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Structural Variation of the Superintegron in the Toxigenic Vibrio cholerae O1 El Tor被引量：2: 2011年; 在 Vibrio cholerae 理解 superintegron (SI ) 的基因结构和变化的目的在第七霍乱孤立流行。方法聚合酶链反应扫描并且碎片定序被使用。六十 toxigenic V。在 1961 和 2008 之间孤立的 cholerae O1 El 岩山紧张被分析。一些变化被发现的结果，包括的插入，代替，和删除。大多数删除可能是在 V 之间的再结合的结果。cholerae 重复序列。一起聚类的变化的多数。而在紧张的 SI 盒子变化在 1990 年代孤立并且在以后，在 1960 年代和 1970 年代孤立的紧张的 SI 显示出更多的差异更低，与 24 kb 签名顺序删除。这在 1990 年代并且在以后在流行病期间在主人显示占优势的 SI。插入盒子从另外的 V 的 SI 建议了动员。cholerae serogroups 和 Vibrio mimicus。学习揭示了那的结论 SI 的结构的变化在在不同十年在流行病孤立的紧张是明显的，而分叉在这些 El 基于 SI 的 syntenic 结构，岩山拉紧。另外，持续盒子在第七霍乱 pandemics 期间流动在主人紧张的 SI 被显示。; GAO Yan PANG Bo WANG Hai Yin ZHOU Hai Jian CUI Zhi Gang KAN Biao; 关键词：霍乱弧菌产毒拟态弧菌厄尔尼诺

霍乱弧菌N16961超级整合子重复序列及基因盒分析: 2010年; 目的:确定O1群El Tor型霍乱弧菌N16961超级整合子(SI)中霍乱弧菌重复序列(VCR)的序列特点,以及VCR和基因盒的数量及位置。方法:用局部序列比对软件BLAST将VCR参考序列与霍乱弧菌N16961的Ⅱ号染色体进行比对,用Artemis Comparison Tool查看比对结果获得比对区域的位置信息,并采用perl语言脚本获得霍乱弧菌N16961的Ⅱ号染色体VCR相应区域的序列;用全局比对软件Clustal W将上一步获得的所有VCR序列进行多序列比对,采用perl语言脚本处理比对结果获得一致性序列;用MEGA4.0软件查看多序列比对结果,并采用perl语言脚本计算各位置变异频率,据此分析霍乱弧菌N16961的Ⅱ号染色体上VCR和基因盒的特点。结果:在N16961的超级整合子中有158个VCR,其核苷酸长度为117～124 bp;其一致性序列有126个核苷酸,其中37个为保守核苷酸位点,89个为可变核苷酸位点;139个VCR与相邻的VCR之间至少有1个基因,19个VCR相互之间没有任何基因;N16961的SI中共存在146个基因盒,基因盒大小为390～5924 bp不等,每个基因盒中整合的基因数目为1～9个不等。结论:建立了SI中VCR和基因盒的分析流程,分析了SI中VCR的保守及变异位点,明确了霍乱弧菌N16961的SI中VCR和基因盒的信息,为霍乱弧菌和其他细菌中SI的研究提供了分析基础。; 高艳逄波杜鹏程王海印阚飙; 关键词：霍乱弧菌基因盒

霍乱弧菌基因表达分析中内参基因的选择被引量：4: 2014年; 目的确定不同实验条件下基因表达分析中的稳定内参基因。方法以霍乱弧菌O1群El Tor菌株为研究对象,利用qRT-PCR方法比较不同pH值(pH 8.0、pH 5.5)以及不同温度(37℃、30℃)等多种生理、外界环境模拟培养条件下,thyA、recA、rpoA、gyrB、16SrRNA以及VCA0862 6个候选内参基因的表达水平,利用geNorm软件评价其稳定性。结果不同培养条件下,6个候选内参基因表达水平存在差异。不同pH值条件下最佳基因是recA;不同温度条件下最佳基因是gyrB;不同pH值及温度综合评价时,最佳基因是recA。结论本研究评价和提出了细菌基因表达分析中内参基因筛选的重要性,不同实验条件下最稳定内参基因是不同的,针对不同条件下的基因转录定量分析,应分别对内参基因稳定性进行评价并选择最稳定基因。; 张翠彩逄波蒋秀高阚飙; 关键词：霍乱弧菌 QRT-PCR 内参基因 GENORM

霍乱弧菌对肠道中胆盐胁迫作用的反应调节: 2011年; 作为肠道致病菌,霍乱弧菌必须耐受人体内的胃酸、胆盐、高渗和低氧等胁迫条件,才能在肠道定植、繁殖。胆盐由肝脏合成,在胆囊储存并分泌到肠道。其主要作用是帮助脂肪代谢,并有一定杀菌作用。本文综述了胆盐如何作用于霍乱弧菌,霍乱弧菌如何感受肠道内的胆盐刺激,并采用何种机制来耐受其杀菌作用。; 高艳逄波阚飙; 关键词：霍乱弧菌胆盐

应用SYBR Green Ⅰ荧光PCR快速检测副溶血弧菌及其毒力基因被引量：7: 2012年; 目的利用SYBR Green Ⅰ荧光PCR反应检测副溶血弧菌及其trh和tdh毒力基因。方法根据副溶血弧菌tlh基因设计引物,建立检测副溶血弧菌SYBR Green Ⅰ荧光PCR检测方法,利用33株副溶血弧菌分离株以及22株其他种属细菌进行特异性和灵敏度评价。根据副溶血弧菌trh和tdh毒力基因序列设计引物,建立检测副溶血弧菌毒力基因的单重和双重SYBR Green Ⅰ荧光PCR检测方法,并对这两种方法进行特异性和灵敏度评价。结果本研究中基于tlh基因的荧光PCR检测对全部33株副溶血弧菌检测为阳性,检测下限为5×101拷贝/μl,而22株其他种属细菌均为阴性。毒力基因trh和tdh均能特异性检测,其单重荧光PCR检测下限为5×101拷贝/μl,双重荧光PCR检测下限为5×102拷贝/μl。结论本研究建立了tlh作为靶基因检测副溶血弧菌的单重SYBR Green Ⅰ荧光PCR检测方法和同时检测副溶血弧菌trh和tdh毒力基因的双重SYBR Green Ⅰ荧光PCR检测方法,简化了毒力基因检测,有良好的实际应用前景。; 卢昕徐嘉良阚飙逄波; 关键词：副溶血弧菌 SYBR

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国家自然科学基金(30800987)

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