中央高校基本科研业务费专项资金(SWJTU11CX113)
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
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- 系统比较氨基酸描述子在多肽定量构效关系中的应用被引量：2
- 2014年
- 氨基酸描述子是采用多元统计方法从大量氨基酸性质参数中提取得到的少数关键信息成分,目前已被广泛应用于多肽生物活性预测及蛋白质功能判别等领域。鉴于近年来氨基酸描述子种类的极速扩增,收集了目前国内外发表的27种氨基酸描述子,并将其用于8组经典多肽集的结构表征及定量构效关系研究。通过系统比较这些描述子对同一肽集与不同肽集的统计建模结果,我们认为物理化学描述子的建模效果优于拓扑描述子,拓扑描述子的建模效果优于三维结构描述子,且已有诸多氨基酸描述子已经达到性能限度,如未考虑肽链内部各氨基酸残基的交互影响,肽配基与相应靶标蛋白的相互结合,因此不再建议按照传统思路进一步提出新型描述子种类。
- 许航田菲菲吴坚
- 关键词：定量构效关系
- 小分子凝血酶抑制剂的分子设计与计算机模拟被引量：2
- 2013年
- 目的设计5种小分子并研究其与凝血酶的对接,以研究新型凝血酶抑制剂。方法根据PPACK结构设计5种小分子凝血酶抑制剂,并通过autodock 4.2和MVD2010.4.0(molegro virtual docker)模拟这5种分子与凝血酶的对接。最后合成这5种分子,并测定凝血酶抑制剂的活性。结果 autodock对接数据显示分子1、2、5具有较高活性。MVD对接数据显示分子1、2、3具有较高活性。实验测定结果显示分子1、2、3、5均有一定活性。结论实验结果证明计算机模拟数据有一定的参考价值。
- 翁羽张莉娇陆群吴坚
- 关键词：分子对接凝血酶抑制剂AUTODOCKMVD
