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四川省教育厅科学研究项目(07ZA120)

作品数:9 被引量:21H指数:3
相关作者:侯万儒侯怡铃张田郝彦哲杜玉杰更多>>
相关机构:西华师范大学广东省湛江教育学院教育部更多>>
发文基金:四川省教育厅科学研究项目国家自然科学基金四川省应用基础研究计划项目更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 7篇生物学

主题

  • 6篇大熊猫
  • 6篇克隆
  • 5篇克隆及序列分...
  • 4篇亚基
  • 4篇核糖
  • 4篇核糖体
  • 4篇PCR
  • 3篇蛋白
  • 3篇亚基基因
  • 3篇基因
  • 3篇核糖体蛋白
  • 2篇RT-PCR
  • 1篇蛋白亚基
  • 1篇四川黑熊
  • 1篇克隆与序列分...
  • 1篇基因CDNA
  • 1篇S11
  • 1篇CDNA
  • 1篇CDNA克隆
  • 1篇DNA序列

机构

  • 7篇西华师范大学
  • 2篇广东省湛江教...
  • 1篇教育部

作者

  • 7篇侯万儒
  • 6篇侯怡铃
  • 4篇张田
  • 3篇郝彦哲
  • 3篇杜玉杰
  • 3篇李俊
  • 2篇孙冰
  • 2篇苏秀兰
  • 1篇王婷
  • 1篇吴光富
  • 1篇宋嫣
  • 1篇伍春莲
  • 1篇丁祥

传媒

  • 2篇四川动物
  • 2篇西华师范大学...
  • 1篇第三军医大学...
  • 1篇重庆师范大学...
  • 1篇西南大学学报...

