哈尔滨市科技攻关计划项目(2009AA6AN029)
- 作品数：2 被引量：109H指数：2
- 相关作者：张鑫陈建飞冯力石达时洪艳更多>>
- 相关机构：东北农业大学中国农业科学院哈尔滨兽医研究所更多>>
- 发文基金：哈尔滨市科技攻关计划项目国家科技部农业科技成果转化资金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 2011年猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析被引量：95
- 2012年
- 为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本研究设计合成2对扩增S1基因的引物,利用套式RT-PCR方法,对2011年分离的17个PEDV S1基因进行扩增、克隆和序列测定;并将其进行比对和遗传演化分析。结果表明:17个PEDV S1基因序列与参考病毒株S1基因核苷酸序列同源性为90.54%～99.96%,与经典病毒株CV777相比,其中有6个S1基因在453 bp～454 bp处存在3个核苷酸的缺失;一个在453 bp～454 bp处缺失6个核苷酸;其它10个S1基因在173 bp～186 bp之间存在12个核苷酸的插入,413 bp～417 bp之间有3个核苷酸的插入,467 bp～468 bp处缺失6个核苷酸,插入和缺失位点与韩国病毒株KNU-0901、KNU-0905、KNU-0801相似。S1基因系统进化树分析表明,PEDV S1基因分为3群,其中7个S1基因属于PEDVⅠ群,另外10个属于PEDVⅢ群。
- 刘孝珍陈建飞时洪艳张鑫石达刘胜旺冯力
- 关键词：猪流行性腹泻病毒S1基因
- 2011年～2012年G9型猪轮状病毒流行病学调查及VP7基因遗传进化分析被引量：14
- 2013年
- 为分析G9型猪轮状病毒(RV)的遗传变异情况,本研究根据GenBank中VP7序列设计合成一对扩增VP7基因的引物,采用PCR方法对2011年～2012年分离的部分RV VP7基因进行扩增、克隆和序列测定,并进行比对和遗传进化分析。结果表明:531份病料中RV阳性份数为39,阳性率为7.34%;而在检测的121个猪场中,共有23个猪场显示阳性,猪场阳性率为19%。VP7基因全长1 062 bp,含有一个982 bp的开放阅读框,编码326个氨基酸。与参考病毒株VP7全长基因核苷酸比较,同源性为91.5%～99.3%。在31 nt、56 nt、75 nt、82 nt、191 nt、215 nt等位置均存在点突变,无插入和缺失。核苷酸系统发育进化树表明:黑龙江省哈尔滨市、桦南、绥化,辽宁省大连市、内蒙古自治区采集病料样品的基因间差异较小,与采集自中国广西、浙江、贵州、北京的病料样品基因相比差异性较大,这表明VP7基因存在地域差异。
- 王璐时洪艳陈建飞张鑫史楠石达刘随新张莎冯力
- 关键词：轮状病毒VP7基因
