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放线菌16S rDNA片段扩增方法的优化被引量：5: 2014年; 目的通过对放线菌PCR扩增方法的综合改进,找到某些用常规手段难扩增的放线菌16SrDNA的最佳PCR扩增条件。方法 (1)提取放线菌基因组DNA并对其进行PCR扩增以找到最适退火温度;(2)改变PCR反应体系中模板DNA和Mg2+的浓度;(3)在反应体系中加入适量的二甲基亚砜。结果在25μL的PCR反应体系中,模板DNA浓度为10×、加入0.5μL的Mg2+和5%的二甲基亚枫、退火温度为59℃时对放线菌16SrDNA扩增效果最为理想。结论本实验研究出一种扩增放线菌16SrDNA的优化条件,为今后大批量的放线菌的分子生物学研究提供了更加高效、方便、快捷、经济的实验方法。; 金方陈玉如王颜颜康颖倩; 关键词：聚合酶链式反应 RDNA 放线菌

新生隐球菌毒力差异基因型菌株间部分毒力相关基因分析被引量：1: 2014年; 目的：了解新生隐球菌格鲁比变种（ Cryptococcus neoformans var． grubii）两组毒力差异明显的多位点微卫星型（ multilocus microsatellite typing ， MLMT ）菌株间的差异基因，探讨导致新生隐球菌格鲁比变种间毒力差异的相关基因及这些基因的功能。方法根据已有基因组数据，针对可能为新生隐球菌毒力相关的基因设计特异性引物，扩增并测序，通过序列对比分析每个基因在两组微卫星基因型菌株间存在的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms ，SNPs）位点，并对引起差异的蛋白质进行分析和预测。结果在成功测序的11个基因中，除2个基因序列完全相同外，其余9个基因在两组毒力差异明显的基因型菌株间分别存在1～4个规律性SNPs，其中，有2个基因中存在非同义SNPs（ non-synonymous SNPs ，nsSNPs ），这2个基因的编码产物分别为沉默信息调节因子2家族成员HST302和UV切除修复蛋白RAD23。另外，在对RAD23蛋白的系统发育分析发现，与真菌界的其他门类相比，在担子菌纲的多数RAD23蛋白与人类的同源基因亲缘关系更近。结论本研究发现了新生隐球菌两种毒力差异明显的微卫星基因型菌株间具有重要功能的两个差异基因（ Rad23和Hst302），且经预测nsSNPs对蛋白结构和功能均有一定影响，而蛋白的具体功能有待通过各项试验进一步深入研究。; 陈玉如赵亮金方李小玲曹煜康颖倩; 关键词：毒力

贵州省土壤中需氧放线菌的分离鉴定及其抗菌活性的测定: 目的:分离并鉴定贵州地区土壤中的需氧放线菌,了解其种群分布特点及抗菌活性。方法1:采集贵州不同地区的土壤标本进行需氧放线菌的分离纯化,通过菌株的形态、生理生化特征及16s rDNA对其进行鉴定2:利用纸片法测定菌株发酵液...; 金方牟丽丽王颜颜刘涛华吕倩陈玉如康颖倩; 关键词：土壤放线菌抗菌活性链霉菌

贵州省土壤中需氧放线菌的分离鉴定及其抗菌活性的测定: 目的:分离并鉴定贵州地区土壤中的需氧放线菌,了解其种群分布特点及抗菌活性。方法1:采集贵州不同地区的土壤标本进行需氧放线菌的分离纯化,通过菌株的形态、生理生化特征及16s rDNA对其进行鉴定2:利用纸片法测定菌株发酵液...; 金方牟丽丽王颜颜刘涛华吕倩陈玉如康颖倩; 关键词：土壤放线菌抗菌活性链霉菌; 文献传递

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国家自然科学基金(3106000631260029)

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