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国家高技术研究发展计划(2006AA02Z324)
作品数:
2
被引量:3
H指数:1
相关作者:
李瑶
付旭平
杨广源
黄燕
曹明
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相关机构:
复旦大学
上海市智能信息处理重点实验室
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发文基金:
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
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CDNA芯片
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ISOMAP
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作者
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付旭平
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李瑶
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杨广源
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一种基于非线性降维和Procrustes分析的基因选取方法
被引量:3
2009年
提出了一种新的基于非线性降维算法和统计形状比较的基因选取方法.该方法基于保持芯片数据结构的思想,消除了对于样本类信息的要求.在3组实际肿瘤芯片数据上的应用表明,新方法在维持数据结构和数据挖掘分析中都明显优于基于线性降维的选取方法.与其他成熟的基因选取方法在分类分析中的比较也证明了新方法的成功.
杨广源
付旭平
黄燕
李瑶
关键词:
基因芯片
非线性降维
ISOMAP
利用小样本表达谱数据构造前列腺癌基因网络
2010年
用25张前列腺癌芯片表达谱数据,基于基因间的表达相似性和基因的差异表达程度,筛选出287条基因,用模糊聚类的方法将其聚成65个类,用贝叶斯模型构造了一个大型的基因网络,并对这个网络的有效性进行了验证.结果表明,基于本文提出的策略,利用小样本量的表达谱数据构造大型基因网络是可行的.
付旭平
曹明
莫文娟
姜梅
李瑶
关键词:
基因网络
CDNA芯片
模糊聚类
贝叶斯模型
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