遗传多样性较高(HT=0.809),但居群内遗传多样性较低(HS=0.236)。分子变异分析(AMOVA)结果表明分布区内高山绣线菊的遗传变异主要存在于居群间(84.48%),且居群间的遗传分化很高(GST=0.708,FST=0.84476,NST=0.863),有着显著的谱系地理学结构(NST>GST,P<0.01)和较低的居群间平均基因流(Nm=0.09)。单倍型的系统进化树和进化分支网络分析得到了相似的拓扑结构,7种单倍型都按照地理分布聚为三支:横断山区西部、横断山区东部以及两者的交接地带。本研究推测该物种在横断山区存在多个冰期避难所,而没有表现出大规模的种群集体扩张和迁移的现象。青藏高原隆升、第四纪气候的反复波动以及横断山区特殊的地理环境使得原来连续的居群片段化,并发生范围扩张,从而塑造了高山绣线菊的现代生物地理分布格局。
- 张发起高庆波段义忠张得钧陈世龙
- 关键词：谱系地理学叶绿体DNATRNL-TRNF
