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国家自然科学基金(30270274)

作品数:7 被引量:44H指数:4
相关作者:蔡宝立赵化冰李永君梁靖任河山更多>>
相关机构:南开大学中国科学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金中国博士后科学基金更多>>
相关领域:环境科学与工程生物学理学更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 5篇环境科学与工...
  • 1篇生物学
  • 1篇理学

主题

  • 4篇降解
  • 2篇单胞菌
  • 2篇生物降解
  • 2篇假单胞菌
  • 2篇降解基因
  • 2篇降解细菌
  • 2篇恶臭
  • 2篇分子检测
  • 2篇DNA杂交
  • 1篇代谢
  • 1篇异化
  • 1篇异化作用
  • 1篇生物修复
  • 1篇水杨醛
  • 1篇土壤修复
  • 1篇裂解
  • 1篇菌株
  • 1篇基因
  • 1篇基因检测
  • 1篇核苷

机构

  • 6篇南开大学
  • 1篇中国科学院

作者

  • 6篇赵化冰
  • 6篇蔡宝立
  • 4篇李永君
  • 2篇陈威
  • 2篇任河山
  • 2篇梁靖
  • 1篇马琳
  • 1篇严冰
  • 1篇刘斌
  • 1篇雷虹
  • 1篇丁蕊

传媒

  • 2篇食品与生物技...
  • 1篇科学通报
  • 1篇微生物学报
  • 1篇生态学杂志
  • 1篇南开大学学报...
  • 1篇Scienc...

