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国家高技术研究发展计划(2006AA02Z341)

作品数:3 被引量:3H指数:1
相关作者:郑树王连聪张苏展徐文鸿余捷凯更多>>
相关机构:浙江大学医学院附属第二医院西安交通大学军事医学科学院更多>>
发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:医药卫生理学农业科学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生
  • 1篇农业科学
  • 1篇理学

主题

  • 2篇血清
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质
  • 1篇血清蛋白
  • 1篇血清蛋白质
  • 1篇阳离子
  • 1篇阳离子交换
  • 1篇支持向量
  • 1篇支持向量机
  • 1篇质谱
  • 1篇色谱
  • 1篇色谱法
  • 1篇色谱法分离
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇术前
  • 1篇强阳离子交换
  • 1篇清蛋白
  • 1篇肿瘤
  • 1篇肽段

机构

  • 1篇军事医学科学...
  • 1篇西安交通大学
  • 1篇浙江大学医学...

作者

  • 1篇胡跃
  • 1篇蔡耘
  • 1篇钱小红
  • 1篇陈益定
  • 1篇田中民
  • 1篇应万涛
  • 1篇余捷凯
  • 1篇徐文鸿
  • 1篇张苏展
  • 1篇王连聪
  • 1篇郑兆彬
  • 1篇郑树

传媒

  • 1篇细胞生物学杂...
  • 1篇色谱
  • 1篇中国科技成果

年份

  • 1篇2010
  • 1篇2008
  • 1篇2007
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
离线pH梯度-强阳离子交换色谱法分离肽段混合物被引量:1
2007年
复杂肽段混合物的有效分离是高覆盖率地鉴定蛋白质混合物的前提。Shotgun蛋白质组学研究通常采用二维液相色谱(强阳离子交换色谱-反相色谱)分离后接串联质谱检测的方法。但由于离子交换色谱体系中含有高浓度的盐,使得在线分析的难度较大;而在离线分析时,也常因需要对高盐组分进行脱盐处理而易引起样品损失。因此,该文尝试用pH梯度替代盐梯度,实现pH梯度-强阳离子交换色谱方法应用于复杂肽段混合物的分离。通过对缓冲体系pH值的计算,优化了乙酸-乙酸铵体系线性pH梯度配合盐梯度的离子交换色谱方法,以及柠檬酸-氨水体系线性pH梯度的离子交换色谱方法。将这两种方法应用于牛血清白蛋白酶切产物的分离取得了与常规强阳离子交换色谱相似的分离效果。乙酸-乙酸铵体系采用的是低浓度的可挥发性铵盐,采用真空冻干的方法可以有效除盐,基质辅助激光解吸质谱靶上自然挥发也可以达到较好的脱盐效果,简化了常规方法繁琐费时的脱盐步骤及避免了由此造成的样品损失。柠檬酸-氨水体系采用pH梯度洗脱替代盐梯度洗脱,大大降低了体系中的盐浓度。这两种方法在复杂体系蛋白质组研究的样本预分离中具有较好的应用前景。
郑兆彬应万涛蔡耘田中民钱小红
关键词:离子交换色谱
基于支持向量机的大肠黏液腺癌术前血清蛋白质标志物检测及分析被引量:2
2008年
应用表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术和CM10蛋白质芯片从大肠黏液腺癌和非黏液腺癌患者中成功地筛选出了大肠黏液腺癌患者血清特异性相关蛋白。应用美国CipherGen公司CM10蛋白质芯片和PBSⅡ型蛋白质芯片阅读仪检测53例大肠癌患者(黏液腺癌12例,非黏液腺癌41例)患者血清蛋白质指纹图谱。采用ZUCI-Protein Chip Data Analyze System分析软件包进行分析,离散小波去噪音,结合支持向量机筛选肿瘤标志物,建立大肠黏液腺癌的术前诊断模型。12例大肠黏液腺癌患者与41例大肠非黏液腺癌患者的血清蛋白质有12个蛋白质峰强度有显著差异。其中质荷比为24297和23434m/z处的蛋白质峰强度统计学P值分别为0.0067和0.0092,差异有极显著统计学意义。支持向量机筛选出24297、3322、3822和4353m/z蛋白质峰作为生物标志物进行检测和预测准确率,其中12例大肠黏液腺癌患者中有10例患者被正确识别,41例大肠癌非黏液腺癌患者中有39例被正确识别,准确率为92.45%(49/53)。该方法可以较好地应用于区别大肠黏液腺癌和非黏液腺癌,进行术前病理鉴别,指导进行大肠黏液腺癌的手术和综合治疗。
徐文鸿陈益定胡跃余捷凯王连聪郑树张苏展
关键词:生物信息学
常见消化道肿瘤血清多肽质谱诊断技术及其分析软件的应用性研究
2010年
1项目简介 本课题由浙江大学负责组织实施,中国医学科学院肿瘤研究所、北京市肿瘤研究所、军事医学科学院等3家单位共同合作完成。
关键词:消化道肿瘤质谱多肽血清
共1页<1>
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