云南省教育厅科学研究基金(03Z442C)
- 作品数：4 被引量：15H指数：3
- 相关作者：黄永坤戚勤周丽芳李海林文革生更多>>
- 相关机构：昆明医学院第一附属医院中国医学科学院北京协和医学院更多>>
- 发文基金：云南省教育厅科学研究基金云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 腹泻患儿轮状病毒VP7基因分型与临床的关系被引量：3
- 2005年
- 目的研究昆明地区2003年9～12月婴幼儿轮状病毒腹泻分子流行病学及临床特点.方法采用逆转录-聚合酶链法(RT-PCR)扩增婴幼儿腹泻大便样本中编码轮状病毒VP7蛋白的全基因片断,用巢式-聚合酶链反应(nested PCR)对扩增得到的VP7基因进行分型.结果 1.昆明地区2003年秋冬季50份标本能定型者32份(占64%).其中G3型占93.75%(30/32);混合型占6.25%(2/32),均为G1+G3型.本次分型中未见G2及G4型.2.2003年9～12月轮状病毒腹泻临床特点为病程短,脱水程度轻,腹泻次数少,电解质紊乱及酸中毒少见.结论1.2003年9～12月昆明地区轮状病毒流行株以G3型为主,与以往比较出现了流行株的转变.2.G1型感染的临床表现较G3型重.
- 黄永坤戚勤侯宗柳李海林文革生庞伟周丽芳
- 关键词：轮状病毒属
- 2007年至2008年昆明地区腹泻患儿轮状病毒非结构蛋白基因特征的分析被引量：1
- 2012年
- 目的探讨轮状病毒非结构蛋白(NSP4)基因的特征及变异情况.方法在2007年和2008年昆明医学院第一附属医院儿科住院的96例秋冬季腹泻患儿中,随机选取轮状病毒阳性的12例(其中2007年6例,2008年6例)患儿粪便标本,采用RT-PCR扩增NSP4基因,并进行测序,测序结果用DNAassist软件对核苷酸序列进行翻译,并用Clustal-mp软件与Genbank Datebase中的4株人RV(Wa、KUN、AU-1、Hoch)i、3株动物RV(EW、OSU、SAl)l和中国北京、上海、广州的流行株的NSP4序列进行分析比较.结果 (1)选取的2007年6份和2008年6份样本均可以扩增出NSP4的全长片段,测序表明:2007年6份样本中有5株属于Wa株,1株属于KUN株;2008年6份样本中也有5株属于Wa株,1株属于KUN株.10株Wa株与来自GenBank Database的4株人RV(Wa、KUN、AU-1、Hoch)i和3株动物RV(EW、OSU、SAl)l同源性分别为96.3%、85.3%、84.7%、95.1%和57.7%、92%、82.8%,与中国北京、上海、广州的流行株同源性均在95%以上;2株KUN株与以上来自GenBank Database的标准株的同源性分别为85.3%、98.2%、82.8%、85.9%、60.1%、85.3%、94.3%,和其他地区流行株的同源性为85%左右;(2)以Wa株为参考,10株Wa株的NSP4基因变异发生在第34位氨基酸,第76位氨基酸,第141位氨基酸,第145位氨基酸,第161位氨基酸和第169位氨基酸;以KUN株为参考,2株KUN株的NSP4基因变异仅在第87位氨基酸和第140位氨基酸.结论 2007年和2008年昆明地区流行株NSP4基因为Wa组和KUN组,以Wa组为主.
- 刘梅杨娟赵亚玲侯宗柳戚勤周丽芳黄永坤
- 关键词：轮状病毒NSP4基因
- 轮状病毒腹泻患儿NSP4基因变异与临床关系被引量：7
- 2005年
- 目的研究腹泻患儿的轮状病毒( RV)流行株非结构蛋白 4( NSP4)的基因变异与临床的关系.方 法对昆明地区 2002年和 2003年流行期不同程度腹泻患儿中分离出的 22株轮状病毒流行株的 NSP4基因进行 RT-PCR扩增,并进行 cDNA序列分析,与来自 GenBank Database的 4株人 RV( Wa、 KUN、 AU-1、 Hochi)和 3株动物 RV( EW、 OSU、 SAll)以及我国不同地区 RV流行株 NSP4的基因变异情况进行比较.结果氨基酸同源性表明昆明地区轮状病毒流行株间的同源性高达 98.9%～ 99.4%, 22株流行株全都属于 Wa组.氨基酸进化树提示在 Wa组内又包括 3个亚组.NSP4基因变异与轮状病毒腹泻临床症状严重程度不相关( P>0.05).结论 2002年和 2003年昆明地区轮状病毒流行株皆属 Wa组,且其氨基酸序列极为保守; NSP4基因变异与轮状病毒腹泻临床症状严重程度不相关,但与流行发病的关系需继续研究.
- 戚勤侯宗柳李海林文革生庞伟周丽芳黄永坤
- 关键词：轮状病毒基因
- 昆明地区22株人轮状病毒VP7及NSP4基因分析被引量：5
- 2005年
- 目的 研究昆明地区轮状病毒(RV)不同VP7血清型及NSP4基因变异与腹泻的流行及症状严重程度的关系。方法 对2002年和2003年分离于昆明地区的RV，用PCR分型法对四种主要的VP7血清型进行分型，并对从150份RV腹泻标本VP7血清型为G1、G3、G4型RV株中挑出的14份一般腹泻株和8份重症腹泻株的NSP4基因序列进行了分析，与来自GenBank Database的4株人RV(Wa、NUN、AU-1、Hochi)和3株动物RV(EW、OSU、SA11)以及中国不同地区流行株NSP4的基因变异情况进行了比较。结果 2002年昆明地区RV流行株以G1型为主，2003年RV腹泻株以G3型为主；昆明地区RV流行株间的氨基酸同源性高达98.9%～99.4%，22株流行株全都属于Wa组；NSP4变异与地域及VP7血清型无关；NSP4基因变异与RV腹泻临床症状严重程度不相关(P>0.05)。结论 不同年份相同季节不同地域流行的RV VP7血清型变异较大，而NSP4基因的相对保守性及其免疫原性使其有可能成为发展疫苗的候选基因。
- 黄永坤戚勤侯宗柳李海林文革生庞伟周丽芳
- 关键词：轮状病毒VP7NSP4基因型