年份

  • 3篇2007
  • 2篇2006
  • 1篇2005
  • 1篇2004
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
假单胞菌ND6菌株水杨酸羟化酶基因(nahG)的核苷酸序列分析和酶鉴定被引量:6
2004年
水杨酸羟化酶是细菌萘降解途径中的关键酶,它能催化水杨酸脱羟和羟化,生成儿茶酚.假单胞菌(Pseudomonas)DN6菌株的萘降解基因位于102kb的质粒pND6-1上,以pUC18质粒为载体,制备了含有1~3kbpND6-1DNA随机片段的基因文库,通过DNA测序和DNA序列同源性分析,从基因文库中筛选出含有水杨酸羟化酶基因nahG的克隆.nahG基因的大小为1305bp,编码的水杨酸羟化酶(NahG)由434个氨基酸组成,与PseudomonasputidaNCIB9816-4菌株的水杨酸羟化酶基因相比,核苷酸序列的同源性为100%,与其它10种细菌的水杨酸羟化酶基因相比,核苷酸序列的同源性为32%~99%.酶学实验表明,ND6菌株的水杨酸羟化酶具有广泛的底物特异性,它不仅能代谢水杨酸,还能代谢多种水杨酸的衍生物,如乙酰水杨酸、黄基水杨酸、3-甲基水杨酸、5-甲基水杨酸和5-氯水杨酸等.
赵化冰刘斌马琳李永君蔡宝立
关键词:核苷酸序列
萘降解细菌的分离及其降解基因的分子检测被引量:9
2006年
从污水处理厂的活性污泥和石油工业废水中各分离到24个降解萘的细菌分离株,提取这些分离株的总DNA,然后与各种萘降解基因杂交。结果表明,这2个来源的分离株在萘降解基因的种类上有明显不同。来自工业废水的分离株含有萘双加氧酶的铁硫蛋白大亚基基因nahAc,水杨醛脱氢酶基因nahF及其重复基因nahV,水杨酸羟化酶基因nahG及其重复基因nahU,儿茶酚2,3-双加氧酶基因nahH和儿茶酚1,2-双加氧酶基因catA,以及萘趋化蛋白基因nahY。来自活性污泥的分离株只含有nahAc、nahF、nahG和catA,不含有nahY、nahV、nahU和nahH。
李永君赵化冰任河山梁靖蔡宝立
关键词:生物降解DNA杂交基因检测
降解萘的假单胞菌ND24菌株的分离和萘污染土壤的生物修复被引量:21
2005年
用富集培养法从石油工业废水中分离到高效降解萘的ND24菌株.该菌株能以萘为惟一碳源生长,在48 h内将无机盐培养基中2 g/L的萘降解98.4%.该菌株还能降解水杨酸、对羟基苯甲酸、邻苯二甲酸和苯乙酸.16S rRNA基因测序和同源序列比对表明,ND24菌株属于假单胞菌(Pseudomonassp.).将ND24菌株接种到含有0.2 g/dL萘的灭菌土壤中,经过14 d室温培养以后,萘的去除率为98.2%.
蔡宝立李永君梁靖赵化冰
关键词:生物降解假单胞菌土壤修复
恶臭假单胞菌ND6菌株中与萘降解相关的新型水杨醛脱氢酶NahV被引量:1
2007年
在大肠杆菌中表达了Pseudomonas putida ND6菌株中与萘降解有关的水杨醛脱氢酶同工酶NahV,并对其酶学性质进行了研究.结果表明,NahV与ND6菌株中经典的水杨醛脱氢酶NahF的氨基酸序列同源性较低,是一种新的水杨醛脱氢酶.对NahV和NahF的酶动力学研究结果表明,NahF具有更高的催化效率,而NahV对水杨醛和NAD+的亲和力更强.ND6菌株的NahV和NahF都有较宽的底物范围,可以催化水杨醛、5-氯水杨醛、甲醛、间硝基苯甲醛、邻硝基苯甲醛、邻甲氧基苯甲醛、戊二醛、辛醛和乙二醛的脱氢反应,但对不同底物的催化效率不同.Fe2+,Cu2+和Zn2+对NahV有激活作用,而NahF只能被Fe2+激活.NahF具有更好的热稳定性,在50℃保温30min仍有72.8%的酶活力,而NahV则丧失了88.8%的酶活力.DNA斑点杂交结果表明,类nahF基因在本研究检测的两种来源的萘降解细菌中都存在,而类nahV基因只存在于一种来源的萘降解细菌中.
赵化冰李永君陈威蔡宝立
关键词:PSEUDOMONASPUTIDADNA杂交
恶臭假单胞菌ND6菌株catA基因的克隆和表达及其儿茶酚裂解途径探讨被引量:4
2007年
恶臭假单胞菌ND6菌株的萘降解质粒pND6-1中编码儿茶酚1,2-双加氧酶的catA基因在大肠杆菌中进行了克隆和表达,并研究表达产物的酶学性质。结果表明:酶的Km为0.019μmol/L,Vmax为1.434μmol/(min.mg);具有很好的耐热性,在50℃保温45min后仍能够保留酶活力的93.7%;Fe2+对酶活性有显著的促进作用,其比活力是对照反应的292%;酶对4-氯儿茶酚的催化活性非常低,属于Ⅰ型儿茶酚1,2-双加氧酶。以萘为底物生长时,ND6菌株的细胞提取液中既存在催化邻位裂解途径的儿茶酚1,2-双加氧酶活性,也存在催化间位裂解途径的儿茶酚2,3-双加氧酶活性。以苯甲酸、对羟基苯甲酸和苯乙酸为唯一碳源生长时,ND6菌株细胞提取液的儿茶酚1,2-双加氧酶活性远远大于儿茶酚2,3-双加氧酶活性。表明ND6菌株既能通过儿茶酚间位裂解途径降解萘,也能通过儿茶酚邻位裂解途径降解萘,而以苯甲酸、对羟基苯甲酸和苯乙酸为诱导物时只利用儿茶酚邻位裂解途径。
赵化冰陈威蔡宝立
A novel salicylaldehyde dehydrogenase-NahV involved in catabolism of naphthalene from Pseudomonas putida ND6被引量:4
2007年
A novel salicylaldehyde dehydrogenase involved in catabolism of naphthalene from Pseudomonas putida ND6, NahV, has been identified. NahV exhibited lower identity in amino acid sequence with the classic salicylaldehyde dehydrogenase, NahF, from P. putida ND6. This is the first report of an isofunctional enzyme of bacterial salicylaldehyde dehydrogenase. Comparison of Km and Vmax values of NahV and NahF demonstrated that NahF has a more efficient catalytic reaction than NahV, while NahV has much higher affinity for salicylaldehyde and NAD+. Both enzymes exhibited broad substrate speci- ficities and catalyzed the oxidation of salicylaldehyde, 5-chlorosalicylaldehyde, formaldehyde, m-nitrobenzaldehyde, o-nitrobenzaldehyde, o-methoxybenxaldehyde, glutaraldehyde, caprylic aldehyde, and glyoxal. However, the relative rates at which the substituted analogs are transformed differ considerably. NahV activity could be enhanced by Fe2+, Cu2+ and Zn2+; whereas NahF activity could only be stimulated by Fe2+. NahF is more stable than NahV at elevated temperatures. Dot-blot hybridization analyses showed that nahF-like genes occurred in all naphthalene-degradation bacteria isolated in this study, whereas nahV-like genes were present in only some naphthalene-degrading bacteria.
ZHAO HuaBingLI YongJunCHEN WeiCAI BaoLi
关键词:水杨醛异化作用分解代谢
萘降解细菌的分离及其降解和转座基因的分子检测被引量:8
2006年
用富集培养法,从工业废水和活性污泥中分离到9个高效降解萘的细菌菌株(ND7~ND15).对菌株ND7、ND8、ND9和ND10所进行的16SrDNA序列分析表明,它们都属于假单胞菌属(Pseudomonas).PCR实验结果表明,上述4个菌株都含有蔡降解基因nahAc、nahG、nahH和catA,ND7和ND8菌株还含有萘降解基因nahU.DNA杂交实验结果表明,上述9个萘降解菌株都含有转座酶基因tnpA1和解体酶基因tnpR.这些结果表明,萘降解细菌的降解基因和转座基因具有高度的保守性.酶学实验证明,ND7、ND8、ND9和ND10菌株都具有儿茶酚1,2-双加氧酶活力和儿萘酚2,3-双加氧酶活力,但在不同菌株中这两种酶的比活力有明显不同.
蔡宝立丁蕊任河山雷虹严冰赵化冰
关键词:假单胞菌
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