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国家自然科学基金(30871782)

作品数:6 被引量:7H指数:2
相关作者:潘玉春何侃赵洪波王起山白春艳更多>>
相关机构:上海交通大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 5篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 4篇农业科学
  • 2篇生物学

主题

  • 3篇基因
  • 2篇转录
  • 2篇转录因子
  • 1篇代谢
  • 1篇代谢过程
  • 1篇代谢途径
  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇异位症
  • 1篇英文
  • 1篇早期胚胎
  • 1篇早期胚胎发育
  • 1篇早期胚胎发育...
  • 1篇脂肪
  • 1篇脂肪代谢
  • 1篇生长性状
  • 1篇胎发
  • 1篇通路
  • 1篇能量负平衡
  • 1篇胚胎

机构

  • 5篇上海交通大学

作者

  • 5篇潘玉春
  • 3篇王起山
  • 3篇赵洪波
  • 3篇何侃
  • 1篇蒋越
  • 1篇俞沛初
  • 1篇谭桂芳
  • 1篇张向喆
  • 1篇白春艳
  • 1篇陈强
  • 1篇杨仑
  • 1篇陈剑

传媒

  • 2篇上海交通大学...
  • 1篇黑龙江畜牧兽...
  • 1篇遗传
  • 1篇Scienc...

年份

  • 1篇2014
  • 1篇2012
  • 2篇2010
  • 2篇2009
6 条 记 录,以下是 1-6
排序方式:
基因表达谱分析牛早期胚胎发育过程的调控机理被引量:2
2010年
早期胚胎的死亡会给畜牧业的发展带来巨大的经济损失,特别是对于母牛生产来说更是如此,因此研究早期胚胎发育过程具有极为重要的价值。文章从公共数据库GEO中选取了关于牛早期胚胎发育过程的一套基因表达谱数据,通过显著性分析及聚类分析来研究牛早期胚胎发育过程中不同时期的基因组表达模式。结果表明:整个牛早期胚胎发育过程大致可划分为3组不同的基因组表达模式阶段;同时,差显基因在不同时期表达量的波动情况表明8-细胞期和16-细胞期在牛的整个早期胚胎发育过程的重要性。另外,通过进一步的功能注释和通路分析表明在牛胚胎早期发育不同阶段时期存在着一些重要因子及相关通路。
何侃赵洪波白春艳王起山潘玉春
关键词:早期胚胎基因表达谱
基于芯片数据分析关于SREBP-1c调控脂肪代谢过程作用机理的研究被引量:2
2010年
为了研究SREBP—1c作为脂肪代谢过程中重要的核转录因子参与调控动物脂肪代谢过程作用的机理,试验采用显著性差异表达分析及其通路分析在基因表达谱数据库(GEO)中收集到的转录因子SREBP—1c相关的小鼠脂肪组织的转录本芯片数据。结果表明:SREBP—1c是通过一系列的与细胞分化作用相关的靶基因及其通路参与调控脂肪代谢过程的。
何侃蒋越王起山俞沛初潘玉春
关键词:脂肪代谢转录因子靶基因
VEGFA,HIF1A和EPAS1基因多态性与猪繁殖性状的相关研究(英文)
2014年
在梅山猪保种群和法系大白猪群体中采用直接测序法和PCR-RFLP法对基因VEGFA、HIF1A和EPAS1进行了基因多态位点的寻找及多态性检测并对不同基因型的总产仔数、产活仔数等繁殖性状进行了相关分析。在所获得的基因VEGFA的扩增片段中共检测到17个多态位点,其中有4个位点可进行PCR-RFLP检测,分别为BstH2I-RFLP,PspEI-RFLP,Eco32I-RFLP和BcnI-RFLP,而在HIF1A和EPAS1扩增片段中未获得可进行PCR-RFLP检测的多态位点。在2个实验猪群中对VEGFA基因的4个多态位点进行基因型及等位基因频率分析,结果表明:VEGFA基因的BstH2I、Eco32I、PspEI 3个多态位点在梅山猪群体中A等位基因占优势,BcnI多态位点在梅山猪群体中B等位基因占优势,而在法系大白猪群体中VEGFA基因的BstH2I、Eco32I、PspEI和BcnI 4个多态位点的相关基因型和等位基因分布极不均衡。BstH2I和PspEI多态位点相关的A等位基因频率在法系大白猪群体中为0,而Eco32I和BcnI多态位点相关的A、B等位基因频率在法系大白猪群体中不到1%。单倍体型推断结果表明VEGFA基因4个多态位点在梅山猪群体中共存在10种单倍体型,而在法系大白猪群体中只存在2种单倍体型BBBA和BBAB,且只有一个个体的单倍体型是BBAB。通过性状关联分析,发现梅山猪群体中VEGFA基因单倍体型BBBA对初产总仔数影响显著(P<0.05);单倍体型BABA对经产总仔数和经产活仔数影响显著(P<0.05);单倍体型BBAA对初生窝重影响显著(P<0.05)。使用辐射杂种克隆板将基因VEGFA定位于SSC7q11-12;基因HIF1A定位于SSC1;基因EPAS1定位于SSC3q11-14。而所获得的基因HIF1A和EPAS1的扩增片段无PCR-RFLP可识别的SNP位点。研究结果表明猪VEGFA基因具有成为影响猪繁殖性状分子遗传标记的潜力。
张向喆杨仑陈强谭桂芳陈剑严国祥潘玉春
关键词:VEGFA基因多态性繁殖性状
Associations between gene polymorphisms in two crucial metabolic pathways and growth traits in pigs被引量:3
2012年
Propanoate metabolism and fatty acid metabolism are crucial metabolic pathways in vivo that have been studied extensively and have shown a significant influence on the growth and diseases of animals.In order to identify the essential genes significantly associated with porcine growth traits at the pathway level,we selected 14 candidate genes with 58 SNPs,including 24 tag SNPs and 34 predicted SNPs,in the two essential pathways to test using the SNaPshot mini-sequencing method.Association analysis was performed using both static and dynamic phenotypic records.The results showed that four SNPs,respectively in SUCLA2,SUCLG2,ACADS,and ALDH1B1,were significantly associated with growth in pigs.In addition,an exciting finding was that the change of transcription factor binding site that resulted from alteration of the bases in SUCLG2 brought out a transcription factor binding site for POU1F1a,which is the product of a notable marker gene for growth of animals.
YANG FanWANG QiongPingWANG MingHuiHE KanPAN YuChun
关键词:生长性状代谢途径转录因子结合位点SNPS
子宫内膜异位症芯片的元分析研究
2009年
为了更加系统地研究子宫内膜异位症的发病机制,本文利用在基因表达谱数据库(GEO)中寻找到的与子宫内膜异位症相关的两套芯片数据,运用非参数的基于不同数据源的有序基因列表秩积算法及R程序包进行了元分析,并将其与单个芯片t检验分析结果进行了比较,发现与子宫内膜异位症存在显著性相关的两个重要基因THBS1和THBS2及其参与的细胞外基质受体互作通路。
何侃赵洪波潘玉春
关键词:子宫内膜异位症芯片通路
奶牛能量负平衡的基因集富集分析
引言奶牛繁殖力低的最常见原因之一,是能量供给不能满足它的需求或是能量处于负平衡状态(NEB)。长时间营养不良或者急性限饲,容易导致能量负平衡的发生。在泌乳早期,大多数奶牛由于不能摄入足够的能量而总是处于
赵洪波王起山潘玉春
关键词:奶牛能量负平衡
文献传递
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