国家自然科学基金(41271268)
- 作品数：4 被引量：13H指数：3
- 相关作者：倪永清郑晓吉关波张艳孙海龙更多>>
- 相关机构：石河子大学中国科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国博士后科学基金冻土工程国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：生物学天文地球轻工技术与工程化学工程更多>>
- 天山乌鲁木齐河源1号冰川不同海拔可培养空气源酵母菌系统发育及多样性研究被引量：1
- 2021年
- 为了了解天山乌鲁木齐河源1号冰川(简称乌源1号冰川)空气及气溶胶中可培养酵母菌的多样性、系统发育、空间分布及其与冰川生境酵母菌的关系,在乌源1号冰川西支3个海拔梯度位点收集空气气溶胶,采用4种培养基分离空气源酵母菌,根据菌落形态和显微镜镜检细胞形态初步分组,采用MSP-PCR指纹分型和r RNA基因间隔序列(ITS)确定酵母菌菌株的系统发育和分类地位,并分析了空气源酵母菌群落的多样性及空间分布特征。研究表明:从乌源1号冰川的表面空气共分离414株酵母菌,全部隶属于担子菌门(Basidiomycota),MSP-PCR指纹分型划分为53个基因型,代表菌株ITS基因测序结果显示隶属于9属28种,其中24种为伞菌亚门(Agariomycotina)成员,4种属于柄锈菌亚门(Pucciniomycotina),其中Holtermanniella、Vishniacozyma、Filobasidium、Dioszegia为优势酵母菌属。有6株酵母菌最适生长温度为16~18℃,为嗜冷菌,其余24株为耐冷菌,最适生长温度为22~25℃。Holtermanniella festucosa与Vishniacozyma victoriae为冰川空气广布的优势酵母菌种(22.22%、16.91%),其他大多为来自周边生境的耐冷酵母菌,在冰川生境均有分布。此外,在小幅度的海拔梯度上,3个海拔高度的空气酵母菌群落结构有所不同,但多样性指数没有显著差异。冰川生境酵母菌来源与其周边空气酵母菌密切相关,但以Holtermanniella属为代表的空气源优势酵母在冰川生境不能分离,说明冰川的严酷条件对外源微生物具有明显的选择作用。
- 周雅雯白莹莹阚泽宇王珍张艳倪永清
- 天山一号冰川融水中耐冷酵母菌多样性及系统发育被引量：5
- 2015年
- 分离和筛选天山一号冰川融水中可培养的酵母菌,了解冰川中低温酵母菌的生长特性、系统发育和物种多样性,为低温酵母菌资源的收集保护及开发其生物技术利用潜力奠定基础。采用虎红培养基RB分离菌株,对分离菌株的最适生长温度、最适p H及耐盐性进行测试;通过选择性培养基分别测试了菌株的产胞外酶性状,利用26S rRNA基因序列分析确定低温酵母菌种的系统进化地位,并通过MSP-PCR指纹技术对26S rRNA基因高度同源性的菌株做进一步区分。共得到68株低温酵母菌,依据菌落形态、细胞形态进行初步分群,选取具有代表性的15株进行测序,结果显示15株酵母菌株隶属于担子菌(Basidiomycetes)和子囊菌(Ascomycetes),共7个属,只有BCY-12隶属于子囊菌的Pichia属,其他菌株全部属于担子菌,其中隐球酵母属(Cryptococcus)占40%。菌株产酶性状研究显示,7株可产脂肪酶,4株可产酯酶,11株可产淀粉酶,11株可产蛋白酶,3株可产果胶酶,2株可产几丁质酶。天山一号冰川融水中具有较丰富的低温酵母菌,系统发育多样,产酶特性差异较大。分离菌株大多属于耐冷菌范畴,Cryptococcus属的菌株为优势种群。
- 郑晓吉孙海龙关波姜远丽倪永清
- 关键词：多样性系统发育
- 天山乌鲁木齐河源一号冰川表面粉尘蓝细菌群落结构及其系统发育被引量：4
- 2014年
- 【目的】揭示天山乌鲁木齐河源一号冰川表面粉尘中蓝细菌多样性、群落结构及其系统发育,为科学评价冰川表面及相关环境中功能微生物的地球化学循环作用提供参考依据。【方法】采用两对蓝细菌16S rRNA基因特异引物扩增并构建克隆文库,基于序列相似性归类OTU并统计多样性,代表OTU序列与NCBI、RDP数据库比对后构建系统发育树。【结果】天山一号冰川表面粉尘101个蓝细菌克隆序列基于97%的相似性被划分为12个OTU,shannon多样性指数为1.522,系统发育分析显示主要隶属于颤蓝细菌目(Oscillatoriales)和色球蓝细菌目(Chroococcales)。Oscillatoriales包括席蓝细菌属(Phormidium)、微鞘蓝细菌属(Microcoleus)、伪鱼腥蓝细菌属(Pseudanabaena)和颤蓝细菌属(Oscillatoria)4个属,其中Phormidium占绝对优势,68个克隆序列划分为4个OTU,其它3个属的序列较少。Chroococcales仅有1个克隆,与亚球形管胞蓝细菌(Chamaesiphon subglobosus)亲缘关系很近。此外,发现一号冰川表面粉尘的速效磷、速效钾含量是冰川退缩前沿50 m-500 m距离土壤的2-5倍,硝态氮达到10-20倍,有机质含量达到3-9倍,显著高于冰川前沿环境。【结论】天山一号冰川表面粉尘蓝细菌的多样性指数相对较高,以隶属于Phormidium属的成员占绝对优势,对其生态学作用需进一步深入探究。
- 倪雪姣齐兴娥顾燕玲郑晓吉董娟倪永清程国栋
- 关键词：蓝细菌系统发育分析
- 天山乌鲁木齐河源1号冰川浅冰芯中红酵母菌多样性及种系的产酶特性分析被引量：3
- 2020年
- 采用4种分离培养基分离可培养酵母菌,通过分析ITS区序列确定菌株的分类地位。利用多点接触法筛选产酶菌株,并对菌株的生理生化特征进行比较分析。结果显示:从乌鲁木齐河源1号冰川(简称乌源1号冰川)浅冰芯中一共分离得到317株酵母菌,通过ITS rRNA基因序列的NCBI比对和MSP-PCR指纹分型分析发现其中45株为原红酵母菌(Rhodotorula),分为5个种R. glutinis、R. araucariae、R. mucilaginosa、R. kratochvilovae和R. diobovata。通过方差分析和聚类分析对45株红酵母进行产酶差异分析,揭示红酵母菌的各个种群与胞外酶活性的关系。所有菌株至少产两种胞外酶,其中产纤维素酶菌株占98%,产果胶酶菌株占100%,产淀粉酶和脲酶的菌株各47%,产蛋白酶和脂肪酶的菌株分别占20%和9%,而菌株YHB-9、YHB-15、YHB-39和YHB-45可以产5种酶,所有菌株都不产几丁质酶。19株菌的最适生长温度在21℃左右,26株菌的最适生长温度在24℃左右,属于耐冷酵母菌。此外,乌源1号冰川浅冰芯中分离出的红酵母的产酶性状没有表现出物种特异性,即种间差异不显著,但产低温酶性能良好,在生物技术应用方面具有良好的开发潜力。
- 薛梅张瑞蕊张艳关波靳亚梅倪永清
- 关键词：低温酶
