河南省科技攻关计划(132102110159)
- 作品数：4 被引量：44H指数：4
- 相关作者：赵雪丽吴志明闫若潜周兵强陈慧娟更多>>
- 相关机构：河南省动物疫病预防控制中心河南科技大学中国动物疫病预防控制中心更多>>
- 发文基金：河南省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 2012-2014年河南省猪伪狂犬病病毒gE基因和TK基因的遗传变异分析被引量：13
- 2016年
- 为了解河南地区猪伪狂犬病病毒(PRV)流行株的遗传变异情况,本研究对2012-2014年14株河南PRV分离株的2个主要毒力基因gE和TK进行扩增、克隆测序和遗传进化分析。结果显示:14株河南分离株的gE基因氨基酸同源性为95.7%~99.8%,与2012年之前国内分离的毒株同源性较低(96.6%~98.9%),并在多个部位存在碱基的插入与替换,与2012年之后中国流行的毒株的同源性较高(除XX1外同源性为98.7%~99.5%);14株TK基因的氨基酸同源性为98.1%~100.0%,与疫苗株Bartha株同源性为98.1%~99.4%,与2012年之后流行株的氨基酸同源性为98.4%~99.7%。进化树分析显示:PRV流行毒株gE基因和TK基因均可分为3个群,与国内分离的大多数毒株同处于基因1群。分析结果表明:14个分离株与ZJ-01株、TJ株亲缘关系较近,与Ea株、Min-A株、LA株次之,与Becker株、Kaplan株和P-Prv株亲缘关系较远。TK基因较为保守,gE基因存在很多点突变,提示可能是当前流行毒株毒力增强从而导致当前疫苗免疫保护力下降的主要原因。
- 李宁吴志明闫若潜赵雪丽王淑娟马震原周兵强刘毅张珂
- 关键词：猪伪狂犬病病毒GE基因TK基因遗传变异分析
- 2012-2014年河南省猪流行性腹泻病毒M基因和ORF3基因的遗传变异分析被引量：13
- 2014年
- 为了解河南省猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,对2012-2014年河南省不同猪场的150份腹泻样品进行了PEDV检测,并对其中14株PEDV的M基因和ORF3基因进行克隆测序和遗传进化分析。结果显示,这14个流行毒株M基因编码的氨基酸序列的同源性为96.9%~99.6%,与CV777经典毒株、韩国毒株及2010年以后国内流行的大多数毒株的氨基酸序列的同源性分别为97.4%~99.1%、96.9%~99.6%和97.8%~99.6%。这14个毒株中有2株ORF3基因与CV777疫苗株核苷酸序列的同源性为100%,存在49个核苷酸缺失;其余12株之间氨基酸序列的同源性为98.8%~100%,与CV777经典毒株、CV777疫苗株和韩国毒株氨基酸序列的同源性分别为95.1%~96.0%、90.2%~91.1%和97.3%~99.1%,与2010年以后国内流行的大多数毒株氨基酸序列的同源性为97.3%~99.6%。进化树分析显示,M基因可分为4个群,河南PEDV流行毒株主要以基因3群为主,其中CHHeN ZZ-2012毒株属于基因2群;ORF3基因分为3个群,CHHeN DF2-2012毒株和CHHeN ZZ-2012毒株分布于基因2群,其余12个毒株属于基因3群。结果表明,当前河南省主要流行的PEDV毒株M基因和ORF3基因与2010年以后国内流行的大多数毒株的同源性较高,与韩国毒株的亲缘关系较近;与经典毒株和疫苗株相比,其M基因和ORF3基因发生了变异,且临床出现或与疫苗株相似或与变异株相似的流行毒株。
- 周兵强吴志明闫若潜赵雪丽赵明军陈慧娟李宁
- 关键词：猪流行性腹泻病毒M基因ORF3基因遗传变异分析
- 2012年河南省猪流行性腹泻病毒分离株S1基因遗传变异分析被引量：16
- 2014年
- 为分析2012年河南省猪流行性腹泻病毒（PEDV）的遗传变异情况，本研究设计合成2对扩增s1基因的特异性引物，利用RT—PCR方法，对2012年分离的5株PEDV毒株的S1基因进行扩增、克隆和序列测定，并对其进行遗传进化分析。结果表明，5株PEDVs1基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98．3％～99．5％和97．1％～98．9％；与2011年以来国内登录的PEDV流行变异株核苷酸同源性为88．6％～98．0％，氨基酸同源性为85．3％～98．7％；与经典毒株cV777核苷酸同源性为88．7％～89．1％，氨基酸同源性为87．3％～88．4％。5株分离株s1基因均存在相同的插入和缺失，与2011年以来国内登录的流行变异毒株相比没有大的变异，但与参考毒株CV777相比，在163l66bp处有3个核苷酸插入；在l73l74bp之间有9个核苷酸插人；在405—406bp之间有3个核苷酸插入；在463464bp之间有3个核苷酸缺失，这些位点核苷酸的插入和缺失导致了其编码的氨基酸相应改变。s1基因系统进化树分析结果表明，5株分离株与2011年以来国内登录的流行变异毒株均属于基因Ⅲ群，与2011年国内登录的少部分PEDV基因Ⅰ群流行毒株的核苷酸同源性为88．6％～89．3％，氨基酸同源性为85．3％～86．9％，而经典毒株CV777所在分支群属于基因Ⅱ群。本试验结果表明，2011年以来，中国流行的PEDV毒株中同时有基因Ⅲ和Ⅰ群的存在，但以基因Ⅲ群毒株为主，其致病性和抗原性差异仍有待进一步研究。
- 陈慧娟吴志明闫若潜赵雪丽赵明军周兵强孔刚锐闫志玲程俊贞靳利粉
- 关键词：猪流行性腹泻病毒S1基因
- 鉴别猪伪狂犬病病毒gE基因缺失疫苗和野毒感染的二重PCR诊断方法的建立和应用被引量：4
- 2015年
- 为建立猪伪狂犬病病毒(PRV)gE基因缺失疫苗和野毒感染的快速鉴别诊断方法,本研究根据猪伪狂犬病野毒具有gD表面抗原基因和gE毒力基因,而基因缺失疫苗只有gD基因无gE基因的特性,针对gD/gE基因的5′端核苷酸序列自行设计引物,建立鉴别PRVgE基因缺失疫苗和野毒感染的二重PCR诊断方法,并进行了特异性、敏感性和重复性试验;利用所建立的检测方法对临床疑似样品进行了检测。结果表明,成功建立了鉴别PRV gE基因缺失疫苗和野毒感染的二重PCR诊断方法,该方法灵敏度高,最低检出限为100拷贝/μL;重复性好;特异性强,可特异性地扩增出PRV细胞毒中的gD和gE基因及gE基因缺失疫苗毒中的gD基因,但对PK-15细胞和猪流行性腹泻病毒等其他8种病原扩增不出任何条带;自835份临床疑似PRV感染病料中共检测出PRVgD和gE基因双阳性样品即野毒感染阳性样品267份,PRVgD基因单阳性样品28份,选取该方法检测出的26份PRV野毒感染阳性样品用于病原分离培养,两种方法的符合率为96.1%。说明本试验建立的二重PCR鉴别诊断方法快速、灵敏、特异,对于临床上疫苗毒和野毒感染的快速鉴别诊断具有重要意义。
- 赵雪丽闫若潜吴志明曹伟伟王淑娟谢彩华马震原周兵强王东方
- 关键词：猪伪狂犬病病毒二重PCR
