中央高校基本科研业务费专项资金(DUT11SM02)
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
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- 巴曲酶的线性和构象型B细胞抗原表位的预测被引量：1
- 2013年
- 目的：预测巴曲酶的B细胞线性表位和构象型表位,本项目的预期成果可为该药物的安全化应用提供新思路。方法：基于巴曲酶的蛋白质序列,采用DNAStar软件和ABCpred、BCPREDS、BcePred和BepiPred 1.0服务器预测巴曲酶的线性表位。以蝮蛇毒蛋白C激活剂蛋白的晶体结构为模板,利用MODELLER9.10软件中的Pythonwin程序进行该酶的同源模建,并利用PROCHECK、ERRAT及PROSA程序进行合理化评价。根据巴曲酶的模建三维结构并结合DiscoTope和cons PPISP网络数据库预测构象型抗原表位。结果：得到肽端AA3~9、19~31、57~82、93~101、106~114、127~142、171~183、196~208、223~230区域为巴曲酶的B细胞线性表位优势区域。然后得到蛋白的N端41~48、57~71、76~82、93~100、109~115、127~133、146~152、194~203区段为B细胞构象型表位区域。结论：这些B细胞抗原表位可为降低巴曲酶的免疫原性提供实验依据。
- 贾秋磊尹茂鲁陈磊陈琦杨青姜秀萍
- 关键词：巴曲酶免疫原性同源模建
- 白眉蝮蛇降纤酶的同源模建及B细胞抗原表位预测被引量：2
- 2013年
- 白眉蝮蛇降纤酶是我国在临床上用来治疗血栓栓塞性疾病的国家基本药物。但该酶来源于蛇毒,是异源蛋白,且是大分子蛋白质,不可避免的存在免疫原性问题。另外该蛋白药物在我国使用规模很大,因此由免疫原性导致的安全性问题不容忽视。首先通过DNAStar软件和ABCpred、BCPREDS等服务器预测得到肽端AA27~35、44~50、66~72、79~98、101~109、117~127、134~142、151~164、179~188、194~206、221~233、247~260区域为白眉蝮蛇降纤酶的B细胞线性表位优势区域。然后以蝮蛇毒蛋白C激活剂蛋白的晶体结构为模板,利用MODELLER 9.10软件中的Pythonwin程序进行白眉蝮蛇降纤酶的同源模建,并利用PROCHECK、ERRAT及PROSA程序进行同源模建的合理化评价。根据白眉蝮蛇降纤酶的模建三维结构并结合DiscoTope和cons PPISP网络数据库预测B细胞构象型抗原表位。得到蛋白的N端45~51、81~90、95~106、134~141、153~159、177~182、225~232、251~257区段为白眉蝮蛇降纤酶的B细胞构象型表位区域。本项目的预期成果将为降纤酶药物的安全化应用提供新思路,为蛋白质药物免疫原性机制研究提供技术基础。
- 贾秋磊王林陈鹏杨青姜秀萍
- 关键词：降纤酶同源模建
