国家质检总局科技计划项目(2013IK299)
- 作品数：2 被引量：9H指数：1
- 相关作者：高芳銮沈建国史凤阳詹家绥常飞更多>>
- 相关机构：福建出入境检验检疫局福建农林大学更多>>
- 发文基金：国家质检总局科技计划项目福建省教育厅科技项目福建出入境检验检疫局科技计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 马铃薯Y病毒福建分离物P1基因的分子变异和结构特征被引量：9
- 2014年
- 为揭示马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)P1基因的分子变异及结构特征,并查明福建分离物P1基因的变异来源。文章设计一对简并引物从感染PVY的马铃薯病叶扩增、克隆获得福建分离物P1基因的cDNA全长序列,分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征,并采用贝叶斯法重建P1基因的系统发育树。结果显示,12个福建分离物均成功扩增出预期大小(约915 bp)的特异性片段,P1基因的核苷酸序列与已报道的PVY不同株系的核苷酸序列一致性为73%～99%;QK44、XT02、XT08、LH05分离物的309 nt位置均检测到一个强烈的重组信号。12个PVY分离物中,P1蛋白有85个变异的氨基酸位点,表明其高度变异;P1蛋白的第41～275位是一个高度保守的结构功能域,含有3个保守的活性位点(H192、D201、V235);系统发育分析显示,福建分离物形聚为3种不同的簇,其对应的卷曲结构(Coiled-coil domain)和空间结构也不相同,表明不同株系型的P1基因在系统发育关系上分化较大。该研究结果表明PVY P1基因在核苷酸序列、氨基酸序列以及空间结构具有高度变异性,但行使P1蛋白功能的活性位点所在的氨基酸(H192、D201和V235)均高度保守;福建分离物P1基因的变异源主要来自碱基突变和基因重组。
- 史凤阳高芳銮沈建国常飞詹家绥
- 关键词：马铃薯Y病毒P1基因
- 应用巢式RT-PCR检测水仙退化病毒1
- 2014年
- 水仙退化病毒(Narcissus degeneration virus,NDV)是水仙上发生较为严重的病毒之一。本文根据NDV已报道的外壳蛋白基因序列,设计特异性引物,以感病水仙的总RNA为模板,建立了快速检测NDV的巢式RT-PCR方法。结果表明,巢式RT-PCR具有良好的特异性和灵敏度,能够从感染NDV的水仙样品上扩增出与预期大小相符的特异性目的条带,同时与其他病毒无交叉反应;灵敏度测定结果表示,巢式RT-PCR灵敏度较高,是普通RT-PCR的104倍,当RNA稀释到109倍时仍能被检测到。本文建立的巢式RT-PCR为水仙上NDV的快速检测提供了技术参考依据。
- 金晶蔡伟赵爽邹文超高芳銮沈建国
- 关键词：特异性灵敏度