年份

  • 1篇2012
  • 1篇2011
  • 2篇2010
  • 3篇2009
9 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
大熊猫核糖体蛋白S11亚基基因(RPS11)cDNA的克隆及序列分析被引量:2
2010年
RPS11是核糖体小亚基40S的组成部分,由RPS11基因所编码,属于核糖体蛋白S17p家族,主要存在于真核生物中。为了解大熊猫核糖体蛋白亚基RPS11基因的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPS11基因的异同,本研究根据已报道的部分哺乳动物核糖体蛋白S11亚基基因(RPS11)的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术从大熊猫的肌肉组织总RNA中成功克隆了核糖体蛋白亚基RPS11基因,并进行了测序和序列分析。结果表明:大熊猫RPS11亚基基因的开放阅读框(ORF)长为477bp,编码158个氨基酸的蛋白质,该蛋白的相对分子量为18.4275kDa,pI为10.96。拓扑预测显示该蛋白含有14个功能位点:即2个N-糖基化位点,6个蛋白激酶C磷酸化位点,4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点和1个核糖体蛋白S17 signature位点。进一步分析发现,大熊猫RPS11基因与已报道的部分哺乳动物的表达序列及其编码的氨基酸序列都具有很高的相似性。本研究结果为丰富和完善哺乳动物RPS11基因资源库提供了基础资料。
孙冰侯怡铃李俊苏秀兰吴光富宋嫣张田侯万儒
关键词:大熊猫
大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)RPS24基因cDNA克隆及序列分析被引量:3
2009年
本研究运用RT-PCR技术,首次从大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)的肌肉组织总RNA中成功克隆了RPS24(Ribosomal Protein S24)基因的表达序列,并对其进行了测序及初步分析.结果表明:大熊猫RPS24基因的表达序列全长为431bp,开放阅读框(ORF)为399bp,编码132个氨基酸的蛋白质,该蛋白的分子量为15.3251kD,pI为10.92,含有7种类型共14个功能位点:即1个N-糖基化位点、2个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点、6个蛋白激酶C磷酸化位点、1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、3个N-酰基化位点、1个酰胺化位点及1个RPS24e sig-nature.进一步分析发现,大熊猫RPS24基因与已报道的人、牛、苏门答腊猩猩、褐家鼠和小家鼠5个哺乳动物物种的表达序列及其编码的氨基酸序列具有很高的相似性:编码序列同源性分别为94.1%、92.4%、94.7%、89.9%和90.4%;与人RPS24蛋白的氨基酸序列同源性为98.48%,其余均为99.24%.
杜玉杰侯怡铃郝彦哲张田侯万儒
关键词:大熊猫克隆
大熊猫核糖体蛋白S17亚基基因(rps17)的克隆及序列分析被引量:2
2011年
RPS17蛋白是核糖体40S亚基的组成部分,由rps17基因编码.为了解大熊猫核糖体蛋白亚基rps17基因的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基rps17基因的异同,分别运用RT-PCR和PCR技术,从大熊猫肌肉组织的mRNA中成功克隆了核糖体蛋白亚基S17基因的cDNA序列以及从总DNA中成功克隆了S17基因的结构基因序列.序列分析发现,大熊猫核糖体蛋白亚基S17基因的表达序列长为457bp,开放阅读框(ORF)为408bp,编码135个氨基酸的蛋白质.结构基因序列长2 368bp,含有4个外显子和3个内含子.拓扑预测显示,核糖体蛋白亚基RPS17的相对分子质量为15.52×103,PI为10.26,含有5个类型的功能位点,即:5个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶II磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点,1个N-豆蔻酰化位点及1个核糖体蛋白S17Esignature位点.进一步分析发现,该基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的部分哺乳动物有很高的相似性,其蛋白质的高级结构除褐家鼠外与其它物种也具有一致性.对大熊猫rps17基因及其表达的蛋白质结构的比较研究,旨在丰富和完善哺乳动物rps17的基因资料库.
侯怡铃李俊侯万儒
关键词:大熊猫RT-PCR克隆
大熊猫核糖体蛋白亚基RPS7基因的克隆及序列分析被引量:4
2009年
目的了解大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)核糖体蛋白亚基RPS7基因的结构及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPS7基因的同源性。方法运用RT-PCR技术,从大熊猫的肌肉组织总RNA中对核糖体蛋白亚基RPS7基因的表达序列进行克隆、测序;采用Gnescan软件,对所克隆的基因序列进行氨基酸序列推定;采用ORF finder软件进行DNA序列的开放阅读框(ORF)查找;采用DNAMAN Version6,对基因序列和氨基酸序列进行同源性比较;采用Ex2PASy Proteomics Server软件进行蛋白质功能位点和生化特性预测分析。结果大熊猫RPS7基因的表达序列全长为589bp,ORF为585bp,编码194个氨基酸,该蛋白的相对分子质量为22.12685×103,等电点为10.09,含有1个N-糖基化位点,2个依赖于cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位点,4个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,2个十四(烷)酰化位点,2个酰胺化位点及1个RPS7蛋白signature位点。进一步分析结果显示,大熊猫RPS7基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的部分哺乳动物具有很高的相似性。结论运用分子生物学原理与相应的技术手段,成功地扩增出大熊猫RPS7基因的表达序列,并对其编码的蛋白进行了初步分析,丰富和完善了哺乳动物RPS7基因资料库。
侯怡铃伍春莲侯万儒郝彦哲张田
关键词:大熊猫克隆
四川黑熊RPS16亚基基因的克隆与序列分析被引量:3
2012年
根据已报道的部分哺乳动物RPS16基因的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术,从四川黑熊的肌肉组织总RNA中对核糖体蛋白亚基RPS16基因的表达序列进行克隆、测序和分析.结果表明:四川黑熊RPS16基因的表达序列全长为481bp,开放阅读框(ORF)为441bp,编码146个氨基酸,相对分子质量为16.4KDa,pI为10.81.拓扑预测显示含有6个类型的功能位点:1个依赖cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位点,3个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶II磷酸化位点,2个N-糖基化位点,1个乙酰化位点及1个核糖体蛋白S9信号位点.进一步分析发现,四川黑熊RPS16基因与已报道的大熊猫、牛、野猪、人、小家鼠和褐家鼠等6个哺乳动物物种的表达序列及其编码的氨基酸序列有很高的相似性,说明RPS16基因具有高度的遗传稳定性和功能一致性.
王婷侯怡铃丁祥孙冰苏秀兰李俊侯万儒
关键词:克隆
大熊猫核糖体蛋白L34基因cDNA克隆与蛋白特性被引量:2
2010年
为进一步研究RPL34的结构基因,也为更深入开展大熊猫分子生物学研究积累科学资料,本研究采用RT-PCR方法,首次成功克隆了大熊猫的核糖体蛋白L34基因的cDNA序列,对克隆序列进行了测序及初步分析,并利用RPL34蛋白构建系统树。结果表明:大熊猫RPL34基因的表达序列全长为379 bp,ORF为354 bp,编码117个氨基酸的蛋白质,该蛋白分子量为13.292 9 kD,等电点(pI)为11.48,含有5种类型共11个功能位点。进一步分析发现,该基因与已报道的人、牛、褐家鼠、小家鼠、非洲爪蟾和斑马鱼等物种的编码序列及其编码的氨基酸序列同源性很高,蛋白质分子量、pI非常接近,功能位点基本相同,说明核糖体蛋白L34基因及其编码蛋白在进化过程中非常保守;进化树分类结果与传统分类一致,表明L34蛋白能很好的反映物种间的进化关系。
杜玉杰侯怡铃侯万儒
关键词:大熊猫克隆
大熊猫LSM3c DNA序列的克隆及序列分析被引量:5
2009年
运用RT-PCR技术首次从大熊猫Ailuropoda melanoleuca的肌肉组织总RNA中成功克隆了LSM3的表达序列,并对其进行了测序及初步分析。结果表明:大熊猫LSM3基因的表达序列含有一个完整的开放阅读框,长度为306bp,编码102个氨基酸的蛋白质,分子量为11.845kDa,pI为4.58,含有1个蛋白激酶C磷酸化位点、4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个酪氨酸激酶磷酸化位点和1个细胞附着序列。进一步分析发现,大熊猫LSM3基因的表达序列与已报道的部分哺乳动物具有很高的相似性,其编码的氨基酸序列与其他哺乳动物完全一致。
郝彦哲侯万儒杜玉杰张田
关键词:大熊猫RT-PCR克隆
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