国家自然科学基金(30871917)
- 作品数：5 被引量：11H指数：3
- 相关作者：苏建国杨春荣董捷汪亚平彭丽敏更多>>
- 相关机构：西北农林科技大学中国科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 团头鲂Toll样受体3基因的克隆及特征研究被引量：3
- 2009年
- 苏建国朱作言汪亚平
- 关键词：团头鲂TOLL样受体3基因克隆
- 草鱼BAC文库中TLR3基因的筛选及表达特征的研究被引量：3
- 2010年
- 【目的】从草鱼的BAC文库中筛选TLR3基因的阳性克隆,研究该基因在草鱼体内的表达规律,为进一步研究奠定基础。【方法】用同位素P32标记的探针,对53 216个BAC克隆以双份平行形式制备的DNA尼龙膜进行杂交筛选,用半定量方法检测TLR3在草鱼不同组织(鳃、心脏、肠、肝胰脏、肌肉、皮肤、脾脏、头肾和中肾)中的表达模式,用实时荧光定量RT-PCR研究草鱼感染呼肠孤病毒后不同时间TLR3的表达规律。【结果】获得了2个TLR3基因的阳性BAC克隆,该基因在被检测的9个组织中都有表达,其中在脾脏、皮肤中的表达量较高。在感染呼肠孤病毒后24 h,草鱼肝胰脏中TLR3的相对表达量显著升高(P<0.05);感染后48 h,其相对表达量恢复到正常水平(P>0.05)。【结论】成功筛选到草鱼TLR3的BAC克隆,该基因在草鱼体内不同组织中有广泛表达,并且参与了草鱼抗呼肠孤病毒的过程。
- 杨春荣苏建国张荣芳董捷汪亚平张成勋
- 关键词：草鱼BAC文库基因表达
- 草鱼脂多糖结合蛋白的分离纯化(英文)被引量：1
- 2010年
- 脂多糖结合蛋白(lipopolysaccharide binding proteins ,LBP)是机体对革兰氏阴性菌感染产生的可溶性急性期蛋白,结合并提呈LPS给细胞表面的模式识别受体,激发免疫反应。在本试验中,用低浓度嗜水气单胞菌( Aeromonas hydrophila)感染草鱼(Ctenopharyngodon idellus)24 h后,抽取全血,离心,获得血浆。结合LBP活性检测,经硫酸铵沉淀、CMSephadex C-50阳离子交换层析和DEAE Sephadex A-25阴离子交换层析后,分离纯化得到LBP。该蛋白对异硫氰酸荧光素标记的脂多糖(Fluorescein isothiocyanate labeled li-popolysaccharide ,FITC-LPS)有较强的结合能力。在SDS-PAGE电泳后,考马斯亮蓝染色可见3条明显的带,分子量大约为68、53和48 kDa。同时探索一条简便分离纯化脂多糖结合蛋白的方法,为进一步研究LBP的功能奠定了基础。
- 黄腾苏建国董捷
- 关键词：脂多糖结合蛋白草鱼纯化
- 草鱼BPI/LBP基因的克隆及特征研究被引量：1
- 2011年
- 【目的】克隆草鱼杀菌通透性增加蛋白/脂多糖结合蛋白(Bactericidal permeability-increasing pro-tein/LPS-binding protein,BPI/LBP)基因的cDNA全长,分析其结构特征,研究其表达规律,为进一步探明其功能奠定基础。【方法】首先用同源克隆及快速扩增cDNA末端技术(RACE),克隆草鱼BPI/LBP基因的cDNA全长,然后用生物信息学方法分析BPI/LBP基因的结构特征,最后用半定量RT-PCR检测BPI/LBP基因在草鱼不同组织(血、脑、眼睛、前肠、中肠、后肠、鳔、鳃、头肾、中肾、心脏、肝胰脏、肌肉、皮肤和脾脏)中的表达模式。【结果】草鱼BPI/LBPcDNA全长1 568 bp,编码473个氨基酸,其中包括18个氨基酸组成的信号肽、BPI1结构域(BPI/LBP/CETP N-ter-minal domain)和BPI2结构域(BPI/LBP/CETP C-terminal domain)。该蛋白的分子质量为51 551 u,等电点为8.69。氨基酸序列同源性分析结果显示,草鱼与鲤鱼BPI/LBP的同源性最高(90%),其次为虹鳟(73%)、斑点叉尾鮰(73%)、香鱼(72%)等。在系统进化树中,草鱼BPI/LBP首先与鲤科的鲤鱼聚为一类。通过半定量RT-PCR分析可知,草鱼BPI/LBP基因在被检测的15个组织中都有表达,其中在鳃中的表达量最高,其次为头肾、中肾等。【结论】成功克隆了草鱼BPI/LBP基因的cDNA全长,该基因在草鱼体内不同组织中广泛表达。
- 杨春荣苏建国黄腾彭丽敏
- 关键词：草鱼基因克隆
- 草鱼密码子简并性的研究
- ＜正＞引言同义密码子的非随机使用普遍存在于物种间和物种内部,已经成为分子生物学和生物信息学重要的研究课题。鱼类是较原始的水生脊椎动物,几乎占现存脊椎动物总数的一半,鲤科鱼类具有重要的经济价值,是
- 董捷黄腾苏建国汪亚平
- 关键词：草鱼线粒体基因密码子偏好性
- 文献传递
- 草鱼TLR9基因全长cDNA的克隆及特征分析被引量：4
- 2011年
- 采用同源克隆及快速扩增cDNA末端技术,从草鱼鳃组织中克隆了Toll样受体9(Toll-like receptor 9,TLR9)基因的cDNA全长。序列分析表明,草鱼TLR9 cDNA全长3 468 bp,编码1 058个氨基酸,其中包括18个氨基酸组成的信号肽、16个富含亮氨酸重复结构域(leucinerich repeat,LRR)、1个跨膜区和1个TIR结构域(Toll/IL-1 receptor)。该蛋白的分子量为121 921 u,等电点为8.80。氨基酸序列的同源性分析显示,草鱼TLR9与鲤TLR9的同源性最高(85%),依次为斑马鱼(82%)、大西洋鲑(55%)、虹鳟(55%)。在系统发生树上,草鱼TLR9首先与鲤科的鲤和斑马鱼聚类。通过半定量RT-PCR检测可知,草鱼TLR9在被检测的15个组织中都有表达,其中在鳃中的表达最高,其次为血、头肾等。这些结果为进一步深入研究TLR9的功能及开发草鱼免疫增强剂奠定基础。
- 杨春荣苏建国彭丽敏董捷
- 关键词：草鱼
