浙江省自然科学基金(Y205700)
- 作品数：3 被引量：7H指数：2
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- 汉坦病毒浙江分离株ZT71株的全基因核苷酸序列测定及分析被引量：1
- 2008年
- 目的为了获得浙江省汉坦病毒基因组更为详尽的资料，研究汉坦病毒的进化状况及变异程度，为疫苗病毒株的选择使用提供科学依据。方法设计特异性引物，RT—PCR分段扩增ZT71株全长L、M和S片段，PCR产物纯化后克隆于T载体并进行序列测定。然后进行遗传进化分析。结果汉坦病毒ZT71株L、M及S基因分别由6530、3651和1753个核苷酸组成，分别编码2151、1133和429个氨基酸。基因比较分析表明，ZT71株与SEO型汉坦病毒比较其L片段核苷酸同源性为95．5％～99．7％，氨基酸同源性为99．0％～99．3％；M片段核苷酸同源性为84．1％～99．6％，氨基酸同源性为95．3％～99．2％；S片段核苷酸同源性为88．7％～99．5％，氨基酸同源性为96．5％～99．1％；而与其他汉坦病毒同源性则较低。结论测定了ZT71株的全基因核苷酸序列，其L、M和S片段具有和其他汉坦病毒L、M、S片段相似的核苷酸一级结构，但与SEO型更为接近，属于SEO型病毒。
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- 关键词：汉坦病毒
- 汉坦病毒东方田鼠分离株ZT10的M基因序列的特性分析被引量：5
- 2006年
- 分析东方田鼠分离汉坦病毒ZT10株M基因分子特征。提取汉坦病毒ZT10株感染细胞的总RNA,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增ZT10株M片段全基因,克隆于T载体并测序,对其进行序列分析。结果显示汉坦病毒ZT10株的基因组M片段长度为3651个核苷酸,编码1133个氨基酸。序列分析表明其为Seoul型汉坦病毒。与八株Seoul型汉坦病毒的M片段同源性为84.0%～96.3%,而与HTN型汉坦病毒的同源性则较低,与从田鼠分离的汉坦病毒(ProspectHillvirus,Tulavirus,Khabarovskvirus,Islavistavirus)核苷酸同源性仅为57.5%～60.9%,且与浙江省Seoul型分离株Guo3同源性较低,表明浙江省可能存在着另一Seoul亚型的汉坦病毒。
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- 关键词：汉坦病毒M基因
- 汉坦病毒Z5株M和S片段全基因序列测定及分析被引量：2
- 2010年
- 目的测定汉坦病毒Z5株M、S片段的全长序列,了解其分子结构特征,并分析Z5与其他汉坦病毒株的遗传学差异。方法设计引物,用RT-PCR技术扩增Z5株全长M与S片段。PCR产物纯化后克隆入T载体并测定序列及分析。结果Z5株M片段的全基因序列含有3 616个核苷酸,编码1 135个氨基酸。S全基因序列含有1 700个核苷酸,编码429个氨基酸。经核苷酸与氨基酸同源性分析,Z5株应属于汉坦病毒的汉滩型(HTN型)毒株,与Z10株同属一个亚型。结论Z5株病毒和其他汉滩病毒病毒在核苷酸序列上有差异,但在氨基酸水平上的同源性仍较高。
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- 关键词：汉坦病毒
