国家自然科学基金(30871686)
- 作品数：4 被引量：13H指数：2
- 相关作者：杜晓云罗正荣张青林黄建民张明德更多>>
- 相关机构：华中农业大学江西省农业科学院北京市房山区林业局更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江西省农科院创新基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 内切酶接头引物对柿属SSAP分子标记扩增的影响被引量：1
- 2010年
- SSAP(sequence-specificam plification polymorphism,序列特异扩增多态性)是种质遗传多样性分析和系统进化研究的有力工具之一。根据10个SSAP引物组合对28份柿属基因型的扩增结果探讨内切酶因素对SSAP逆转座子分子标记扩增的影响。结果表明,在以MseI和EcoRI组合消化的SSAP反应系统,且均以3个碱基作为末端选择性碱基的前提下,MseI与逆转座子引物组合的SSAP扩增性能优于EcoRI与逆转座子引物组合。研究结果为有目的和高效选择内切酶引物进行植物种质资源SSAP分析提供参考。
- 杜晓云黄建民张青林罗正荣
- 关键词：逆转座子
- 植物逆转座子引物开发应用中的逆转座子序列分离方法
- 2010年
- 文章介绍了作为植物逆转座子引物开发前提序列的逆转座子序列获得的几种方法:(1)通过同源克隆法获取逆转座子的基因序列以设计逆转座子基因序列特异引物;(2)通过筛选文库、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)、搜寻核酸数据库、大片段重叠群测序分离全长逆转座子序列以开发逆转座子长末端重复(long terminal repeat,LTR)引物;以及利用(3)磁珠富集、(4)抑制PCR和(5)SiteFinding PCR等方法直接获得逆转座子的LTR序列以开发逆转座子LTR引物。
- 杜晓云张青林黄建民罗正荣
- 关键词：逆转座子引物植物分子标记
- 基于IRAP技术的磨盘柿变异单株鉴定被引量：8
- 2011年
- 以已知亲子关系的柿品种、柿近缘种和磨盘柿标准品种为对照,对采自北京市房山区磨盘柿产区的部分变异单株进行了IRAP分析。结果表明,19条逆转座子引物中的4个(rtdk13-f5,rtdk16-r10,rtdk4-p3和rtdk2-p6)可将供试11份变异单株完全区分;供试变异单株间的相似系数在0.90～0.98(平均0.94),与磨盘柿标准品种的相似系数为0.91,大于种间和品种间相似系数,与芽变类型及其母株间的相似系数接近;聚类分析结果表明,变异单株与磨盘柿标准品种紧密相聚,分支模式与种间及品种间明显有别。因此,供试11份变异单株已发生部分遗传物质改变,且可能为磨盘柿芽变。IRAP可区分遗传背景高度相似的种质间的微小变异,可望在果树芽变鉴定中应用。
- 杜晓云张青林李宝冷平张明德黄建民罗正荣
- 关键词：亲缘关系芽变UPGMA
- 逆转座子分子标记及其在果树上的应用被引量：5
- 2009年
- 基于逆转座子特殊的转座机制及其生物学特性发展的逆转座子分子标记,具有多态性高、基因组覆盖度广、适于高通量分析等特点。就常见逆转座子分子标记的原理、操作及其在果树种质鉴定、遗传多样性检测、亲缘关系重建和遗传图谱构建等方面的应用进展进行简要阐述,以期为此类技术在果树上的应用提供参考。
- 杜晓云张青林罗正荣
- 关键词：果树IRAPREMAPSSAP亲缘关系
- 罗田甜柿单株遗传差异的ISSR和IRAP分析
- 罗田甜柿(Diospyros kaki Thunb.‘Luotian-tianshi’)是中国中部大别山区原产的第一个完全甜柿(pollination-constant non-astringent,PCNA),但其是一...
- 袁录霞张青林罗正荣
- 关键词：罗田甜柿ISSRIRAP
- 文献传递
