中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-YW-Z-1024)
- 作品数：4 被引量：19H指数：2
- 相关作者：李晶晶胡自民段德麟王静王霞更多>>
- 相关机构：中国科学院华南植物园中国科学院大学中国科学院更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程重要方向项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 观光木片断化居群的遗传多样性和交配系统被引量：14
- 2012年
- 观光木(Tsoongiodendron odorum)是我国特有的濒危植物,有居群较小、间断分布的特点。为探讨生境片断化对观光木居群的遗传多样性和交配系统的影响,我们采用8对微卫星引物对采自广东南昆山的观光木片断化居群的61个成株和15个家系共780个种子进行了基因分型,调查了5个空间隔离的斑块中观光木的两代遗传多样性以及各个层次(居群、斑块及个体)的交配系统参数。结果显示:片断化生境中观光木成株遗传多样性水平适中(HE=0.522),种子遗传多样性比成株稍低(HE=0.499),但没有显著的差异,近交系数在种子中也没有显著的升高,暗示生境片断化并没有侵蚀观光木的遗传多样性;多位点交配系统分析(MLTR)结果表明,该片断化生境中观光木为高度异交树种(tm=1.000),只有较少的双亲近交(biparental inbreeding)和相关性交配(correlated mating)事件发生,但有效花粉供体(effective pollen donor)数目较少(Nep为3.7-5.4);5个斑块间异交率差异不明显,但小的斑块有效花粉供体相对较多;另外,观光木个体之间的异交率存在明显差异,少数个体存在自交现象。这些结果为濒危物种观光木的长期保护提供了重要的遗传学信息。
- 王霞王静蒋敬虎康明
- 四照花亚属的nrDNA ITS致同进化不完全被引量：4
- 2013年
- 四照花亚属（Cornus subg. Syncarpea）隶属于山茱萸科山茱萸属（Cornus）,我国该亚属共有5种8亚种。为探讨四照花亚属nrDNA ITS序列的致同进化不完全现象及假基因产生的可能原因,分析了该亚属4种（每种1～2个居群）共21个个体的nrDNA ITS序列。结果表明,这些类群的nrDNA ITS存在多态性,通过分析这些nrDNA ITS克隆序列的G＋C含量、5.8S保守基序和二级结构最小自由能,推测其可能存在假基因。系统发育研究结果显示所有nrDNA ITS序列分成5个分支,同一个体的不同拷贝被分别置于两个甚至多个分支中,且不同分支显示了不同种间关系。四照花亚属物种个体内部存在nrDNA ITS不完全致同进化,可能归咎于不完全的世系分选（incomplete lineage sorting）、种间杂交或多倍化等进化事件,从而导致基因组内nrITS区序列出现多态性,同时也导致难以通过外部形态来划分亚属内种间界限。
- 胡兆锋向秋云黄宏文
- 关键词：NRDNA假基因
- 水平扫描技术及其在生态学中的应用前景
- 2011年
- 水平扫描是一项在计算科学、工程和医学等领域被广泛应用的技术,其原理即是对潜在的新兴事物、威胁、机遇和技术体系进行系统检查。该技术自2008年被引入生态学领域以来,迅速在生物多样性和生态安全监管研究中展现出广阔的应用潜力。水平扫描技术不仅有助于政府决策层与管理机构积极面对各种在未来难以预测的生态环境风险,进而在制定和实施与生态环境检测和保护等相关的政策措施时更加谨慎、全面和有据可依,而且能够提升政府和环保部门应对与生态环境变化密切相关的重大突发性事件的能力。目前,我国在利用水平扫描进行生态环境风险评估、生物多样性保护和生物安全检测等领域的应用研究或报道还处于空白。在全球化导致重大生态环境事件突发风险日益增加的背景下,国内的生态学研究机构和团队可优先在外来物种入侵监管、重大地质灾害、环境生态安全和生物多样性丧失这四个领域进行水平扫描研究,以应对当前日益严峻的生态环境保护形势。
- 胡自民李晶晶李伟段德麟
- 关键词：生态安全生物多样性保护
- 加拿大–西北大西洋地区掌形藻的种群遗传结构与动态变化被引量：1
- 2013年
- 探讨古气候波动(如更新世末期冰期)对典型生物的时空分布和有效种群大小变动的影响是生物地理学和进化遗传学的重要研究课题。本文利用线粒体cox2–3序列和RAPD两种分子标记,对分布于加拿大–西北大西洋地区8个地点(共138个个体)的掌形藻(Palmaria palmata)进行谱系地理学研究,试图阐明当更新世冰期来临时掌形藻如何衍生出适应性的进化机制,并形成当前的地理分布格局。结果表明,线粒体cox2–3间区序列共检测出11个单倍型,其中1个单倍型(C3)在所有种群中都有分布,并位于星状基因谱系的中心位置,可认为是祖先单倍型。St.Lawrence湾内北部的两个种群多样性最高,与其他地理种群分化最明显,这与基于RAPD数据的STRUCTURE聚类分析结果相一致。根据掌形藻遗传多样性及其单倍型谱系结构特征,推测掌形藻在加拿大–西北大西洋沿岸存在多个冰期避难所。分子多态性分析(AMOVA)显示掌形藻的遗传变异主要来自种群内,而St.Lawrence湾和Fundy湾群组间的遗传变异较小。cox2–3序列的Bayesianskylineplots分析结果反映出掌形藻种群在加拿大–西北大西洋沿岸经历了轻微的种群扩张,时间大概在0.18–0.13百万年前。St.Lawrence湾和Fundy湾群组间的K2P遗传距离为0.2%,相应的分化时间大约在0.36百万年前。由此推测,更新世末期的冰期及间冰期是影响掌形藻种群结构及变动的重要古气候环境因子。
- 李晶晶张杰胡自民段德麟
- 关键词：末次盛冰期
