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国家自然科学基金(30270293)

作品数:1 被引量:4H指数:1
相关作者:薛宇符传孩姚雪彪窦震周庆更多>>
相关机构:中国科学技术大学更多>>
发文基金:中国科学院知识创新工程国家教育部博士点基金国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇蛋白
  • 1篇动蛋白
  • 1篇驱动蛋白
  • 1篇全长
  • 1篇基因
  • 1篇基因组
  • 1篇基因组学
  • 1篇比较基因组
  • 1篇比较基因组学
  • 1篇CENP-E
  • 1篇哺乳动物

机构

  • 1篇中国科学技术...

作者

  • 1篇刘丹
  • 1篇周庆
  • 1篇窦震
  • 1篇姚雪彪
  • 1篇符传孩
  • 1篇薛宇

传媒

  • 1篇科学通报

年份

  • 1篇2006
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
哺乳动物驱动蛋白的计算基因组学分析与鉴定被引量:4
2006年
提供了一种新颖的、基于比较基因组学方法的全长驱动蛋白预测方法(full-lengthkinesinpredictionprogram,FKPP),用于哺乳动物中驱动蛋白质组的鉴定与研究.之前的预测认为,哺乳动物共含94个驱动蛋白,而用FKPP从哺乳动物的基因组中总共鉴定出134个可能的驱动蛋白基因.基于数据库中存在的片段序列,用FKPP鉴定出25个可能的全长驱动蛋白.此外,用FKPP方法发现人的动点马达蛋白CENP-E应包含2701个氨基酸,而不是当初根据克隆预测的2663个氨基酸.通过对CENP-E的cDNA进行重测序,并同时采用特异性识别FKPP预测的CENP-E多肽抗体予以实验评估,结果表明,FKPP预测的CENP-E氨基酸序列是正确的.为此,本研究利用FKPP对哺乳动物的驱动蛋白进行了重新分类.鉴于目前公共数据库含有较多非全长序列的蛋白片段,FKPP可提供一个具有显著效率且准确新颖的全长序列预测手段,用于驱动蛋白以及其他蛋白家族的分子鉴定.
薛宇刘丹符传孩窦震周庆姚雪彪
关键词:驱动蛋白比较基因组学CENP-E
共1页<1>
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