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国家自然科学基金(31070534)

作品数:4 被引量:75H指数:4
相关作者:袁丽钗卢善发崔秀娜苏晓娟樊保国更多>>
相关机构:中国医学科学院北京协和医学院山西师范大学黔南民族医学高等专科学校更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学生物学自动化与计算机技术医药卫生更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 2篇农业科学
  • 1篇生物学
  • 1篇自动化与计算...
  • 1篇医药卫生

主题

  • 2篇胁迫
  • 2篇锌胁迫
  • 2篇基因
  • 1篇丹参
  • 1篇多酚
  • 1篇多酚氧化
  • 1篇多酚氧化酶
  • 1篇荧光
  • 1篇荧光定量
  • 1篇三萜
  • 1篇三萜类
  • 1篇实时定量PC...
  • 1篇实时荧光
  • 1篇实时荧光定量
  • 1篇萜类
  • 1篇鲨烯
  • 1篇鲨烯合酶
  • 1篇微小RNA
  • 1篇内参
  • 1篇内参基因

机构

  • 3篇中国医学科学...
  • 2篇山西师范大学
  • 1篇辽宁工程技术...
  • 1篇天津中医药大...
  • 1篇黔南民族医学...

作者

  • 3篇卢善发
  • 3篇袁丽钗
  • 2篇苏晓娟
  • 2篇崔秀娜
  • 1篇张林甦
  • 1篇王海英
  • 1篇吴祥云
  • 1篇樊保国
  • 1篇侯学敏
  • 1篇马艺沔

传媒

  • 1篇中草药
  • 1篇Journa...
  • 1篇植物学报
  • 1篇中国科学:生...

年份

  • 1篇2014
  • 1篇2013
  • 1篇2012
  • 1篇2011
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
Conservation and Diversity of MicroRNA-associated Copper-regulatory Networks in Populus trichocarpa被引量:15
2011年
Plants develop important regulatory networks to adapt to the frequently-changing availability of copper (Cu), However, little is known about miRNA-associated Cu-regulatory networks in plant species other than Arabidopsis. Here, we report that Cu-responsive miRNAs in Populus trichocarpa (Torr. & Gray) include not only conserved miR397, miR398 and miR408, but also Populus-specific miR1444, suggesting the conservation and diversity of Cu-responsive miRNAs in plants. Copper-associated suppression of mature miRNAs is in company with the up-regulation of their target genes encoding Cu-containing proteins in Populus. The targets include miR397-targeted PtLAC5, PtLAC6 and PtLAC110a, miR398- targeted PtCSD1, PtCSD2a and PtCSD2b, miR408-targeted PtPCL1, PtPCL2, PtPCL3 and PtLAC4, and miR1444-targeted PtPP03 and PtPP06. Consistently, P. trichocarpa miR408 promoter-directed GUS gene expression is down-regulated by Cu in transgenic tobacco plants. Cu-response elements (CuREs) are found in the promoters of Cu-responsive miRNA genes. We identified 34 SQUAMOSA-promoter binding protein-like (SPL) genes, of which 17 are full-length PtSPL proteins or partial sequences with at least 300 amino acids. Phylogenetic analysis indicates that PtSPL3 and PtSPL4 are CuRE-binding proteins controlling Cu-responsive gene expression. Cu appears to be not involved in the regulation of these transcription factors because neither PtSPL3 nor PtSPL4 is Cu-regulated and no CuRE exists in their promoters.
Shanfa LuChenmin YangVincent L. Chiang
关键词:COPPERMICRORNAPOPULUS
miR1444a参与毛果杨对锌胁迫的响应被引量:4
2012年
miR1444a是杨树特异的miR1444家族中的一员,在植物对干旱、机械和铜等环境胁迫的响应中发挥重要作用.本研究通过RACE技术克隆得到毛果杨MIR1444a基因.该基因全长691bp,含单一外显子.生物信息学分析发现其启动子区存在大量胁迫响应相关的顺式作用元件,其中以前报道的5个与铜胁迫相关的CuRE元件中有4个位于转录本的5′末端,1个在转录起始点上游.qRT-PCR分析miR1444a成熟体及其靶基因PtPPO3和PtPPO6的表达与锌胁迫的关系,发现随着Zn2+浓度的增加,毛果杨根、茎、叶中miR1444a的表达均呈上升趋势,而PtPPO3和PtPPO6的表达均下降,说明miR1444a受Zn2+调控,参与毛果杨对锌胁迫的响应.
崔秀娜袁丽钗苏晓娟吴祥云王海英卢善发
关键词:微小RNA多酚氧化酶锌胁迫
2个丹参鲨烯合酶基因的克隆和鉴定被引量:9
2014年
目的克隆与鉴定丹参Salvia miltiorrhiza鲨烯合酶基因。方法基于丹参基因组的基因预测结果设计引物,通过RT-PCR方法,克隆丹参鲨烯合酶基因。利用生物信息软件对基因序列进行了结构分析,对基因编码多肽进行了序列同源性比较和保守结构域分析,利用实时定量RT-PCR方法对基因进行表达模式研究。结果通过RT-PCR方法扩增得到2个丹参鲨烯合酶基因(SmSQS1和SmSQS2),它们编码的多肽具有鲨烯合酶相关结构域和保守基序。这2个基因具有不同的外显子/内含子结构特征,具有不同的组织特异性表达模式和时间表达模式。结论丹参基因组中存在2个鲨烯合酶基因,它们具有不同的基因结构特征和表达模式,可能在丹参甾体类和三萜类化合物生物合成中起不同作用。
马艺沔袁丽钗张林甦侯学敏卢善发
关键词:丹参三萜类鲨烯合酶基因克隆基因表达
实时荧光定量PCR分析中毛果杨内参基因的筛选和验证被引量:49
2013年
实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术具有高灵敏性、高保真性和高特异性,被广泛应用于基因表达的分析。在数据处理过程中,选用稳定表达的基因作为内参基因对准确分析实验结果非常关键。以毛果杨(Populus trichocarpa)的不同组织以及锌胁迫下的组培苗为材料,使用荧光定量PCR方法分析了TUA8、TUB6、ubiquitin、GAPDH、actin、18S rRNA和EF1α7个看家基因的表达情况。通过geNorm、NormFinder和BestKeeper 3个程序的综合分析,发现actin、ubiquitin、EF1α和18S rRNA的稳定性较好,可用作毛果杨基因表达研究的内参基因;而TUB6在不同组织中稳定性最差;GAPDH在锌胁迫下的组织中稳定性最差,因此不适宜作为内参基因。毛果杨NAC基因的表达分析,进一步验证了上述结果。该研究对采用qRT-PCR方法分析毛果杨基因表达过程中内参基因的选择具有指导作用,同时对揭示NAC基因的功能也有一定的意义。
苏晓娟樊保国袁丽钗崔秀娜卢善发
关键词:实时定量PCR内参基因锌胁迫
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