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湖南省教育厅科研基金(06C526)
作品数:
2
被引量:1
H指数:1
相关作者:
谢民主
陈建二
王建新
刘新求
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相关机构:
湖南师范大学
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发文基金:
湖南省教育厅科研基金
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2008
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单体型组装问题MEC/GI模型的参数化算法
被引量:1
2008年
根据 DNA 测序片段数据的特点,提出了一个时间复杂度为 O(nk_22^(k_2)+mlogm+mk_1)的单体型组装问题 MEC/GI 模型的参数化算法,其中 m 为片段数,n 为单体型的 SNP位点数,k_1 为一个片段覆盖的最大 SNP 位点数(通常小于10),k_2为覆盖同一 SNP 位点的片段的最大数(通常不大于10)。对于实际 DNA 测序中的片段数据,即使 m 和 n 都相当大,该算法也可以在较短的时间得到 MEC/GI 模型的精确解,具有良好的可扩展性和较高的实用价值。
谢民主
王建新
陈建二
关键词:
生物信息学
参数化算法
单体型
单核苷酸多态性
数据库技术在生物信息学中的应用
2008年
阐述了生物信息学研究中重要的数据库及其应用,并对其发展进行了展望.
谢民主
刘新求
关键词:
生物信息学
数据库技术
生物数据
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